Protein–RNA interactions for Protein: Q08474

VAM10, Vacuolar morphogenesis protein 10, yeastyeast

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM10Q08474 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.07■□□□□ 0
VAM10Q08474 NSR1YGR159C 1245 nt15□□□□□ -0.01
VAM10Q08474 NOP1YDL014W 984 nt14.73□□□□□ -0.05
VAM10Q08474 YKL036CYKL036C 393 nt13.51□□□□□ -0.25
VAM10Q08474 MDJ1YFL016C 1536 nt13.25□□□□□ -0.29
VAM10Q08474 Q0297Q0297 156 nt12.8□□□□□ -0.36
VAM10Q08474 SRX1YKL086W 384 nt12.79□□□□□ -0.36
VAM10Q08474 YJL027CYJL027C 417 nt12.63□□□□□ -0.39
VAM10Q08474 SCS3YGL126W 1143 nt12.23□□□□□ -0.45
VAM10Q08474 YCR051WYCR051W 669 nt12.17□□□□□ -0.46
VAM10Q08474 DBP2YNL112W 1641 nt11.68□□□□□ -0.54
VAM10Q08474 YOL085CYOL085C 342 nt11.67□□□□□ -0.54
VAM10Q08474 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.53□□□□□ -0.56
VAM10Q08474 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.53□□□□□ -0.56
VAM10Q08474 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.53□□□□□ -0.56
VAM10Q08474 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.53□□□□□ -0.56
VAM10Q08474 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.53□□□□□ -0.56
VAM10Q08474 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.53□□□□□ -0.56
VAM10Q08474 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.53□□□□□ -0.56
VAM10Q08474 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.53□□□□□ -0.56
VAM10Q08474 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.53□□□□□ -0.56
VAM10Q08474 RPP1BYDL130W 321 nt11.5□□□□□ -0.57
VAM10Q08474 PKP1YIL042C 1185 nt11.48□□□□□ -0.57
VAM10Q08474 CCC1YLR220W 969 nt11.48□□□□□ -0.57
VAM10Q08474 YBR190WYBR190W 312 nt11.36□□□□□ -0.59
VAM10Q08474 RTC3YHR087W 336 nt11.16□□□□□ -0.62
VAM10Q08474 RVS167YDR388W 1449 nt11.15□□□□□ -0.62
VAM10Q08474 ATS1YAL020C 1002 nt10.96□□□□□ -0.65
VAM10Q08474 PET122YER153C 765 nt10.94□□□□□ -0.66
VAM10Q08474 SCR1SCR1 522 nt10.94□□□□□ -0.66
VAM10Q08474 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.93□□□□□ -0.66
VAM10Q08474 SCJ1YMR214W 1134 nt10.92□□□□□ -0.66
VAM10Q08474 SHR5YOL110W 714 nt10.69□□□□□ -0.7
VAM10Q08474 RRN5YLR141W 1092 nt10.65□□□□□ -0.7
VAM10Q08474 YDJ1YNL064C 1230 nt10.58□□□□□ -0.72
VAM10Q08474 SSA3YBL075C 1950 nt10.48□□□□□ -0.73
VAM10Q08474 RSB1YOR049C 1065 nt10.47□□□□□ -0.73
VAM10Q08474 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.43□□□□□ -0.74
VAM10Q08474 URN1YPR152C 1398 nt10.39□□□□□ -0.75
VAM10Q08474 DEP1YAL013W 1218 nt10.37□□□□□ -0.75
VAM10Q08474 PUT4YOR348C 1884 nt10.36□□□□□ -0.75
VAM10Q08474 GAR1YHR089C 618 nt10.36□□□□□ -0.75
VAM10Q08474 RPN10YHR200W 807 nt10.32□□□□□ -0.76
VAM10Q08474 YNL208WYNL208W 600 nt10.25□□□□□ -0.77
VAM10Q08474 OPI9YLR338W 858 nt10.23□□□□□ -0.77
VAM10Q08474 SAH1YER043C 1350 nt10.15□□□□□ -0.78
VAM10Q08474 PST2YDR032C 597 nt10.13□□□□□ -0.79
