Protein–RNA interactions for Protein: P53081

NIF3, NGG1-interacting factor 3, yeastyeast

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIF3P53081 NSR1YGR159C 1245 nt17.11■□□□□ 0.33
NIF3P53081 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.86■□□□□ 0.29
NIF3P53081 NOP1YDL014W 984 nt16.16■□□□□ 0.18
NIF3P53081 MDJ1YFL016C 1536 nt15.69■□□□□ 0.1
NIF3P53081 YKL036CYKL036C 393 nt14.47□□□□□ -0.09
NIF3P53081 YJL027CYJL027C 417 nt14.43□□□□□ -0.1
NIF3P53081 SRX1YKL086W 384 nt14.11□□□□□ -0.15
NIF3P53081 Q0297Q0297 156 nt13.98□□□□□ -0.17
NIF3P53081 DBP2YNL112W 1641 nt13.65□□□□□ -0.22
NIF3P53081 YBR190WYBR190W 312 nt13.47□□□□□ -0.25
NIF3P53081 YCR051WYCR051W 669 nt13.38□□□□□ -0.27
NIF3P53081 RTC3YHR087W 336 nt13.18□□□□□ -0.3
NIF3P53081 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.05□□□□□ -0.32
NIF3P53081 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.05□□□□□ -0.32
NIF3P53081 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.05□□□□□ -0.32
NIF3P53081 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.05□□□□□ -0.32
NIF3P53081 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.05□□□□□ -0.32
NIF3P53081 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.05□□□□□ -0.32
NIF3P53081 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.05□□□□□ -0.32
NIF3P53081 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.05□□□□□ -0.32
NIF3P53081 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.05□□□□□ -0.32
NIF3P53081 CCC1YLR220W 969 nt12.94□□□□□ -0.34
NIF3P53081 SCS3YGL126W 1143 nt12.93□□□□□ -0.34
NIF3P53081 SSA3YBL075C 1950 nt12.91□□□□□ -0.34
NIF3P53081 RVS167YDR388W 1449 nt12.76□□□□□ -0.37
NIF3P53081 SCJ1YMR214W 1134 nt12.61□□□□□ -0.39
NIF3P53081 PUT4YOR348C 1884 nt12.59□□□□□ -0.39
NIF3P53081 RPP1BYDL130W 321 nt12.55□□□□□ -0.4
NIF3P53081 YOL085CYOL085C 342 nt12.54□□□□□ -0.4
NIF3P53081 PKP1YIL042C 1185 nt12.44□□□□□ -0.42
NIF3P53081 ARE1YCR048W 1833 nt12.23□□□□□ -0.45
NIF3P53081 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.19□□□□□ -0.46
NIF3P53081 SHR5YOL110W 714 nt12.19□□□□□ -0.46
NIF3P53081 POA1YBR022W 534 nt12.18□□□□□ -0.46
NIF3P53081 URN1YPR152C 1398 nt12.16□□□□□ -0.46
NIF3P53081 SAH1YER043C 1350 nt12.12□□□□□ -0.47
NIF3P53081 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.11□□□□□ -0.47
NIF3P53081 PET122YER153C 765 nt12.07□□□□□ -0.48
NIF3P53081 OPI9YLR338W 858 nt12.06□□□□□ -0.48
NIF3P53081 DEP1YAL013W 1218 nt12.03□□□□□ -0.48
NIF3P53081 BSC6YOL137W 1494 nt12.02□□□□□ -0.49
NIF3P53081 RPN10YHR200W 807 nt11.86□□□□□ -0.51
NIF3P53081 SCR1SCR1 522 nt11.8□□□□□ -0.52
NIF3P53081 BUD23YCR047C 828 nt11.79□□□□□ -0.52
NIF3P53081 YDJ1YNL064C 1230 nt11.79□□□□□ -0.52
NIF3P53081 YNL208WYNL208W 600 nt11.76□□□□□ -0.53
