Protein–RNA interactions for Protein: P13712

MSI1, Chromatin assembly factor 1 subunit p50, yeastyeast

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSI1P13712 NSR1YGR159C 1245 nt17.51■□□□□ 0.39
MSI1P13712 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.48■□□□□ 0.39
MSI1P13712 NOP1YDL014W 984 nt17.01■□□□□ 0.31
MSI1P13712 YKL036CYKL036C 393 nt15.63■□□□□ 0.09
MSI1P13712 MDJ1YFL016C 1536 nt15.57■□□□□ 0.08
MSI1P13712 Q0297Q0297 156 nt14.87□□□□□ -0.03
MSI1P13712 SRX1YKL086W 384 nt14.86□□□□□ -0.03
MSI1P13712 YJL027CYJL027C 417 nt14.6□□□□□ -0.07
MSI1P13712 SCS3YGL126W 1143 nt14.25□□□□□ -0.13
MSI1P13712 YCR051WYCR051W 669 nt14.06□□□□□ -0.16
MSI1P13712 DBP2YNL112W 1641 nt13.79□□□□□ -0.2
MSI1P13712 YOL085CYOL085C 342 nt13.54□□□□□ -0.24
MSI1P13712 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.48□□□□□ -0.25
MSI1P13712 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.48□□□□□ -0.25
MSI1P13712 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.48□□□□□ -0.25
MSI1P13712 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.48□□□□□ -0.25
MSI1P13712 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.48□□□□□ -0.25
MSI1P13712 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.48□□□□□ -0.25
MSI1P13712 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.48□□□□□ -0.25
MSI1P13712 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.48□□□□□ -0.25
MSI1P13712 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.48□□□□□ -0.25
MSI1P13712 RPP1BYDL130W 321 nt13.34□□□□□ -0.27
MSI1P13712 YBR190WYBR190W 312 nt13.34□□□□□ -0.27
MSI1P13712 CCC1YLR220W 969 nt13.32□□□□□ -0.28
MSI1P13712 PKP1YIL042C 1185 nt13.3□□□□□ -0.28
MSI1P13712 RTC3YHR087W 336 nt13□□□□□ -0.33
MSI1P13712 RVS167YDR388W 1449 nt12.92□□□□□ -0.34
MSI1P13712 SCJ1YMR214W 1134 nt12.92□□□□□ -0.34
MSI1P13712 ATS1YAL020C 1002 nt12.81□□□□□ -0.36
MSI1P13712 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.73□□□□□ -0.37
MSI1P13712 PET122YER153C 765 nt12.72□□□□□ -0.37
MSI1P13712 SCR1SCR1 522 nt12.58□□□□□ -0.4
MSI1P13712 SHR5YOL110W 714 nt12.46□□□□□ -0.41
MSI1P13712 RRN5YLR141W 1092 nt12.38□□□□□ -0.43
MSI1P13712 YDJ1YNL064C 1230 nt12.32□□□□□ -0.44
MSI1P13712 PUT4YOR348C 1884 nt12.18□□□□□ -0.46
MSI1P13712 URN1YPR152C 1398 nt12.15□□□□□ -0.46
MSI1P13712 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.13□□□□□ -0.47
MSI1P13712 DEP1YAL013W 1218 nt12.1□□□□□ -0.47
MSI1P13712 SSA3YBL075C 1950 nt12.09□□□□□ -0.47
MSI1P13712 RSB1YOR049C 1065 nt12.06□□□□□ -0.48
MSI1P13712 GAR1YHR089C 618 nt12.03□□□□□ -0.48
MSI1P13712 OPI9YLR338W 858 nt12.01□□□□□ -0.49
MSI1P13712 RPN10YHR200W 807 nt11.95□□□□□ -0.5
MSI1P13712 SAH1YER043C 1350 nt11.94□□□□□ -0.5
MSI1P13712 YNL208WYNL208W 600 nt11.94□□□□□ -0.5
MSI1P13712 ARE1YCR048W 1833 nt11.93□□□□□ -0.5
