Protein–RNA interactions for Protein: Q12462

PEX11, Peroxisomal membrane protein PMP27, yeastyeast

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX11Q12462 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.81■□□□□ 0.92
PEX11Q12462 NSR1YGR159C 1245 nt20.57■□□□□ 0.88
PEX11Q12462 NOP1YDL014W 984 nt20.27■□□□□ 0.84
PEX11Q12462 YKL036CYKL036C 393 nt18.83■□□□□ 0.6
PEX11Q12462 MDJ1YFL016C 1536 nt18.14■□□□□ 0.49
PEX11Q12462 Q0297Q0297 156 nt17.78■□□□□ 0.44
PEX11Q12462 SRX1YKL086W 384 nt17.72■□□□□ 0.43
PEX11Q12462 YJL027CYJL027C 417 nt17.6■□□□□ 0.41
PEX11Q12462 SCS3YGL126W 1143 nt17.19■□□□□ 0.34
PEX11Q12462 YCR051WYCR051W 669 nt16.83■□□□□ 0.28
PEX11Q12462 YOL085CYOL085C 342 nt16.3■□□□□ 0.2
PEX11Q12462 DBP2YNL112W 1641 nt16.11■□□□□ 0.17
PEX11Q12462 PKP1YIL042C 1185 nt16.05■□□□□ 0.16
PEX11Q12462 RPP1BYDL130W 321 nt15.96■□□□□ 0.15
PEX11Q12462 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.94■□□□□ 0.14
PEX11Q12462 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.94■□□□□ 0.14
PEX11Q12462 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.94■□□□□ 0.14
PEX11Q12462 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.94■□□□□ 0.14
PEX11Q12462 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.94■□□□□ 0.14
PEX11Q12462 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.94■□□□□ 0.14
PEX11Q12462 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.94■□□□□ 0.14
PEX11Q12462 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.94■□□□□ 0.14
PEX11Q12462 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.94■□□□□ 0.14
PEX11Q12462 CCC1YLR220W 969 nt15.8■□□□□ 0.12
PEX11Q12462 YBR190WYBR190W 312 nt15.43■□□□□ 0.06
PEX11Q12462 ATS1YAL020C 1002 nt15.41■□□□□ 0.06
PEX11Q12462 SCJ1YMR214W 1134 nt15.37■□□□□ 0.05
PEX11Q12462 PET122YER153C 765 nt15.24■□□□□ 0.03
PEX11Q12462 RVS167YDR388W 1449 nt15.17■□□□□ 0.02
PEX11Q12462 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.13■□□□□ 0.01
PEX11Q12462 SCR1SCR1 522 nt15.12■□□□□ 0.01
PEX11Q12462 RTC3YHR087W 336 nt15.11■□□□□ 0.01
PEX11Q12462 RRN5YLR141W 1092 nt14.82□□□□□ -0.04
PEX11Q12462 SHR5YOL110W 714 nt14.67□□□□□ -0.06
PEX11Q12462 YDJ1YNL064C 1230 nt14.63□□□□□ -0.07
PEX11Q12462 RSB1YOR049C 1065 nt14.55□□□□□ -0.08
PEX11Q12462 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.53□□□□□ -0.08
PEX11Q12462 GAR1YHR089C 618 nt14.3□□□□□ -0.12
PEX11Q12462 PST2YDR032C 597 nt14.26□□□□□ -0.13
PEX11Q12462 DEP1YAL013W 1218 nt14.23□□□□□ -0.13
PEX11Q12462 URN1YPR152C 1398 nt14.2□□□□□ -0.14
PEX11Q12462 YNL208WYNL208W 600 nt14.01□□□□□ -0.17
PEX11Q12462 RPN10YHR200W 807 nt14□□□□□ -0.17
PEX11Q12462 OPI9YLR338W 858 nt13.95□□□□□ -0.18
PEX11Q12462 PUT4YOR348C 1884 nt13.92□□□□□ -0.18
PEX11Q12462 SAH1YER043C 1350 nt13.83□□□□□ -0.19
PEX11Q12462 TIR1YER011W 765 nt13.8□□□□□ -0.2
PEX11Q12462 YKL097CYKL097C 411 nt13.76□□□□□ -0.21
PEX11Q12462 ARE1YCR048W 1833 nt13.71□□□□□ -0.21
