RNA–Protein interactions for RNA: YMR219W

ESC1, Transcript of Protein localized to the nuclear periphery, yeast

Gene ESC1, Length 4,977 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ESC1	YMR219W	YIR014W	P40570	242 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	CDC11	P32458	415 aa		3	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	BUD2	P33314	1104 aa		3	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	RAD9	P14737	1309 aa		3	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	GIN4	Q12263	1142 aa		3	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	MPC54	Q08550	464 aa		3	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	ISW1	P38144	1129 aa		3	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	YLL054C	Q12244	843 aa		3	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	MSP1	P28737	362 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	SMC1	P32908	1225 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	TTI1	P36097	1038 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	SAP190	P36123	1033 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	MED8	P38304	223 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	ECM1	P39715	212 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	ITC1	P53125	1264 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	PCT1	P13259	424 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	PDS5	Q04264	1277 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	KAR3	P17119	729 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	RAD51	P25454	400 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	BDP1	P46678	594 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	LAM6	Q08001	693 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	PIF1	P07271	859 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	SWH1	P35845	1188 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	ERV41	Q04651	352 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	ALG2	P43636	503 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	GLE1	Q12315	538 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	SPE2	P21182	396 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	CIN4	P39110	191 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	IPL1	P38991	367 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	NDC80	P40460	691 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	RPC82	P32349	654 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	TAF5	P38129	798 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	PEA2	P40091	420 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	YDL073W	Q07454	984 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	SEC9	P40357	651 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	RSC1	P53236	928 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	MAK10	Q02197	733 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	TAF8	Q03750	510 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	SQT1	P35184	431 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	PEX14	P53112	341 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	PSK2	Q08217	1101 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	SSP2	Q08646	371 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ESC1	YMR219W	HOS4	P40480	1083 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	HUL5	P53119	910 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	SFI1	Q12369	946 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	VID30	P53076	958 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	JJJ1	P53863	590 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	SEC39	Q12745	709 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	MGA2	P40578	1113 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	ALD3	P54114	506 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	LCD1	Q04377	747 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	MSH6	Q03834	1242 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	SSM4	P40318	1319 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	IML1	P47170	1584 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	PSO2	P30620	661 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	RIM101	P33400	625 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	EPS1	P40557	701 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	SDH5	Q08230	162 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	RAD3	P06839	778 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	PUP2	P32379	260 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	YKR018C	P36114	725 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	YOR389W	Q08912	624 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	COS5	P47187	383 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ESC1	YMR219W	RTC4	P53850	401 aa		2.95	□□□□□ -1.94

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