VAM10Q08474 ARE1YCR048W 1833 nt10.07□□□□□ -0.8
VAM10Q08474 TIR1YER011W 765 nt10.01□□□□□ -0.81
VAM10Q08474 POA1YBR022W 534 nt9.99□□□□□ -0.81
VAM10Q08474 PUN1YLR414C 792 nt9.98□□□□□ -0.81
VAM10Q08474 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt9.96□□□□□ -0.82
VAM10Q08474 YJR018WYJR018W 363 nt9.92□□□□□ -0.82
VAM10Q08474 BSC6YOL137W 1494 nt9.86□□□□□ -0.83
VAM10Q08474 SSA1YAL005C 1929 nt9.84□□□□□ -0.83
VAM10Q08474 PTC2YER089C 1395 nt9.83□□□□□ -0.84
VAM10Q08474 BUD23YCR047C 828 nt9.79□□□□□ -0.84
VAM10Q08474 RPP2BYDR382W 333 nt9.79□□□□□ -0.84
VAM10Q08474 YKL097CYKL097C 411 nt9.78□□□□□ -0.84
VAM10Q08474 NAB2YGL122C 1578 nt9.72□□□□□ -0.85
VAM10Q08474 SHU1YHL006C 453 nt9.71□□□□□ -0.86
VAM10Q08474 YJR120WYJR120W 351 nt9.63□□□□□ -0.87
VAM10Q08474 SPT5YML010W 3192 nt9.63□□□□□ -0.87
VAM10Q08474 INM2YDR287W 879 nt9.61□□□□□ -0.87
VAM10Q08474 FPR4YLR449W 1179 nt9.6□□□□□ -0.87
VAM10Q08474 DAL1YIR027C 1383 nt9.59□□□□□ -0.87
VAM10Q08474 SRB2YHR041C 633 nt9.57□□□□□ -0.88
VAM10Q08474 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt9.57□□□□□ -0.88
VAM10Q08474 YGR021WYGR021W 873 nt9.55□□□□□ -0.88
VAM10Q08474 WWM1YFL010C 636 nt9.53□□□□□ -0.88
VAM10Q08474 BDH2YAL061W 1254 nt9.53□□□□□ -0.88
VAM10Q08474 FIS1YIL065C 468 nt9.48□□□□□ -0.89
VAM10Q08474 YBL100CYBL100C 315 nt9.48□□□□□ -0.89
VAM10Q08474 SSA4YER103W 1929 nt9.46□□□□□ -0.89
VAM10Q08474 PHO4YFR034C 939 nt9.46□□□□□ -0.9
VAM10Q08474 HOM6YJR139C 1080 nt9.44□□□□□ -0.9
VAM10Q08474 LSM3YLR438C-A 270 nt9.43□□□□□ -0.9
VAM10Q08474 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.42□□□□□ -0.9
VAM10Q08474 TRM9YML014W 840 nt9.4□□□□□ -0.9
VAM10Q08474 MNP1YGL068W 585 nt9.37□□□□□ -0.91
VAM10Q08474 FUN26YAL022C 1554 nt9.36□□□□□ -0.91
VAM10Q08474 NPL3YDR432W 1245 nt9.34□□□□□ -0.91
VAM10Q08474 RKM5YLR137W 1104 nt9.32□□□□□ -0.92
VAM10Q08474 ALF1YNL148C 765 nt9.3□□□□□ -0.92
VAM10Q08474 MEP2YNL142W 1500 nt9.3□□□□□ -0.92
VAM10Q08474 YOL037CYOL037C 354 nt9.29□□□□□ -0.92
VAM10Q08474 YOR139CYOR139C 393 nt9.29□□□□□ -0.92
VAM10Q08474 YPS1YLR120C 1710 nt9.27□□□□□ -0.93
VAM10Q08474 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.25□□□□□ -0.93
VAM10Q08474 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.25□□□□□ -0.93
VAM10Q08474 CCT6YDR188W 1641 nt9.24□□□□□ -0.93
VAM10Q08474 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.23□□□□□ -0.93
VAM10Q08474 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.21□□□□□ -0.93
VAM10Q08474 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.21□□□□□ -0.93
VAM10Q08474 YDR095CYDR095C 411 nt9.2□□□□□ -0.94
VAM10Q08474 BDF1YLR399C 2061 nt9.12□□□□□ -0.95
VAM10Q08474 YJL225CYJL225C 5277 nt9.12□□□□□ -0.95
VAM10Q08474 DCW1YKL046C 1350 nt9.11□□□□□ -0.95
VAM10Q08474 SIS1YNL007C 1059 nt9.07□□□□□ -0.96
VAM10Q08474 RPP2AYOL039W 321 nt9.07□□□□□ -0.96
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