NIF3P53081 SPT5YML010W 3192 nt11.74□□□□□ -0.53
NIF3P53081 PUN1YLR414C 792 nt11.72□□□□□ -0.53
NIF3P53081 PTC2YER089C 1395 nt11.67□□□□□ -0.54
NIF3P53081 RRN5YLR141W 1092 nt11.66□□□□□ -0.54
NIF3P53081 GAR1YHR089C 618 nt11.63□□□□□ -0.55
NIF3P53081 SSA4YER103W 1929 nt11.6□□□□□ -0.55
NIF3P53081 YJR018WYJR018W 363 nt11.56□□□□□ -0.56
NIF3P53081 NAB2YGL122C 1578 nt11.55□□□□□ -0.56
NIF3P53081 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.42□□□□□ -0.58
NIF3P53081 ATS1YAL020C 1002 nt11.41□□□□□ -0.58
NIF3P53081 FIS1YIL065C 468 nt11.37□□□□□ -0.59
NIF3P53081 DAL1YIR027C 1383 nt11.32□□□□□ -0.6
NIF3P53081 FPR4YLR449W 1179 nt11.32□□□□□ -0.6
NIF3P53081 MEP2YNL142W 1500 nt11.31□□□□□ -0.6
NIF3P53081 RSB1YOR049C 1065 nt11.3□□□□□ -0.6
NIF3P53081 YJR120WYJR120W 351 nt11.28□□□□□ -0.6
NIF3P53081 TIR1YER011W 765 nt11.24□□□□□ -0.61
NIF3P53081 PHO4YFR034C 939 nt11.23□□□□□ -0.61
NIF3P53081 RPP2BYDR382W 333 nt11.21□□□□□ -0.61
NIF3P53081 SSA1YAL005C 1929 nt11.21□□□□□ -0.62
NIF3P53081 INM2YDR287W 879 nt11.19□□□□□ -0.62
NIF3P53081 BDF1YLR399C 2061 nt11.17□□□□□ -0.62
NIF3P53081 YPS1YLR120C 1710 nt11.16□□□□□ -0.62
NIF3P53081 DCW1YKL046C 1350 nt11.14□□□□□ -0.63
NIF3P53081 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.1□□□□□ -0.63
NIF3P53081 YDR095CYDR095C 411 nt11.03□□□□□ -0.64
NIF3P53081 YBL100CYBL100C 315 nt11.03□□□□□ -0.64
NIF3P53081 TAT1YBR069C 1860 nt11.02□□□□□ -0.64
NIF3P53081 EMI2YDR516C 1503 nt10.98□□□□□ -0.65
NIF3P53081 YMR090WYMR090W 684 nt10.94□□□□□ -0.66
NIF3P53081 SRB2YHR041C 633 nt10.93□□□□□ -0.66
NIF3P53081 YBR220CYBR220C 1683 nt10.91□□□□□ -0.66
NIF3P53081 BDH2YAL061W 1254 nt10.89□□□□□ -0.67
NIF3P53081 FUN26YAL022C 1554 nt10.88□□□□□ -0.67
NIF3P53081 YDL221WYDL221W 552 nt10.85□□□□□ -0.67
NIF3P53081 ALF1YNL148C 765 nt10.85□□□□□ -0.67
NIF3P53081 CAC2YML102W 1407 nt10.82□□□□□ -0.68
NIF3P53081 PTP1YDL230W 1008 nt10.81□□□□□ -0.68
NIF3P53081 RPP2AYOL039W 321 nt10.81□□□□□ -0.68
NIF3P53081 SDH1YKL148C 1923 nt10.8□□□□□ -0.68
NIF3P53081 TRM9YML014W 840 nt10.77□□□□□ -0.69
NIF3P53081 WWM1YFL010C 636 nt10.68□□□□□ -0.7
NIF3P53081 PAC11YDR488C 1602 nt10.68□□□□□ -0.7
NIF3P53081 SCC4YER147C 1875 nt10.68□□□□□ -0.7
NIF3P53081 CCT6YDR188W 1641 nt10.67□□□□□ -0.7
NIF3P53081 IRC15YPL017C 1500 nt10.65□□□□□ -0.7
NIF3P53081 SIS1YNL007C 1059 nt10.65□□□□□ -0.7
NIF3P53081 PST2YDR032C 597 nt10.64□□□□□ -0.71
NIF3P53081 LSM3YLR438C-A 270 nt10.64□□□□□ -0.71
NIF3P53081 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.63□□□□□ -0.71
NIF3P53081 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.63□□□□□ -0.71
NIF3P53081 PCH2YBR186W 1695 nt10.61□□□□□ -0.71
NIF3P53081 GIS3YLR094C 1509 nt10.6□□□□□ -0.71
NIF3P53081 SEC11YIR022W 504 nt10.59□□□□□ -0.71
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