RNA–Protein interactions for RNA: YBL093C

ROX3, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene ROX3, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROX3	YBL093C	YGL235W	P53071	178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YIP4	P53093	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	PEF1	P53238	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	HOL1	P53389	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	URC2	Q04411	772 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	NEJ1	Q06148	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ARR3	Q06598	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YDL114W	Q07530	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	SPC3	Q12133	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	REP1	P03871	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	MET2	P08465	486 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ERD1	P16151	362 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	CLB2	P24869	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	CNE1	P27825	502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	NDC1	P32500	655 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ORC2	P32833	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	TPO5	P36029	618 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	FMP23	P38231	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	RTC2	P38279	296 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	MDM31	P38880	579 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	VPS52	P39904	641 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	PCL6	P40038	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	DDI1	P40087	428 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	APS3	P47064	194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YDL183C	P48569	320 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YGR067C	P53243	804 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	NCE101	Q02820	53 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	SNZ1	Q03148	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	OST6	Q03723	332 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	UIP4	Q08926	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	MSH5	Q12175	901 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	RBD2	Q12270	262 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	IES3	Q12345	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	APC2	Q12440	853 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	BLM10	P43583	2143 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	SEC12	P11655	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	ERD2	P18414	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	CWH43	P25618	953 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	PMT2	P31382	759 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	ARO7	P32178	256 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YHR210C	P38893	341 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YJL193W	P39542	402 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	STB1	P42845	420 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YGL101W	P53144	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	LCL3	P53153	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	IMO32	P53219	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	BUD17	P53727	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	CPR8	P53728	308 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MAK3	Q03503	176 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	FIN1	Q03898	291 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	GPI17	Q04080	534 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	VID22	Q05934	901 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	MDM36	Q06820	579 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	SYO1	Q07395	620 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	PSF1	Q12488	208 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	GIT1	P25346	518 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	TIM12	P32830	109 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	SUR1	P33300	382 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	GPX2	P38143	162 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	EXO84	P38261	753 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	IFA38	P38286	347 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	CHL4	P38907	458 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	BUR6	P40096	142 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	JLP2	P40206	208 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YGL117W	P53133	265 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	GRX3	Q03835	250 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	COQ11	Q05892	277 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YLR173W	Q06247	608 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YPR127W	Q06494	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	TGS1	Q12052	315 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	REX3	Q12090	404 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	HOM3	P10869	527 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	YPK2	P18961	677 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	PHO80	P20052	293 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	DAL82	P21705	255 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROX3	YBL093C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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