PEX11Q12462 SHU1YHL006C 453 nt13.65□□□□□ -0.22
PEX11Q12462 SSA1YAL005C 1929 nt13.62□□□□□ -0.23
PEX11Q12462 YJR018WYJR018W 363 nt13.55□□□□□ -0.24
PEX11Q12462 PUN1YLR414C 792 nt13.54□□□□□ -0.24
PEX11Q12462 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.53□□□□□ -0.24
PEX11Q12462 POA1YBR022W 534 nt13.51□□□□□ -0.25
PEX11Q12462 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.42□□□□□ -0.26
PEX11Q12462 SRB2YHR041C 633 nt13.4□□□□□ -0.26
PEX11Q12462 PTC2YER089C 1395 nt13.36□□□□□ -0.27
PEX11Q12462 YJR120WYJR120W 351 nt13.35□□□□□ -0.27
PEX11Q12462 RPP2BYDR382W 333 nt13.31□□□□□ -0.28
PEX11Q12462 BUD23YCR047C 828 nt13.24□□□□□ -0.29
PEX11Q12462 WWM1YFL010C 636 nt13.22□□□□□ -0.29
PEX11Q12462 YOR139CYOR139C 393 nt13.18□□□□□ -0.3
PEX11Q12462 BSC6YOL137W 1494 nt13.17□□□□□ -0.3
PEX11Q12462 NAB2YGL122C 1578 nt13.17□□□□□ -0.3
PEX11Q12462 YGR021WYGR021W 873 nt13.17□□□□□ -0.3
PEX11Q12462 HOM6YJR139C 1080 nt13.14□□□□□ -0.31
PEX11Q12462 MNP1YGL068W 585 nt13.09□□□□□ -0.31
PEX11Q12462 BDH2YAL061W 1254 nt13.06□□□□□ -0.32
PEX11Q12462 INM2YDR287W 879 nt13.05□□□□□ -0.32
PEX11Q12462 NPL3YDR432W 1245 nt13.05□□□□□ -0.32
PEX11Q12462 DAL1YIR027C 1383 nt13.02□□□□□ -0.33
PEX11Q12462 FPR4YLR449W 1179 nt13.01□□□□□ -0.33
PEX11Q12462 SSA3YBL075C 1950 nt13□□□□□ -0.33
PEX11Q12462 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13□□□□□ -0.33
PEX11Q12462 FIS1YIL065C 468 nt12.98□□□□□ -0.33
PEX11Q12462 RKM5YLR137W 1104 nt12.94□□□□□ -0.34
PEX11Q12462 YBL100CYBL100C 315 nt12.94□□□□□ -0.34
PEX11Q12462 YOL037CYOL037C 354 nt12.92□□□□□ -0.34
PEX11Q12462 LSM3YLR438C-A 270 nt12.91□□□□□ -0.34
PEX11Q12462 PHO4YFR034C 939 nt12.89□□□□□ -0.35
PEX11Q12462 TRM9YML014W 840 nt12.81□□□□□ -0.36
PEX11Q12462 FUN26YAL022C 1554 nt12.8□□□□□ -0.36
PEX11Q12462 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.67□□□□□ -0.38
PEX11Q12462 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.67□□□□□ -0.38
PEX11Q12462 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.67□□□□□ -0.38
PEX11Q12462 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.67□□□□□ -0.38
PEX11Q12462 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.67□□□□□ -0.38
PEX11Q12462 CCT6YDR188W 1641 nt12.66□□□□□ -0.38
PEX11Q12462 YLR281CYLR281C 468 nt12.62□□□□□ -0.39
PEX11Q12462 YPS1YLR120C 1710 nt12.6□□□□□ -0.39
PEX11Q12462 ALF1YNL148C 765 nt12.58□□□□□ -0.4
PEX11Q12462 WHI5YOR083W 888 nt12.57□□□□□ -0.4
PEX11Q12462 PUS2YGL063W 1113 nt12.55□□□□□ -0.4
PEX11Q12462 YDR095CYDR095C 411 nt12.54□□□□□ -0.4
PEX11Q12462 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.54□□□□□ -0.4
PEX11Q12462 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.54□□□□□ -0.4
PEX11Q12462 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.46□□□□□ -0.41
PEX11Q12462 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.45□□□□□ -0.42
PEX11Q12462 SPT5YML010W 3192 nt12.44□□□□□ -0.42
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