Protein–RNA interactions for Protein: P36114

YKR018C, IML2-like protein YKR018C, yeastyeast

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR018CP36114 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.33■■□□□ 1.33
YKR018CP36114 NOP1YDL014W 984 nt22.91■■□□□ 1.26
YKR018CP36114 NSR1YGR159C 1245 nt22.86■■□□□ 1.25
YKR018CP36114 YKL036CYKL036C 393 nt21.45■■□□□ 1.02
YKR018CP36114 Q0297Q0297 156 nt20.11■□□□□ 0.81
YKR018CP36114 YJL027CYJL027C 417 nt20.1■□□□□ 0.81
YKR018CP36114 SRX1YKL086W 384 nt19.95■□□□□ 0.78
YKR018CP36114 MDJ1YFL016C 1536 nt19.86■□□□□ 0.77
YKR018CP36114 SCS3YGL126W 1143 nt19.65■□□□□ 0.74
YKR018CP36114 YCR051WYCR051W 669 nt18.99■□□□□ 0.63
YKR018CP36114 YOL085CYOL085C 342 nt18.51■□□□□ 0.55
YKR018CP36114 PKP1YIL042C 1185 nt18.17■□□□□ 0.5
YKR018CP36114 RPP1BYDL130W 321 nt18.05■□□□□ 0.48
YKR018CP36114 SCJ1YMR214W 1134 nt17.97■□□□□ 0.47
YKR018CP36114 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.78■□□□□ 0.44
YKR018CP36114 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.78■□□□□ 0.44
YKR018CP36114 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.78■□□□□ 0.44
YKR018CP36114 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.78■□□□□ 0.44
YKR018CP36114 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.78■□□□□ 0.44
YKR018CP36114 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.78■□□□□ 0.44
YKR018CP36114 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.78■□□□□ 0.44
YKR018CP36114 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.78■□□□□ 0.44
YKR018CP36114 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.78■□□□□ 0.44
YKR018CP36114 ATS1YAL020C 1002 nt17.7■□□□□ 0.42
YKR018CP36114 DBP2YNL112W 1641 nt17.67■□□□□ 0.42
YKR018CP36114 CCC1YLR220W 969 nt17.63■□□□□ 0.41
YKR018CP36114 SCR1SCR1 522 nt17.2■□□□□ 0.34
YKR018CP36114 PET122YER153C 765 nt17.16■□□□□ 0.34
YKR018CP36114 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.97■□□□□ 0.31
YKR018CP36114 YBR190WYBR190W 312 nt16.9■□□□□ 0.3
YKR018CP36114 RVS167YDR388W 1449 nt16.89■□□□□ 0.29
YKR018CP36114 RRN5YLR141W 1092 nt16.72■□□□□ 0.27
YKR018CP36114 RTC3YHR087W 336 nt16.58■□□□□ 0.24
YKR018CP36114 RSB1YOR049C 1065 nt16.54■□□□□ 0.24
YKR018CP36114 YDJ1YNL064C 1230 nt16.44■□□□□ 0.22
YKR018CP36114 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.39■□□□□ 0.21
YKR018CP36114 SHR5YOL110W 714 nt16.33■□□□□ 0.2
YKR018CP36114 PST2YDR032C 597 nt16.3■□□□□ 0.2
YKR018CP36114 GAR1YHR089C 618 nt15.99■□□□□ 0.15
YKR018CP36114 YKL097CYKL097C 411 nt15.93■□□□□ 0.14
YKR018CP36114 SSA3YBL075C 1950 nt15.82■□□□□ 0.12
YKR018CP36114 DEP1YAL013W 1218 nt15.7■□□□□ 0.1
YKR018CP36114 URN1YPR152C 1398 nt15.62■□□□□ 0.09
YKR018CP36114 RPN10YHR200W 807 nt15.59■□□□□ 0.09
YKR018CP36114 YNL208WYNL208W 600 nt15.56■□□□□ 0.08
YKR018CP36114 SHU1YHL006C 453 nt15.54■□□□□ 0.08
YKR018CP36114 TIR1YER011W 765 nt15.44■□□□□ 0.06
YKR018CP36114 OPI9YLR338W 858 nt15.31■□□□□ 0.04
