Protein–RNA interactions for Protein: Q12468

RRI1, COP9 signalosome complex subunit 5, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRI1Q12468 NSR1YGR159C 1245 nt17.94■□□□□ 0.46
RRI1Q12468 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.9■□□□□ 0.46
RRI1Q12468 NOP1YDL014W 984 nt17.44■□□□□ 0.38
RRI1Q12468 MDJ1YFL016C 1536 nt15.96■□□□□ 0.15
RRI1Q12468 YKL036CYKL036C 393 nt15.9■□□□□ 0.14
RRI1Q12468 SRX1YKL086W 384 nt15.16■□□□□ 0.02
RRI1Q12468 Q0297Q0297 156 nt15.14■□□□□ 0.01
RRI1Q12468 YJL027CYJL027C 417 nt14.82□□□□□ -0.04
RRI1Q12468 YCR051WYCR051W 669 nt14.38□□□□□ -0.11
RRI1Q12468 SCS3YGL126W 1143 nt14.33□□□□□ -0.12
RRI1Q12468 DBP2YNL112W 1641 nt14.02□□□□□ -0.16
RRI1Q12468 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.77□□□□□ -0.21
RRI1Q12468 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.77□□□□□ -0.21
RRI1Q12468 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.77□□□□□ -0.21
RRI1Q12468 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.77□□□□□ -0.21
RRI1Q12468 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.77□□□□□ -0.21
RRI1Q12468 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.77□□□□□ -0.21
RRI1Q12468 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.77□□□□□ -0.21
RRI1Q12468 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.77□□□□□ -0.21
RRI1Q12468 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.77□□□□□ -0.21
RRI1Q12468 YOL085CYOL085C 342 nt13.73□□□□□ -0.21
RRI1Q12468 YBR190WYBR190W 312 nt13.73□□□□□ -0.21
RRI1Q12468 CCC1YLR220W 969 nt13.62□□□□□ -0.23
RRI1Q12468 RPP1BYDL130W 321 nt13.59□□□□□ -0.23
RRI1Q12468 PKP1YIL042C 1185 nt13.49□□□□□ -0.25
RRI1Q12468 RTC3YHR087W 336 nt13.43□□□□□ -0.26
RRI1Q12468 SSA3YBL075C 1950 nt13.37□□□□□ -0.27
RRI1Q12468 RVS167YDR388W 1449 nt13.34□□□□□ -0.27
RRI1Q12468 SCJ1YMR214W 1134 nt13.07□□□□□ -0.32
RRI1Q12468 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.98□□□□□ -0.33
RRI1Q12468 PET122YER153C 765 nt12.95□□□□□ -0.34
RRI1Q12468 SCR1SCR1 522 nt12.89□□□□□ -0.35
RRI1Q12468 ATS1YAL020C 1002 nt12.79□□□□□ -0.36
RRI1Q12468 SHR5YOL110W 714 nt12.79□□□□□ -0.36
RRI1Q12468 PUT4YOR348C 1884 nt12.61□□□□□ -0.39
RRI1Q12468 YDJ1YNL064C 1230 nt12.59□□□□□ -0.39
RRI1Q12468 RRN5YLR141W 1092 nt12.57□□□□□ -0.4
RRI1Q12468 URN1YPR152C 1398 nt12.49□□□□□ -0.41
RRI1Q12468 DEP1YAL013W 1218 nt12.4□□□□□ -0.42
RRI1Q12468 RPN10YHR200W 807 nt12.38□□□□□ -0.43
RRI1Q12468 OPI9YLR338W 858 nt12.34□□□□□ -0.43
RRI1Q12468 RSB1YOR049C 1065 nt12.32□□□□□ -0.44
RRI1Q12468 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.31□□□□□ -0.44
RRI1Q12468 GAR1YHR089C 618 nt12.3□□□□□ -0.44
RRI1Q12468 YNL208WYNL208W 600 nt12.27□□□□□ -0.45
RRI1Q12468 SAH1YER043C 1350 nt12.26□□□□□ -0.45
RRI1Q12468 ARE1YCR048W 1833 nt12.21□□□□□ -0.46
RRI1Q12468 POA1YBR022W 534 nt12.17□□□□□ -0.46
RRI1Q12468 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.1□□□□□ -0.47
RRI1Q12468 PUN1YLR414C 792 nt12.03□□□□□ -0.48
RRI1Q12468 BSC6YOL137W 1494 nt12.02□□□□□ -0.48
RRI1Q12468 SPT5YML010W 3192 nt11.94□□□□□ -0.5
RRI1Q12468 YJR018WYJR018W 363 nt11.92□□□□□ -0.5
RRI1Q12468 TIR1YER011W 765 nt11.9□□□□□ -0.5
RRI1Q12468 PST2YDR032C 597 nt11.85□□□□□ -0.51
RRI1Q12468 SSA4YER103W 1929 nt11.85□□□□□ -0.51
RRI1Q12468 PTC2YER089C 1395 nt11.84□□□□□ -0.51
RRI1Q12468 BUD23YCR047C 828 nt11.84□□□□□ -0.51
RRI1Q12468 NAB2YGL122C 1578 nt11.75□□□□□ -0.53
RRI1Q12468 SSA1YAL005C 1929 nt11.72□□□□□ -0.53
RRI1Q12468 RPP2BYDR382W 333 nt11.72□□□□□ -0.53
RRI1Q12468 YJR120WYJR120W 351 nt11.58□□□□□ -0.56
RRI1Q12468 INM2YDR287W 879 nt11.56□□□□□ -0.56
RRI1Q12468 DAL1YIR027C 1383 nt11.55□□□□□ -0.56
RRI1Q12468 FPR4YLR449W 1179 nt11.53□□□□□ -0.56
RRI1Q12468 FIS1YIL065C 468 nt11.49□□□□□ -0.57
RRI1Q12468 BDF1YLR399C 2061 nt11.46□□□□□ -0.57
RRI1Q12468 PHO4YFR034C 939 nt11.43□□□□□ -0.58
RRI1Q12468 SRB2YHR041C 633 nt11.4□□□□□ -0.58
RRI1Q12468 BDH2YAL061W 1254 nt11.4□□□□□ -0.58
RRI1Q12468 YBL100CYBL100C 315 nt11.39□□□□□ -0.59
RRI1Q12468 SHU1YHL006C 453 nt11.38□□□□□ -0.59
RRI1Q12468 MEP2YNL142W 1500 nt11.37□□□□□ -0.59
RRI1Q12468 YKL097CYKL097C 411 nt11.37□□□□□ -0.59
RRI1Q12468 YGR021WYGR021W 873 nt11.32□□□□□ -0.6
RRI1Q12468 WWM1YFL010C 636 nt11.31□□□□□ -0.6
RRI1Q12468 TAT1YBR069C 1860 nt11.29□□□□□ -0.6
RRI1Q12468 LSM3YLR438C-A 270 nt11.25□□□□□ -0.61
RRI1Q12468 YPS1YLR120C 1710 nt11.23□□□□□ -0.61
RRI1Q12468 TRM9YML014W 840 nt11.23□□□□□ -0.61
RRI1Q12468 FUN26YAL022C 1554 nt11.23□□□□□ -0.61
RRI1Q12468 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.22□□□□□ -0.61
RRI1Q12468 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.21□□□□□ -0.61
RRI1Q12468 HOM6YJR139C 1080 nt11.18□□□□□ -0.62
RRI1Q12468 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.17□□□□□ -0.62
RRI1Q12468 ALF1YNL148C 765 nt11.17□□□□□ -0.62
RRI1Q12468 YDR095CYDR095C 411 nt11.16□□□□□ -0.62
RRI1Q12468 DCW1YKL046C 1350 nt11.15□□□□□ -0.63
RRI1Q12468 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.09□□□□□ -0.63
RRI1Q12468 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.09□□□□□ -0.63
RRI1Q12468 CCT6YDR188W 1641 nt11.09□□□□□ -0.63
RRI1Q12468 PAC11YDR488C 1602 nt11.07□□□□□ -0.64
RRI1Q12468 MNP1YGL068W 585 nt11.07□□□□□ -0.64
RRI1Q12468 YMR090WYMR090W 684 nt11.04□□□□□ -0.64
RRI1Q12468 RKM5YLR137W 1104 nt11.03□□□□□ -0.64
RRI1Q12468 YBR220CYBR220C 1683 nt11.02□□□□□ -0.64
RRI1Q12468 EMI2YDR516C 1503 nt11.01□□□□□ -0.65
RRI1Q12468 RPP2AYOL039W 321 nt10.97□□□□□ -0.65
RRI1Q12468 Q0182Q0182 405 nt10.95□□□□□ -0.66
RRI1Q12468 YOL037CYOL037C 354 nt10.94□□□□□ -0.66
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