Protein–RNA interactions for Protein: Q06058

SEI1, Seipin, yeastyeast

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEI1Q06058 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.71■□□□□ 0.59
SEI1Q06058 NSR1YGR159C 1245 nt18.52■□□□□ 0.56
SEI1Q06058 NOP1YDL014W 984 nt18.17■□□□□ 0.5
SEI1Q06058 YKL036CYKL036C 393 nt16.85■□□□□ 0.29
SEI1Q06058 MDJ1YFL016C 1536 nt16.43■□□□□ 0.22
SEI1Q06058 Q0297Q0297 156 nt15.97■□□□□ 0.15
SEI1Q06058 SRX1YKL086W 384 nt15.91■□□□□ 0.14
SEI1Q06058 YJL027CYJL027C 417 nt15.73■□□□□ 0.11
SEI1Q06058 SCS3YGL126W 1143 nt15.39■□□□□ 0.05
SEI1Q06058 YCR051WYCR051W 669 nt15.07■□□□□ 0
SEI1Q06058 YOL085CYOL085C 342 nt14.6□□□□□ -0.07
SEI1Q06058 DBP2YNL112W 1641 nt14.58□□□□□ -0.08
SEI1Q06058 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.39□□□□□ -0.11
SEI1Q06058 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.39□□□□□ -0.11
SEI1Q06058 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.39□□□□□ -0.11
SEI1Q06058 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.39□□□□□ -0.11
SEI1Q06058 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.39□□□□□ -0.11
SEI1Q06058 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.39□□□□□ -0.11
SEI1Q06058 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.39□□□□□ -0.11
SEI1Q06058 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.39□□□□□ -0.11
SEI1Q06058 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.39□□□□□ -0.11
SEI1Q06058 PKP1YIL042C 1185 nt14.36□□□□□ -0.11
SEI1Q06058 RPP1BYDL130W 321 nt14.32□□□□□ -0.12
SEI1Q06058 CCC1YLR220W 969 nt14.18□□□□□ -0.14
SEI1Q06058 YBR190WYBR190W 312 nt13.97□□□□□ -0.17
SEI1Q06058 ATS1YAL020C 1002 nt13.76□□□□□ -0.21
SEI1Q06058 PET122YER153C 765 nt13.7□□□□□ -0.22
SEI1Q06058 SCJ1YMR214W 1134 nt13.69□□□□□ -0.22
SEI1Q06058 RVS167YDR388W 1449 nt13.66□□□□□ -0.22
SEI1Q06058 RTC3YHR087W 336 nt13.63□□□□□ -0.23
SEI1Q06058 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.6□□□□□ -0.23
SEI1Q06058 SCR1SCR1 522 nt13.51□□□□□ -0.25
SEI1Q06058 RRN5YLR141W 1092 nt13.27□□□□□ -0.29
SEI1Q06058 SHR5YOL110W 714 nt13.23□□□□□ -0.29
SEI1Q06058 YDJ1YNL064C 1230 nt13.16□□□□□ -0.3
SEI1Q06058 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.03□□□□□ -0.32
SEI1Q06058 RSB1YOR049C 1065 nt13.02□□□□□ -0.33
SEI1Q06058 GAR1YHR089C 618 nt12.84□□□□□ -0.35
SEI1Q06058 DEP1YAL013W 1218 nt12.82□□□□□ -0.36
SEI1Q06058 URN1YPR152C 1398 nt12.81□□□□□ -0.36
SEI1Q06058 PST2YDR032C 597 nt12.74□□□□□ -0.37
SEI1Q06058 PUT4YOR348C 1884 nt12.68□□□□□ -0.38
SEI1Q06058 OPI9YLR338W 858 nt12.63□□□□□ -0.39
SEI1Q06058 YNL208WYNL208W 600 nt12.63□□□□□ -0.39
SEI1Q06058 RPN10YHR200W 807 nt12.62□□□□□ -0.39
SEI1Q06058 SSA3YBL075C 1950 nt12.59□□□□□ -0.39
SEI1Q06058 SAH1YER043C 1350 nt12.53□□□□□ -0.4
SEI1Q06058 ARE1YCR048W 1833 nt12.46□□□□□ -0.41
SEI1Q06058 TIR1YER011W 765 nt12.42□□□□□ -0.42