YKR018CP36114 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.17■□□□□ 0.02
YKR018CP36114 YOR139CYOR139C 393 nt15.11■□□□□ 0.01
YKR018CP36114 SSA1YAL005C 1929 nt15.1■□□□□ 0.01
YKR018CP36114 SAH1YER043C 1350 nt15.07■□□□□ 0
YKR018CP36114 NPL3YDR432W 1245 nt15.04■□□□□ -0
YKR018CP36114 YJR018WYJR018W 363 nt14.95□□□□□ -0.02
YKR018CP36114 PUT4YOR348C 1884 nt14.95□□□□□ -0.02
YKR018CP36114 YGR021WYGR021W 873 nt14.92□□□□□ -0.02
YKR018CP36114 PUN1YLR414C 792 nt14.92□□□□□ -0.02
YKR018CP36114 RPP2BYDR382W 333 nt14.83□□□□□ -0.04
YKR018CP36114 SRB2YHR041C 633 nt14.82□□□□□ -0.04
YKR018CP36114 HOM6YJR139C 1080 nt14.8□□□□□ -0.04
YKR018CP36114 ARE1YCR048W 1833 nt14.79□□□□□ -0.04
YKR018CP36114 WWM1YFL010C 636 nt14.79□□□□□ -0.04
YKR018CP36114 MNP1YGL068W 585 nt14.76□□□□□ -0.05
YKR018CP36114 YOL037CYOL037C 354 nt14.76□□□□□ -0.05
YKR018CP36114 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.66□□□□□ -0.06
YKR018CP36114 YJR120WYJR120W 351 nt14.66□□□□□ -0.06
YKR018CP36114 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.61□□□□□ -0.07
YKR018CP36114 PTC2YER089C 1395 nt14.6□□□□□ -0.07
YKR018CP36114 RKM5YLR137W 1104 nt14.6□□□□□ -0.07
YKR018CP36114 POA1YBR022W 534 nt14.55□□□□□ -0.08
YKR018CP36114 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.53□□□□□ -0.08
YKR018CP36114 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.53□□□□□ -0.08
YKR018CP36114 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.53□□□□□ -0.08
YKR018CP36114 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.53□□□□□ -0.08
YKR018CP36114 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.53□□□□□ -0.08
YKR018CP36114 BDH2YAL061W 1254 nt14.53□□□□□ -0.08
YKR018CP36114 LSM3YLR438C-A 270 nt14.42□□□□□ -0.1
YKR018CP36114 BUD23YCR047C 828 nt14.4□□□□□ -0.1
YKR018CP36114 INM2YDR287W 879 nt14.4□□□□□ -0.1
YKR018CP36114 NAB2YGL122C 1578 nt14.39□□□□□ -0.11
YKR018CP36114 PUS2YGL063W 1113 nt14.34□□□□□ -0.11
YKR018CP36114 YLR281CYLR281C 468 nt14.32□□□□□ -0.12
YKR018CP36114 FPR4YLR449W 1179 nt14.29□□□□□ -0.12
YKR018CP36114 YBL100CYBL100C 315 nt14.29□□□□□ -0.12
YKR018CP36114 DAL1YIR027C 1383 nt14.28□□□□□ -0.12
YKR018CP36114 WHI5YOR083W 888 nt14.23□□□□□ -0.13
YKR018CP36114 BSC6YOL137W 1494 nt14.21□□□□□ -0.13
YKR018CP36114 TRM9YML014W 840 nt14.21□□□□□ -0.13
YKR018CP36114 SPT5YML010W 3192 nt14.2□□□□□ -0.14
YKR018CP36114 FIS1YIL065C 468 nt14.15□□□□□ -0.14
YKR018CP36114 MOT3YMR070W 1473 nt14.13□□□□□ -0.15
YKR018CP36114 PHO4YFR034C 939 nt14.12□□□□□ -0.15
YKR018CP36114 FUN26YAL022C 1554 nt14.12□□□□□ -0.15
YKR018CP36114 IMP2'YIL154C 1041 nt14.02□□□□□ -0.17
YKR018CP36114 SSA4YER103W 1929 nt14.02□□□□□ -0.17
YKR018CP36114 DSK2YMR276W 1122 nt14□□□□□ -0.17
YKR018CP36114 CCT6YDR188W 1641 nt14□□□□□ -0.17
YKR018CP36114 FMP45YDL222C 930 nt13.97□□□□□ -0.17
YKR018CP36114 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.96□□□□□ -0.17
YKR018CP36114 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.8 ms