RNA–Protein interactions for RNA: YGR008C

STF2, Transcript of Protein involved in resistance to desiccation stress, yeastyeast

Gene STF2, Length 255 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
STF2YGR008C XPT1P47165 209 aa0.72□□□□□ -2.29
STF2YGR008C UPF3P48412 387 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
STF2YGR008C YDC1Q02896 317 aa0.72□□□□□ -2.29
STF2YGR008C YMR254CQ04838 102 aa0.72□□□□□ -2.29
STF2YGR008C ASR1Q06834 288 aa0.72□□□□□ -2.29
STF2YGR008C SLD7Q08457 257 aa0.72□□□□□ -2.29
STF2YGR008C YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
STF2YGR008C PEP4P07267 405 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C NMT1P14743 455 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C SPO16P17122 198 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C RAD57P25301 460 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C GIT1P25346 518 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C CTR86P25355 563 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C MCM10P32354 571 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C HYM1P32464 399 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C HXT1P32465 570 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C PTM1P32857 523 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C TRS65P32893 560 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C VPS17P32913 551 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C EFM1P38732 585 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C YHR180WP38868 163 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C HXT9P40885 567 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C GAB1P41733 394 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C ERR3P42222 437 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C GTO1P48239 356 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C BTN2P53286 410 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C RBG2P53295 368 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C RMI1Q02685 241 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C UME1Q03010 460 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C VMS1Q04311 632 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C SWF1Q04629 336 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C VAM10Q08474 114 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C GET4Q12125 312 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C RUD3Q12234 484 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C MHT1Q12525 324 aa0.71□□□□□ -2.3
STF2YGR008C DBP3P20447 523 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C ATP12P22135 325 aa0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C RVS161P25343 265 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C YCL068CP25593 260 aa0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C FUN19P28003 413 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C ARP2P32381 391 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data0.7□□□□□ -2.3not detected
STF2YGR008C NIP100P33420 868 aa0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C AGX1P43567 385 aa0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C ATG18P43601 500 aa0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C AIP1P46680 615 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C TOS8P53147 276 aa0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C CLD1P53264 445 aa0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C STD1Q02794 444 aa0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C SGF11Q03067 99 aa0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C INP1Q03694 420 aa0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C YDR239CQ03780 787 aa0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C ASA1Q06822 443 aa0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C PPT2Q12036 173 aa0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C MCT1Q12283 360 aa0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C NOP58Q12499 511 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C AVL9Q12500 764 aa0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
STF2YGR008C ILV2P07342 687 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C CBT1P36038 271 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C RIM2P38127 377 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C SDH8P38345 138 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C CKB2P38930 258 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C AIM10P39965 576 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C RMD6P39975 231 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C YNL194CP40169 301 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C FLX1P40464 311 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C OST1P41543 476 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C GCD14P46959 383 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C BOL2P53082 120 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C SHY1P53266 389 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C DBP6P53734 629 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C YNR062CP53748 327 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C BOR1P53838 576 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C LCL1Q02786 101 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C TRI1Q05024 226 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C VPS38Q05919 439 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C SWA2Q06677 668 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C ETT1Q08421 412 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C BSC1Q12140 328 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C RLM1Q12224 676 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C YOR343CQ12484 108 aa0.69□□□□□ -2.3
STF2YGR008C MSW1P04803 379 aa0.68□□□□□ -2.3
STF2YGR008C SPT3P06844 337 aa0.68□□□□□ -2.3
STF2YGR008C HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data0.68□□□□□ -2.3not detected
STF2YGR008C STF2P16965 84 aa0.68□□□□□ -2.3
STF2YGR008C HXT2P23585 541 aa0.68□□□□□ -2.3
STF2YGR008C SEC65P29478 273 aa0.68□□□□□ -2.3
STF2YGR008C PUP2P32379 260 aa0.68□□□□□ -2.3
STF2YGR008C ARO4P32449 370 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
STF2YGR008C CAT2P32796 670 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
STF2YGR008C VPS21P36017 210 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
STF2YGR008C IST2P38250 946 aa0.68□□□□□ -2.3
STF2YGR008C BMT2P38278 337 aa0.68□□□□□ -2.3
STF2YGR008C SMF2P38778 549 aa0.68□□□□□ -2.3
STF2YGR008C TRM5P38793 499 aa0.68□□□□□ -2.3
STF2YGR008C CCT2P39076 527 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
STF2YGR008C SOP4P39543 234 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
STF2YGR008C NOP16P40007 231 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.2 ms