MSI1P13712 PST2YDR032C 597 nt11.83□□□□□ -0.52
MSI1P13712 POA1YBR022W 534 nt11.78□□□□□ -0.52
MSI1P13712 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.73□□□□□ -0.53
MSI1P13712 PUN1YLR414C 792 nt11.65□□□□□ -0.54
MSI1P13712 TIR1YER011W 765 nt11.64□□□□□ -0.55
MSI1P13712 YJR018WYJR018W 363 nt11.6□□□□□ -0.55
MSI1P13712 SSA1YAL005C 1929 nt11.53□□□□□ -0.56
MSI1P13712 BSC6YOL137W 1494 nt11.52□□□□□ -0.56
MSI1P13712 PTC2YER089C 1395 nt11.52□□□□□ -0.57
MSI1P13712 YKL097CYKL097C 411 nt11.47□□□□□ -0.57
MSI1P13712 BUD23YCR047C 828 nt11.45□□□□□ -0.58
MSI1P13712 YJR120WYJR120W 351 nt11.4□□□□□ -0.58
MSI1P13712 NAB2YGL122C 1578 nt11.4□□□□□ -0.58
MSI1P13712 RPP2BYDR382W 333 nt11.33□□□□□ -0.6
MSI1P13712 SRB2YHR041C 633 nt11.32□□□□□ -0.6
MSI1P13712 SHU1YHL006C 453 nt11.29□□□□□ -0.6
MSI1P13712 INM2YDR287W 879 nt11.22□□□□□ -0.61
MSI1P13712 DAL1YIR027C 1383 nt11.22□□□□□ -0.61
MSI1P13712 FIS1YIL065C 468 nt11.2□□□□□ -0.62
MSI1P13712 FPR4YLR449W 1179 nt11.15□□□□□ -0.62
MSI1P13712 SPT5YML010W 3192 nt11.12□□□□□ -0.63
MSI1P13712 WWM1YFL010C 636 nt11.11□□□□□ -0.63
MSI1P13712 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.11□□□□□ -0.63
MSI1P13712 PHO4YFR034C 939 nt11.1□□□□□ -0.63
MSI1P13712 BDH2YAL061W 1254 nt11.1□□□□□ -0.63
MSI1P13712 YBL100CYBL100C 315 nt11.06□□□□□ -0.64
MSI1P13712 YGR021WYGR021W 873 nt11.03□□□□□ -0.64
MSI1P13712 HOM6YJR139C 1080 nt10.99□□□□□ -0.65
MSI1P13712 LSM3YLR438C-A 270 nt10.98□□□□□ -0.65
MSI1P13712 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.95□□□□□ -0.66
MSI1P13712 YPS1YLR120C 1710 nt10.94□□□□□ -0.66
MSI1P13712 FUN26YAL022C 1554 nt10.94□□□□□ -0.66
MSI1P13712 TRM9YML014W 840 nt10.92□□□□□ -0.66
MSI1P13712 YOR139CYOR139C 393 nt10.92□□□□□ -0.66
MSI1P13712 SSA4YER103W 1929 nt10.89□□□□□ -0.67
MSI1P13712 MNP1YGL068W 585 nt10.88□□□□□ -0.67
MSI1P13712 NPL3YDR432W 1245 nt10.87□□□□□ -0.67
MSI1P13712 MEP2YNL142W 1500 nt10.84□□□□□ -0.67
MSI1P13712 YDR095CYDR095C 411 nt10.84□□□□□ -0.67
MSI1P13712 RKM5YLR137W 1104 nt10.82□□□□□ -0.68
MSI1P13712 CCT6YDR188W 1641 nt10.81□□□□□ -0.68
MSI1P13712 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.79□□□□□ -0.68
MSI1P13712 ALF1YNL148C 765 nt10.77□□□□□ -0.69
MSI1P13712 YOL037CYOL037C 354 nt10.76□□□□□ -0.69
MSI1P13712 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.71□□□□□ -0.69
MSI1P13712 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.71□□□□□ -0.69
MSI1P13712 SIS1YNL007C 1059 nt10.66□□□□□ -0.7
MSI1P13712 DCW1YKL046C 1350 nt10.65□□□□□ -0.7
MSI1P13712 RPP2AYOL039W 321 nt10.65□□□□□ -0.7
MSI1P13712 PTP1YDL230W 1008 nt10.63□□□□□ -0.71
MSI1P13712 CAC2YML102W 1407 nt10.54□□□□□ -0.72
MSI1P13712 EMI2YDR516C 1503 nt10.53□□□□□ -0.72
MSI1P13712 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.51□□□□□ -0.73
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