Protein–RNA interactions for Protein: P53290

GTR2, GTP-binding protein GTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GTR2P53290 NSR1YGR159C 1245 nt19.99■□□□□ 0.79
GTR2P53290 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.9■□□□□ 0.78
GTR2P53290 NOP1YDL014W 984 nt19.27■□□□□ 0.68
GTR2P53290 MDJ1YFL016C 1536 nt17.94■□□□□ 0.46
GTR2P53290 YKL036CYKL036C 393 nt17.55■□□□□ 0.4
GTR2P53290 SRX1YKL086W 384 nt16.82■□□□□ 0.28
GTR2P53290 Q0297Q0297 156 nt16.78■□□□□ 0.28
GTR2P53290 YJL027CYJL027C 417 nt16.57■□□□□ 0.24
GTR2P53290 YCR051WYCR051W 669 nt15.94■□□□□ 0.14
GTR2P53290 SCS3YGL126W 1143 nt15.83■□□□□ 0.12
GTR2P53290 DBP2YNL112W 1641 nt15.77■□□□□ 0.12
GTR2P53290 YBR190WYBR190W 312 nt15.38■□□□□ 0.05
GTR2P53290 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.34■□□□□ 0.05
GTR2P53290 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.34■□□□□ 0.05
GTR2P53290 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.34■□□□□ 0.05
GTR2P53290 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.34■□□□□ 0.05
GTR2P53290 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.34■□□□□ 0.05
GTR2P53290 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.34■□□□□ 0.05
GTR2P53290 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.34■□□□□ 0.05
GTR2P53290 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.34■□□□□ 0.05
GTR2P53290 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.34■□□□□ 0.05
GTR2P53290 YOL085CYOL085C 342 nt15.2■□□□□ 0.02
GTR2P53290 CCC1YLR220W 969 nt15.19■□□□□ 0.02
GTR2P53290 RPP1BYDL130W 321 nt15.05■□□□□ -0
GTR2P53290 RTC3YHR087W 336 nt15.03■□□□□ -0
GTR2P53290 PKP1YIL042C 1185 nt14.99□□□□□ -0.01
GTR2P53290 RVS167YDR388W 1449 nt14.82□□□□□ -0.04
GTR2P53290 SCJ1YMR214W 1134 nt14.65□□□□□ -0.06
GTR2P53290 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.44□□□□□ -0.1
GTR2P53290 PET122YER153C 765 nt14.4□□□□□ -0.1
GTR2P53290 SHR5YOL110W 714 nt14.23□□□□□ -0.13
GTR2P53290 SCR1SCR1 522 nt14.21□□□□□ -0.13
GTR2P53290 PUT4YOR348C 1884 nt14.12□□□□□ -0.15
GTR2P53290 ATS1YAL020C 1002 nt14.1□□□□□ -0.15
GTR2P53290 YDJ1YNL064C 1230 nt13.98□□□□□ -0.17
GTR2P53290 URN1YPR152C 1398 nt13.97□□□□□ -0.17
GTR2P53290 RRN5YLR141W 1092 nt13.97□□□□□ -0.17
GTR2P53290 DEP1YAL013W 1218 nt13.9□□□□□ -0.18
GTR2P53290 OPI9YLR338W 858 nt13.82□□□□□ -0.2
GTR2P53290 ARE1YCR048W 1833 nt13.8□□□□□ -0.2
GTR2P53290 SAH1YER043C 1350 nt13.79□□□□□ -0.2
GTR2P53290 RPN10YHR200W 807 nt13.74□□□□□ -0.21
GTR2P53290 GAR1YHR089C 618 nt13.7□□□□□ -0.22
GTR2P53290 SSA3YBL075C 1950 nt13.7□□□□□ -0.22
GTR2P53290 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.69□□□□□ -0.22
GTR2P53290 POA1YBR022W 534 nt13.68□□□□□ -0.22
GTR2P53290 YNL208WYNL208W 600 nt13.67□□□□□ -0.22
