Protein–RNA interactions for Protein: Q12257

YDL177C, IMPACT family member YDL177C, yeastyeast

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL177CQ12257 NSR1YGR159C 1245 nt18.43■□□□□ 0.54
YDL177CQ12257 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.3■□□□□ 0.52
YDL177CQ12257 NOP1YDL014W 984 nt17.98■□□□□ 0.47
YDL177CQ12257 YKL036CYKL036C 393 nt16.9■□□□□ 0.3
YDL177CQ12257 MDJ1YFL016C 1536 nt16.55■□□□□ 0.24
YDL177CQ12257 Q0297Q0297 156 nt15.85■□□□□ 0.13
YDL177CQ12257 YJL027CYJL027C 417 nt15.83■□□□□ 0.12
YDL177CQ12257 SRX1YKL086W 384 nt15.69■□□□□ 0.1
YDL177CQ12257 SCS3YGL126W 1143 nt15.53■□□□□ 0.08
YDL177CQ12257 YCR051WYCR051W 669 nt14.89□□□□□ -0.03
YDL177CQ12257 YOL085CYOL085C 342 nt14.62□□□□□ -0.07
YDL177CQ12257 DBP2YNL112W 1641 nt14.56□□□□□ -0.08
YDL177CQ12257 PKP1YIL042C 1185 nt14.3□□□□□ -0.12
YDL177CQ12257 SCJ1YMR214W 1134 nt14.28□□□□□ -0.12
YDL177CQ12257 RPP1BYDL130W 321 nt14.21□□□□□ -0.13
YDL177CQ12257 YBR190WYBR190W 312 nt14.2□□□□□ -0.14
YDL177CQ12257 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.12□□□□□ -0.15
YDL177CQ12257 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.12□□□□□ -0.15
YDL177CQ12257 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.12□□□□□ -0.15
YDL177CQ12257 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.12□□□□□ -0.15
YDL177CQ12257 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.12□□□□□ -0.15
YDL177CQ12257 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.12□□□□□ -0.15
YDL177CQ12257 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.12□□□□□ -0.15
YDL177CQ12257 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.12□□□□□ -0.15
YDL177CQ12257 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.12□□□□□ -0.15
YDL177CQ12257 ATS1YAL020C 1002 nt14.02□□□□□ -0.17
YDL177CQ12257 CCC1YLR220W 969 nt14□□□□□ -0.17
YDL177CQ12257 RTC3YHR087W 336 nt13.86□□□□□ -0.19
YDL177CQ12257 RVS167YDR388W 1449 nt13.63□□□□□ -0.23
YDL177CQ12257 SCR1SCR1 522 nt13.5□□□□□ -0.25
YDL177CQ12257 PET122YER153C 765 nt13.49□□□□□ -0.25
YDL177CQ12257 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.33□□□□□ -0.28
YDL177CQ12257 RRN5YLR141W 1092 nt13.17□□□□□ -0.3
YDL177CQ12257 SHR5YOL110W 714 nt13.11□□□□□ -0.31
YDL177CQ12257 PUT4YOR348C 1884 nt13.05□□□□□ -0.32
YDL177CQ12257 RSB1YOR049C 1065 nt12.98□□□□□ -0.33
YDL177CQ12257 PST2YDR032C 597 nt12.93□□□□□ -0.34
YDL177CQ12257 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.92□□□□□ -0.34
YDL177CQ12257 YDJ1YNL064C 1230 nt12.92□□□□□ -0.34
YDL177CQ12257 URN1YPR152C 1398 nt12.89□□□□□ -0.35
YDL177CQ12257 DEP1YAL013W 1218 nt12.82□□□□□ -0.36
YDL177CQ12257 OPI9YLR338W 858 nt12.75□□□□□ -0.37
YDL177CQ12257 ARE1YCR048W 1833 nt12.74□□□□□ -0.37
YDL177CQ12257 SAH1YER043C 1350 nt12.73□□□□□ -0.37
YDL177CQ12257 SSA3YBL075C 1950 nt12.7□□□□□ -0.38
YDL177CQ12257 POA1YBR022W 534 nt12.65□□□□□ -0.38
YDL177CQ12257 RPN10YHR200W 807 nt12.63□□□□□ -0.39
YDL177CQ12257 GAR1YHR089C 618 nt12.61□□□□□ -0.39
