RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	SKS1	Q12505	502 aa		4	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	SRN2	Q99176	213 aa		4	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	COX1	P00401	534 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	KIN28	P06242	306 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	YCR101C	P25607	182 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	SNC2	P33328	115 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	MRPL4	P36517	319 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	MRPL15	P36523	253 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	CBP4	P37267	147 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	POP8	P38208	133 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	PAU15	P40585	124 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	NIF3	P53081	288 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	COG7	P53195	279 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	APJ1	P53940	528 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	MTQ1	P53944	314 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	RSM10	Q03201	203 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	SWT1	Q12104	458 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	YLR118C	Q12354	227 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	PEX11	Q12462	236 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	COX19	Q3E731	98 aa		3.99	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	SCEI	P03882	235 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	CHO1	P08456	276 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	PPH21	P23594	369 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	PBN1	P25580	416 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	CSE2	P33308	149 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	SEF1	P34228	1148 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	MRPL28	P36527	147 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	SHG1	P38337	142 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	DBP8	P38719	431 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	SPC25	P40014	221 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	YJL068C	P40363	299 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	FLX1	P40464	311 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	AGE2	P40529	298 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	HXT14	P42833	540 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	YGL101W	P53144	215 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	CYT2	Q00873	224 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	MSC1	Q03104	513 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	SPC19	Q03954	165 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	BNA5	Q05979	453 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	MCH4	Q08268	501 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	RDR1	Q08904	546 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	COA6	Q3E846	104 aa		3.98	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	SPS4	P09937	338 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	ERG8	P24521	451 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	ADH7	P25377	361 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	BOS1	P25385	244 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	YCR100C	P25606	316 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.97	□□□□□ -1.77	not detected
POP4	YBR257W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	LAC1	P28496	418 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	YEF1	P32622	495 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	FMT1	P32785	401 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	INM1	P38710	295 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	TRR2	P38816	342 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	SUR2	P38992	349 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	PSD1	P39006	500 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	PHO90	P39535	881 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	VPS52	P39904	641 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	ICE2	P40499	491 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	YIL060W	P40519	144 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	OTU1	P43558	301 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	AVT4	P50944	713 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	YGR042W	P53227	271 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	YDC1	Q02896	317 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	PIR1	Q03178	341 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	ATC1	Q04005	294 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	AKR2	Q12013	749 aa		3.97	□□□□□ -1.77
POP4	YBR257W	AGC1	Q12482	902 aa		3.97	□□□□□ -1.77

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