GTR2P53290 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.63□□□□□ -0.23
GTR2P53290 RSB1YOR049C 1065 nt13.62□□□□□ -0.23
GTR2P53290 PUN1YLR414C 792 nt13.43□□□□□ -0.26
GTR2P53290 BSC6YOL137W 1494 nt13.42□□□□□ -0.26
GTR2P53290 YJR018WYJR018W 363 nt13.33□□□□□ -0.28
GTR2P53290 BUD23YCR047C 828 nt13.31□□□□□ -0.28
GTR2P53290 PTC2YER089C 1395 nt13.3□□□□□ -0.28
GTR2P53290 TIR1YER011W 765 nt13.25□□□□□ -0.29
GTR2P53290 NAB2YGL122C 1578 nt13.15□□□□□ -0.3
GTR2P53290 SSA1YAL005C 1929 nt13.13□□□□□ -0.31
GTR2P53290 PST2YDR032C 597 nt13.1□□□□□ -0.31
GTR2P53290 YJR120WYJR120W 351 nt13.04□□□□□ -0.32
GTR2P53290 RPP2BYDR382W 333 nt13.01□□□□□ -0.33
GTR2P53290 DAL1YIR027C 1383 nt12.94□□□□□ -0.34
GTR2P53290 FIS1YIL065C 468 nt12.92□□□□□ -0.34
GTR2P53290 SPT5YML010W 3192 nt12.92□□□□□ -0.34
GTR2P53290 FPR4YLR449W 1179 nt12.91□□□□□ -0.34
GTR2P53290 INM2YDR287W 879 nt12.89□□□□□ -0.35
GTR2P53290 SRB2YHR041C 633 nt12.84□□□□□ -0.35
GTR2P53290 PHO4YFR034C 939 nt12.81□□□□□ -0.36
GTR2P53290 YBL100CYBL100C 315 nt12.72□□□□□ -0.37
GTR2P53290 BDH2YAL061W 1254 nt12.69□□□□□ -0.38
GTR2P53290 YPS1YLR120C 1710 nt12.64□□□□□ -0.39
GTR2P53290 MEP2YNL142W 1500 nt12.62□□□□□ -0.39
GTR2P53290 WWM1YFL010C 636 nt12.62□□□□□ -0.39
GTR2P53290 SHU1YHL006C 453 nt12.61□□□□□ -0.39
GTR2P53290 SSA4YER103W 1929 nt12.58□□□□□ -0.4
GTR2P53290 FUN26YAL022C 1554 nt12.56□□□□□ -0.4
GTR2P53290 YDR095CYDR095C 411 nt12.53□□□□□ -0.4
GTR2P53290 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.53□□□□□ -0.4
GTR2P53290 TRM9YML014W 840 nt12.51□□□□□ -0.41
GTR2P53290 YGR021WYGR021W 873 nt12.49□□□□□ -0.41
GTR2P53290 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.49□□□□□ -0.41
GTR2P53290 LSM3YLR438C-A 270 nt12.49□□□□□ -0.41
GTR2P53290 YKL097CYKL097C 411 nt12.47□□□□□ -0.41
GTR2P53290 ALF1YNL148C 765 nt12.45□□□□□ -0.42
GTR2P53290 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.43□□□□□ -0.42
GTR2P53290 HOM6YJR139C 1080 nt12.42□□□□□ -0.42
GTR2P53290 DCW1YKL046C 1350 nt12.41□□□□□ -0.42
GTR2P53290 CCT6YDR188W 1641 nt12.37□□□□□ -0.43
GTR2P53290 MNP1YGL068W 585 nt12.32□□□□□ -0.44
GTR2P53290 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.31□□□□□ -0.44
GTR2P53290 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.31□□□□□ -0.44
GTR2P53290 RPP2AYOL039W 321 nt12.3□□□□□ -0.44
GTR2P53290 EMI2YDR516C 1503 nt12.27□□□□□ -0.45
GTR2P53290 PTP1YDL230W 1008 nt12.26□□□□□ -0.45
GTR2P53290 SIS1YNL007C 1059 nt12.25□□□□□ -0.45
GTR2P53290 RKM5YLR137W 1104 nt12.24□□□□□ -0.45
GTR2P53290 YMR090WYMR090W 684 nt12.22□□□□□ -0.45
GTR2P53290 CAC2YML102W 1407 nt12.2□□□□□ -0.46
GTR2P53290 YDL221WYDL221W 552 nt12.15□□□□□ -0.46
GTR2P53290 YBR220CYBR220C 1683 nt12.09□□□□□ -0.47
GTR2P53290 BDF1YLR399C 2061 nt12.09□□□□□ -0.47
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