Protein–RNA interactions for Protein: Q12481

RRP36, rRNA biogenesis protein RRP36, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP36Q12481 NSR1YGR159C 1245 nt19.98■□□□□ 0.79
RRP36Q12481 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.69■□□□□ 0.74
RRP36Q12481 NOP1YDL014W 984 nt19.04■□□□□ 0.64
RRP36Q12481 MDJ1YFL016C 1536 nt18.08■□□□□ 0.49
RRP36Q12481 YKL036CYKL036C 393 nt17.28■□□□□ 0.36
RRP36Q12481 YJL027CYJL027C 417 nt16.72■□□□□ 0.27
RRP36Q12481 SRX1YKL086W 384 nt16.57■□□□□ 0.24
RRP36Q12481 Q0297Q0297 156 nt16.46■□□□□ 0.23
RRP36Q12481 DBP2YNL112W 1641 nt15.79■□□□□ 0.12
RRP36Q12481 YCR051WYCR051W 669 nt15.72■□□□□ 0.11
RRP36Q12481 SCS3YGL126W 1143 nt15.64■□□□□ 0.09
RRP36Q12481 YBR190WYBR190W 312 nt15.6■□□□□ 0.09
RRP36Q12481 RTC3YHR087W 336 nt15.27■□□□□ 0.04
RRP36Q12481 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.2■□□□□ 0.02
RRP36Q12481 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.2■□□□□ 0.02
RRP36Q12481 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.2■□□□□ 0.02
RRP36Q12481 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.2■□□□□ 0.02
RRP36Q12481 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.2■□□□□ 0.02
RRP36Q12481 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.2■□□□□ 0.02
RRP36Q12481 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.2■□□□□ 0.02
RRP36Q12481 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.2■□□□□ 0.02
RRP36Q12481 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.2■□□□□ 0.02
RRP36Q12481 CCC1YLR220W 969 nt15.11■□□□□ 0.01
RRP36Q12481 YOL085CYOL085C 342 nt14.92□□□□□ -0.02
RRP36Q12481 RVS167YDR388W 1449 nt14.89□□□□□ -0.03
RRP36Q12481 RPP1BYDL130W 321 nt14.78□□□□□ -0.04
RRP36Q12481 PKP1YIL042C 1185 nt14.64□□□□□ -0.07
RRP36Q12481 SCJ1YMR214W 1134 nt14.56□□□□□ -0.08
RRP36Q12481 SSA3YBL075C 1950 nt14.52□□□□□ -0.09
RRP36Q12481 PUT4YOR348C 1884 nt14.44□□□□□ -0.1
RRP36Q12481 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.27□□□□□ -0.13
RRP36Q12481 SHR5YOL110W 714 nt14.21□□□□□ -0.13
RRP36Q12481 PET122YER153C 765 nt14.13□□□□□ -0.15
RRP36Q12481 URN1YPR152C 1398 nt14.09□□□□□ -0.15
RRP36Q12481 ARE1YCR048W 1833 nt14.04□□□□□ -0.16
RRP36Q12481 ATS1YAL020C 1002 nt14□□□□□ -0.17
RRP36Q12481 POA1YBR022W 534 nt13.99□□□□□ -0.17
RRP36Q12481 SAH1YER043C 1350 nt13.97□□□□□ -0.17
RRP36Q12481 SCR1SCR1 522 nt13.97□□□□□ -0.17
RRP36Q12481 OPI9YLR338W 858 nt13.96□□□□□ -0.17
RRP36Q12481 DEP1YAL013W 1218 nt13.94□□□□□ -0.18
RRP36Q12481 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.88□□□□□ -0.19
RRP36Q12481 RPN10YHR200W 807 nt13.83□□□□□ -0.2
RRP36Q12481 YDJ1YNL064C 1230 nt13.81□□□□□ -0.2
RRP36Q12481 BSC6YOL137W 1494 nt13.74□□□□□ -0.21
RRP36Q12481 YNL208WYNL208W 600 nt13.71□□□□□ -0.21
RRP36Q12481 RRN5YLR141W 1092 nt13.7□□□□□ -0.22