SEI1Q06058 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.3□□□□□ -0.44
SEI1Q06058 SSA1YAL005C 1929 nt12.27□□□□□ -0.44
SEI1Q06058 YKL097CYKL097C 411 nt12.26□□□□□ -0.45
SEI1Q06058 PUN1YLR414C 792 nt12.25□□□□□ -0.45
SEI1Q06058 POA1YBR022W 534 nt12.25□□□□□ -0.45
SEI1Q06058 SHU1YHL006C 453 nt12.22□□□□□ -0.45
SEI1Q06058 YJR018WYJR018W 363 nt12.22□□□□□ -0.45
SEI1Q06058 SRB2YHR041C 633 nt12.12□□□□□ -0.47
SEI1Q06058 YJR120WYJR120W 351 nt12.12□□□□□ -0.47
SEI1Q06058 PTC2YER089C 1395 nt12.08□□□□□ -0.48
SEI1Q06058 BSC6YOL137W 1494 nt12□□□□□ -0.49
SEI1Q06058 BUD23YCR047C 828 nt11.98□□□□□ -0.49
SEI1Q06058 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.98□□□□□ -0.49
SEI1Q06058 RPP2BYDR382W 333 nt11.97□□□□□ -0.49
SEI1Q06058 NAB2YGL122C 1578 nt11.92□□□□□ -0.5
SEI1Q06058 WWM1YFL010C 636 nt11.88□□□□□ -0.51
SEI1Q06058 YGR021WYGR021W 873 nt11.84□□□□□ -0.51
SEI1Q06058 FIS1YIL065C 468 nt11.83□□□□□ -0.52
SEI1Q06058 HOM6YJR139C 1080 nt11.82□□□□□ -0.52
SEI1Q06058 MNP1YGL068W 585 nt11.79□□□□□ -0.52
SEI1Q06058 YOR139CYOR139C 393 nt11.79□□□□□ -0.52
SEI1Q06058 DAL1YIR027C 1383 nt11.79□□□□□ -0.52
SEI1Q06058 BDH2YAL061W 1254 nt11.77□□□□□ -0.53
SEI1Q06058 INM2YDR287W 879 nt11.76□□□□□ -0.53
SEI1Q06058 FPR4YLR449W 1179 nt11.73□□□□□ -0.53
SEI1Q06058 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.7□□□□□ -0.54
SEI1Q06058 PHO4YFR034C 939 nt11.7□□□□□ -0.54
SEI1Q06058 YBL100CYBL100C 315 nt11.69□□□□□ -0.54
SEI1Q06058 RKM5YLR137W 1104 nt11.64□□□□□ -0.55
SEI1Q06058 NPL3YDR432W 1245 nt11.63□□□□□ -0.55
SEI1Q06058 LSM3YLR438C-A 270 nt11.61□□□□□ -0.55
SEI1Q06058 YOL037CYOL037C 354 nt11.6□□□□□ -0.55
SEI1Q06058 FUN26YAL022C 1554 nt11.55□□□□□ -0.56
SEI1Q06058 TRM9YML014W 840 nt11.5□□□□□ -0.57
SEI1Q06058 CCT6YDR188W 1641 nt11.44□□□□□ -0.58
SEI1Q06058 YPS1YLR120C 1710 nt11.43□□□□□ -0.58
SEI1Q06058 SPT5YML010W 3192 nt11.41□□□□□ -0.58
SEI1Q06058 YDR095CYDR095C 411 nt11.39□□□□□ -0.59
SEI1Q06058 ALF1YNL148C 765 nt11.35□□□□□ -0.59
SEI1Q06058 YLR281CYLR281C 468 nt11.31□□□□□ -0.6
SEI1Q06058 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.3□□□□□ -0.6
SEI1Q06058 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.3□□□□□ -0.6
SEI1Q06058 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.3□□□□□ -0.6
SEI1Q06058 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.3□□□□□ -0.6
SEI1Q06058 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.3□□□□□ -0.6
SEI1Q06058 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.29□□□□□ -0.6
SEI1Q06058 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.29□□□□□ -0.6
SEI1Q06058 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.28□□□□□ -0.6
SEI1Q06058 WHI5YOR083W 888 nt11.26□□□□□ -0.61
SEI1Q06058 MEP2YNL142W 1500 nt11.25□□□□□ -0.61
SEI1Q06058 PUS2YGL063W 1113 nt11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms