Protein–RNA interactions for Protein: Q12477

PCL9, PHO85 cyclin-9, yeastyeast

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PCL9Q12477 NSR1YGR159C 1245 nt18.4■□□□□ 0.54
PCL9Q12477 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.18■□□□□ 0.5
PCL9Q12477 NOP1YDL014W 984 nt17.58■□□□□ 0.4
PCL9Q12477 MDJ1YFL016C 1536 nt16.61■□□□□ 0.25
PCL9Q12477 YKL036CYKL036C 393 nt15.87■□□□□ 0.13
PCL9Q12477 YJL027CYJL027C 417 nt15.35■□□□□ 0.05
PCL9Q12477 SRX1YKL086W 384 nt15.34■□□□□ 0.05
PCL9Q12477 Q0297Q0297 156 nt15.25■□□□□ 0.03
PCL9Q12477 DBP2YNL112W 1641 nt14.55□□□□□ -0.08
PCL9Q12477 YCR051WYCR051W 669 nt14.52□□□□□ -0.09
PCL9Q12477 YBR190WYBR190W 312 nt14.3□□□□□ -0.12
PCL9Q12477 SCS3YGL126W 1143 nt14.23□□□□□ -0.13
PCL9Q12477 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.05□□□□□ -0.16
PCL9Q12477 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.05□□□□□ -0.16
PCL9Q12477 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.05□□□□□ -0.16
PCL9Q12477 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.05□□□□□ -0.16
PCL9Q12477 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.05□□□□□ -0.16
PCL9Q12477 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.05□□□□□ -0.16
PCL9Q12477 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.05□□□□□ -0.16
PCL9Q12477 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.05□□□□□ -0.16
PCL9Q12477 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.05□□□□□ -0.16
PCL9Q12477 RTC3YHR087W 336 nt13.97□□□□□ -0.17
PCL9Q12477 CCC1YLR220W 969 nt13.91□□□□□ -0.18
PCL9Q12477 YOL085CYOL085C 342 nt13.73□□□□□ -0.21
PCL9Q12477 RVS167YDR388W 1449 nt13.68□□□□□ -0.22
PCL9Q12477 RPP1BYDL130W 321 nt13.68□□□□□ -0.22
PCL9Q12477 PKP1YIL042C 1185 nt13.54□□□□□ -0.24
PCL9Q12477 SCJ1YMR214W 1134 nt13.45□□□□□ -0.26
PCL9Q12477 PUT4YOR348C 1884 nt13.21□□□□□ -0.29
PCL9Q12477 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.19□□□□□ -0.3
PCL9Q12477 SSA3YBL075C 1950 nt13.15□□□□□ -0.3
PCL9Q12477 SHR5YOL110W 714 nt13.09□□□□□ -0.31
PCL9Q12477 PET122YER153C 765 nt13.08□□□□□ -0.32
PCL9Q12477 URN1YPR152C 1398 nt12.93□□□□□ -0.34
PCL9Q12477 SCR1SCR1 522 nt12.91□□□□□ -0.34
PCL9Q12477 ARE1YCR048W 1833 nt12.87□□□□□ -0.35
PCL9Q12477 OPI9YLR338W 858 nt12.83□□□□□ -0.36
PCL9Q12477 SAH1YER043C 1350 nt12.81□□□□□ -0.36
PCL9Q12477 DEP1YAL013W 1218 nt12.8□□□□□ -0.36
PCL9Q12477 YDJ1YNL064C 1230 nt12.78□□□□□ -0.36
PCL9Q12477 POA1YBR022W 534 nt12.78□□□□□ -0.36
PCL9Q12477 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.71□□□□□ -0.37
PCL9Q12477 RPN10YHR200W 807 nt12.71□□□□□ -0.37
PCL9Q12477 RRN5YLR141W 1092 nt12.68□□□□□ -0.38
PCL9Q12477 ATS1YAL020C 1002 nt12.64□□□□□ -0.39
PCL9Q12477 YNL208WYNL208W 600 nt12.61□□□□□ -0.39
PCL9Q12477 BSC6YOL137W 1494 nt12.57□□□□□ -0.4
PCL9Q12477 GAR1YHR089C 618 nt12.53□□□□□ -0.4
PCL9Q12477 PUN1YLR414C 792 nt12.47□□□□□ -0.41
PCL9Q12477 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.42□□□□□ -0.42
PCL9Q12477 BUD23YCR047C 828 nt12.41□□□□□ -0.42
PCL9Q12477 PTC2YER089C 1395 nt12.35□□□□□ -0.43
PCL9Q12477 YJR018WYJR018W 363 nt12.33□□□□□ -0.44
PCL9Q12477 RSB1YOR049C 1065 nt12.33□□□□□ -0.44
PCL9Q12477 NAB2YGL122C 1578 nt12.26□□□□□ -0.45
PCL9Q12477 SPT5YML010W 3192 nt12.2□□□□□ -0.46
PCL9Q12477 TIR1YER011W 765 nt12.13□□□□□ -0.47
PCL9Q12477 SSA1YAL005C 1929 nt12.03□□□□□ -0.48
PCL9Q12477 DAL1YIR027C 1383 nt12.03□□□□□ -0.48
PCL9Q12477 RPP2BYDR382W 333 nt12.02□□□□□ -0.49
PCL9Q12477 FIS1YIL065C 468 nt12□□□□□ -0.49
PCL9Q12477 YJR120WYJR120W 351 nt11.99□□□□□ -0.49
PCL9Q12477 FPR4YLR449W 1179 nt11.98□□□□□ -0.49
PCL9Q12477 INM2YDR287W 879 nt11.96□□□□□ -0.49
PCL9Q12477 SSA4YER103W 1929 nt11.95□□□□□ -0.5
PCL9Q12477 PHO4YFR034C 939 nt11.89□□□□□ -0.51
PCL9Q12477 MEP2YNL142W 1500 nt11.85□□□□□ -0.51
PCL9Q12477 YPS1YLR120C 1710 nt11.78□□□□□ -0.52
PCL9Q12477 PST2YDR032C 597 nt11.76□□□□□ -0.53
PCL9Q12477 YBL100CYBL100C 315 nt11.76□□□□□ -0.53
PCL9Q12477 SRB2YHR041C 633 nt11.7□□□□□ -0.54
PCL9Q12477 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.69□□□□□ -0.54
PCL9Q12477 BDH2YAL061W 1254 nt11.69□□□□□ -0.54
PCL9Q12477 YDR095CYDR095C 411 nt11.66□□□□□ -0.54
PCL9Q12477 DCW1YKL046C 1350 nt11.62□□□□□ -0.55
PCL9Q12477 FUN26YAL022C 1554 nt11.6□□□□□ -0.55
PCL9Q12477 TRM9YML014W 840 nt11.55□□□□□ -0.56
PCL9Q12477 ALF1YNL148C 765 nt11.54□□□□□ -0.56
PCL9Q12477 WWM1YFL010C 636 nt11.51□□□□□ -0.57
PCL9Q12477 BDF1YLR399C 2061 nt11.5□□□□□ -0.57
PCL9Q12477 YMR090WYMR090W 684 nt11.5□□□□□ -0.57
PCL9Q12477 EMI2YDR516C 1503 nt11.5□□□□□ -0.57
PCL9Q12477 LSM3YLR438C-A 270 nt11.49□□□□□ -0.57
PCL9Q12477 RPP2AYOL039W 321 nt11.45□□□□□ -0.58
PCL9Q12477 CCT6YDR188W 1641 nt11.42□□□□□ -0.58
PCL9Q12477 PTP1YDL230W 1008 nt11.4□□□□□ -0.58
PCL9Q12477 YGR021WYGR021W 873 nt11.39□□□□□ -0.59
PCL9Q12477 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.39□□□□□ -0.59
PCL9Q12477 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.39□□□□□ -0.59
PCL9Q12477 YDL221WYDL221W 552 nt11.38□□□□□ -0.59
PCL9Q12477 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.38□□□□□ -0.59
PCL9Q12477 YBR220CYBR220C 1683 nt11.37□□□□□ -0.59
PCL9Q12477 CAC2YML102W 1407 nt11.36□□□□□ -0.59
PCL9Q12477 TAT1YBR069C 1860 nt11.36□□□□□ -0.59
PCL9Q12477 SHU1YHL006C 453 nt11.35□□□□□ -0.59
PCL9Q12477 SIS1YNL007C 1059 nt11.34□□□□□ -0.59
PCL9Q12477 SDH1YKL148C 1923 nt11.3□□□□□ -0.6
PCL9Q12477 HOM6YJR139C 1080 nt11.29□□□□□ -0.6
PCL9Q12477 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.27□□□□□ -0.61
PCL9Q12477 IRC15YPL017C 1500 nt11.19□□□□□ -0.62
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