RRP36Q12481 GAR1YHR089C 618 nt13.58□□□□□ -0.24
RRP36Q12481 PUN1YLR414C 792 nt13.58□□□□□ -0.24
RRP36Q12481 BUD23YCR047C 828 nt13.57□□□□□ -0.24
RRP36Q12481 PTC2YER089C 1395 nt13.47□□□□□ -0.25
RRP36Q12481 YJR018WYJR018W 363 nt13.42□□□□□ -0.26
RRP36Q12481 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.41□□□□□ -0.26
RRP36Q12481 NAB2YGL122C 1578 nt13.38□□□□□ -0.27
RRP36Q12481 SPT5YML010W 3192 nt13.35□□□□□ -0.27
RRP36Q12481 RSB1YOR049C 1065 nt13.35□□□□□ -0.27
RRP36Q12481 SSA4YER103W 1929 nt13.14□□□□□ -0.31
RRP36Q12481 TIR1YER011W 765 nt13.14□□□□□ -0.31
RRP36Q12481 DAL1YIR027C 1383 nt13.09□□□□□ -0.31
RRP36Q12481 FPR4YLR449W 1179 nt13.09□□□□□ -0.31
RRP36Q12481 RPP2BYDR382W 333 nt13.08□□□□□ -0.32
RRP36Q12481 FIS1YIL065C 468 nt13.04□□□□□ -0.32
RRP36Q12481 SSA1YAL005C 1929 nt13.03□□□□□ -0.32
RRP36Q12481 INM2YDR287W 879 nt13.03□□□□□ -0.32
RRP36Q12481 YJR120WYJR120W 351 nt12.99□□□□□ -0.33
RRP36Q12481 PST2YDR032C 597 nt12.96□□□□□ -0.33
RRP36Q12481 MEP2YNL142W 1500 nt12.96□□□□□ -0.33
RRP36Q12481 PHO4YFR034C 939 nt12.95□□□□□ -0.34
RRP36Q12481 YPS1YLR120C 1710 nt12.85□□□□□ -0.35
RRP36Q12481 YBL100CYBL100C 315 nt12.8□□□□□ -0.36
RRP36Q12481 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.79□□□□□ -0.36
RRP36Q12481 DCW1YKL046C 1350 nt12.7□□□□□ -0.38
RRP36Q12481 BDH2YAL061W 1254 nt12.69□□□□□ -0.38
RRP36Q12481 YDR095CYDR095C 411 nt12.68□□□□□ -0.38
RRP36Q12481 SRB2YHR041C 633 nt12.64□□□□□ -0.39
RRP36Q12481 BDF1YLR399C 2061 nt12.64□□□□□ -0.39
RRP36Q12481 FUN26YAL022C 1554 nt12.63□□□□□ -0.39
RRP36Q12481 YMR090WYMR090W 684 nt12.62□□□□□ -0.39
RRP36Q12481 ALF1YNL148C 765 nt12.59□□□□□ -0.39
RRP36Q12481 TRM9YML014W 840 nt12.58□□□□□ -0.4
RRP36Q12481 EMI2YDR516C 1503 nt12.57□□□□□ -0.4
RRP36Q12481 Q0182Q0182 405 nt12.52□□□□□ -0.41
RRP36Q12481 RPP2AYOL039W 321 nt12.49□□□□□ -0.41
RRP36Q12481 WWM1YFL010C 636 nt12.47□□□□□ -0.41
RRP36Q12481 YKL097CYKL097C 411 nt12.47□□□□□ -0.41
RRP36Q12481 LSM3YLR438C-A 270 nt12.47□□□□□ -0.41
RRP36Q12481 TAT1YBR069C 1860 nt12.46□□□□□ -0.41
RRP36Q12481 YBR220CYBR220C 1683 nt12.46□□□□□ -0.41
RRP36Q12481 YDL221WYDL221W 552 nt12.44□□□□□ -0.42
RRP36Q12481 CCT6YDR188W 1641 nt12.41□□□□□ -0.42
RRP36Q12481 PTP1YDL230W 1008 nt12.41□□□□□ -0.42
RRP36Q12481 SHU1YHL006C 453 nt12.41□□□□□ -0.42
RRP36Q12481 CAC2YML102W 1407 nt12.4□□□□□ -0.42
RRP36Q12481 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.4□□□□□ -0.42
RRP36Q12481 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.4□□□□□ -0.42
RRP36Q12481 SDH1YKL148C 1923 nt12.37□□□□□ -0.43
RRP36Q12481 FPS1YLL043W 2010 nt12.37□□□□□ -0.43
RRP36Q12481 SIS1YNL007C 1059 nt12.35□□□□□ -0.43
RRP36Q12481 YGR021WYGR021W 873 nt12.31□□□□□ -0.44
RRP36Q12481 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.3□□□□□ -0.44
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