YDL177CQ12257 YNL208WYNL208W 600 nt12.6□□□□□ -0.39
YDL177CQ12257 YKL097CYKL097C 411 nt12.59□□□□□ -0.39
YDL177CQ12257 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.56□□□□□ -0.4
YDL177CQ12257 BSC6YOL137W 1494 nt12.39□□□□□ -0.43
YDL177CQ12257 PUN1YLR414C 792 nt12.37□□□□□ -0.43
YDL177CQ12257 SHU1YHL006C 453 nt12.29□□□□□ -0.44
YDL177CQ12257 YJR018WYJR018W 363 nt12.29□□□□□ -0.44
YDL177CQ12257 BUD23YCR047C 828 nt12.27□□□□□ -0.45
YDL177CQ12257 PTC2YER089C 1395 nt12.27□□□□□ -0.45
YDL177CQ12257 TIR1YER011W 765 nt12.21□□□□□ -0.45
YDL177CQ12257 NAB2YGL122C 1578 nt12.14□□□□□ -0.47
YDL177CQ12257 SSA1YAL005C 1929 nt12.1□□□□□ -0.47
YDL177CQ12257 YJR120WYJR120W 351 nt12.04□□□□□ -0.48
YDL177CQ12257 YOR139CYOR139C 393 nt12□□□□□ -0.49
YDL177CQ12257 SPT5YML010W 3192 nt11.99□□□□□ -0.49
YDL177CQ12257 RPP2BYDR382W 333 nt11.97□□□□□ -0.49
YDL177CQ12257 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.97□□□□□ -0.49
YDL177CQ12257 DAL1YIR027C 1383 nt11.92□□□□□ -0.5
YDL177CQ12257 FIS1YIL065C 468 nt11.91□□□□□ -0.5
YDL177CQ12257 INM2YDR287W 879 nt11.9□□□□□ -0.5
YDL177CQ12257 FPR4YLR449W 1179 nt11.9□□□□□ -0.5
YDL177CQ12257 SRB2YHR041C 633 nt11.85□□□□□ -0.51
YDL177CQ12257 NPL3YDR432W 1245 nt11.84□□□□□ -0.51
YDL177CQ12257 PHO4YFR034C 939 nt11.8□□□□□ -0.52
YDL177CQ12257 YBL100CYBL100C 315 nt11.72□□□□□ -0.53
YDL177CQ12257 YGR021WYGR021W 873 nt11.7□□□□□ -0.54
YDL177CQ12257 BDH2YAL061W 1254 nt11.69□□□□□ -0.54
YDL177CQ12257 YPS1YLR120C 1710 nt11.66□□□□□ -0.54
YDL177CQ12257 MEP2YNL142W 1500 nt11.66□□□□□ -0.54
YDL177CQ12257 HOM6YJR139C 1080 nt11.66□□□□□ -0.54
YDL177CQ12257 SSA4YER103W 1929 nt11.65□□□□□ -0.54
YDL177CQ12257 WWM1YFL010C 636 nt11.63□□□□□ -0.55
YDL177CQ12257 YOL037CYOL037C 354 nt11.61□□□□□ -0.55
YDL177CQ12257 MNP1YGL068W 585 nt11.59□□□□□ -0.55
YDL177CQ12257 FUN26YAL022C 1554 nt11.58□□□□□ -0.56
YDL177CQ12257 YDR095CYDR095C 411 nt11.55□□□□□ -0.56
YDL177CQ12257 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.55□□□□□ -0.56
YDL177CQ12257 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.54□□□□□ -0.56
YDL177CQ12257 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.54□□□□□ -0.56
YDL177CQ12257 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.54□□□□□ -0.56
YDL177CQ12257 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.54□□□□□ -0.56
YDL177CQ12257 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.54□□□□□ -0.56
YDL177CQ12257 Q0182Q0182 405 nt11.54□□□□□ -0.56
YDL177CQ12257 TRM9YML014W 840 nt11.53□□□□□ -0.56
YDL177CQ12257 LSM3YLR438C-A 270 nt11.52□□□□□ -0.57
YDL177CQ12257 MOT3YMR070W 1473 nt11.5□□□□□ -0.57
YDL177CQ12257 RKM5YLR137W 1104 nt11.48□□□□□ -0.57
YDL177CQ12257 DCW1YKL046C 1350 nt11.47□□□□□ -0.57
YDL177CQ12257 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.46□□□□□ -0.57
YDL177CQ12257 ALF1YNL148C 765 nt11.45□□□□□ -0.58
YDL177CQ12257 CCT6YDR188W 1641 nt11.41□□□□□ -0.58
YDL177CQ12257 RPP2AYOL039W 321 nt11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms