RNA–Protein interactions for RNA: YMR322C

SNO4, Transcript of Possible chaperone and cysteine protease, yeast

Gene SNO4, Length 714 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SNO4	YMR322C	CCW14	O13547	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	KIN28	P06242	306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	FAR1	P21268	830 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	MNS1	P32906	549 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	APL3	P38065	1025 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	GOS1	P38736	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	RRG9	P40156	214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	SWP82	P43554	623 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	LOH1	P47055	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	VOA1	P53262	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	SLI1	P53304	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
SNO4	YMR322C	PET191	Q02772	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	MSS11	Q03825	758 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	ELP6	Q04868	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	GAT3	Q07928	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	RRI1	Q12468	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	REP1	P03871	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	DSF1	P0CX08	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	MSI1	P13712	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	OAC1	P32332	324 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	CLG1	P35190	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	YBR285W	P38354	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	IES5	P40060	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	YHC3	P47040	408 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	YJL016W	P47072	561 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	SRL4	Q03085	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	SMP3	Q04174	516 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	FMP42	Q04991	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	MLC2	Q06580	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	CSI2	Q08054	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	MCH4	Q08268	501 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	FRE8	Q12209	686 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	RIB3	Q99258	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	FSH3	Q99369	266 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNO4	YMR322C	RPL39	P04650	51 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	TPK3	P05986	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	PDE2	P06776	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	PHO80	P20052	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	PCL2	P25693	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	YBR096W	P38256	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	CTR2	P38865	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	YRB2	P40517	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	COS10	P52924	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	YIP5	P53108	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	YMD8	Q03697	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	AIM36	Q03798	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	GPI17	Q04080	534 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	ASM4	Q05166	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	SSK1	Q07084	712 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	AIM6	Q07716	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	MSH5	Q12175	901 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	TRM13	Q12383	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	HNM1	P19807	563 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	RPB9	P27999	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	ATF1	P40353	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	HIS6	P40545	261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	MSS2	P40990	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	RET2	P43621	546 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	PEF1	P53238	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	SAY1	P53324	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	DUG3	P53871	357 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	RSM23	Q01163	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	FIN1	Q03898	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	SPC19	Q03954	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	RNH1	Q04740	348 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	MRX8	Q05473	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	FRE5	Q08908	694 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	PCL9	Q12477	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	SCEI	P03882	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNO4	YMR322C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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