RNA–Protein interactions for RNA: YHR213W-B

YHR213W-B, Transcript of Pseudogenic fragment with similarity to flocculins, yeastyeast

Gene YHR213W-B, Length 300 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR213W-BYHR213W-B HSP32Q08992 237 aa5.9□□□□□ -1.46
YHR213W-BYHR213W-B YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa5.9□□□□□ -1.46
YHR213W-BYHR213W-B YPK2P18961 677 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B PHO80P20052 293 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B RAD51P25454 400 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B DHR2P36009 735 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B BAP2P38084 609 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data5.89□□□□□ -1.47not detected
YHR213W-BYHR213W-B YHR180WP38868 163 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B CHL4P38907 458 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YER184CP39961 794 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B STB1P42845 420 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B RPE1P46969 238 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B RBL2P48606 106 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B SHE4P51534 789 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B MNT4P53745 580 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B ARP10Q04549 284 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B IRC19Q07843 230 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YLR040CQ07988 224 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B MDM32Q12171 622 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B PNS1Q12412 539 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B NKP1Q12493 238 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B LSO1Q3E827 93 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B MTR10Q99189 972 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B VCX1Q99385 411 aa5.89□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B PEP4P07267 405 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B SEC12P11655 471 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B RPB10P22139 70 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B SCO1P23833 295 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YKL077WP36081 392 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YKR015CP36111 568 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B KAE1P36132 386 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B ECM4P36156 370 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B MDM31P38880 579 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B MLH1P38920 769 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YER010CP40011 234 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B KRE29P40026 464 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B POP1P41812 875 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B ECO1P43605 281 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B BUD17P53727 317 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YNR062CP53748 327 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YPL039WQ03080 316 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B SNZ1Q03148 297 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B OST6Q03723 332 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B EMG1Q06287 252 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data5.88□□□□□ -1.47not detected
YHR213W-BYHR213W-B YDL177CQ12257 170 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B HER1Q12276 1246 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B PCL9Q12477 304 aa5.88□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B RPL7AP05737 244 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B CYT1P07143 309 aa5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B TAL1P15019 335 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B RPS5P26783 225 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B SUR1P33300 382 aa5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B MOH1P38191 138 aa5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B RPP1P38786 293 aa5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B FET3P38993 636 aa5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B AVT6P40074 448 aa5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B HIS6P40545 261 aa5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YFR054CP43622 192 aa5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B IRC7P43623 340 aa5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B SAM37P50110 327 aa5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B OGG1P53397 376 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B SNX41Q04053 625 aa5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YMR087WQ04299 284 aa5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YPR109WQ06104 294 aa5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B NEJ1Q06148 342 aa5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B GRE1Q08969 168 aa5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YRA1Q12159 226 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B SFG1Q12507 346 aa5.87□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B MET17P06106 444 aa5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YFR010W-AP0C5N0 62 aa5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B PDX1P16451 410 aa5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data5.86□□□□□ -1.47not detected
YHR213W-BYHR213W-B URE2P23202 354 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B RPL5P26321 297 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B PRE2P30656 287 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YME2P32843 850 aa5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B VBA2P38358 474 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YHR035WP38769 630 aa5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B RIX1P38883 763 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B PTI1P39927 425 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B DDI1P40087 428 aa5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B REE1P40893 198 aa5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B MNN5P46982 586 aa5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B SSY5P47002 699 aa5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B BPL1P48445 690 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B BUD9P53226 547 aa5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B PBP1P53297 722 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B ATG4P53867 494 aa5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B NOG1Q02892 647 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B GIS1Q03833 894 aa5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B FIN1Q03898 291 aa5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B COX20Q04935 205 aa5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B TMS1Q12116 473 aa5.86□□□□□ -1.47
YHR213W-BYHR213W-B YGR161W-CQ3E744 92 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.7 ms