RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W CWH41P53008 833 aa12.54□□□□□ -0.4
YLR349WYLR349W GRX1P25373 110 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
YLR349WYLR349W PEX21P50091 288 aa12.53□□□□□ -0.4
YLR349WYLR349W OSM1P21375 501 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
YLR349WYLR349W PUS5Q06244 254 aa12.52□□□□□ -0.41
YLR349WYLR349W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
YLR349WYLR349W YKL222CP35995 705 aa12.51□□□□□ -0.41
YLR349WYLR349W ERT1P38140 529 aa12.51□□□□□ -0.41
YLR349WYLR349W RTF1P53064 558 aa12.51□□□□□ -0.41
YLR349WYLR349W INP54Q08227 384 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
YLR349WYLR349W AUS1Q08409 1394 aa12.51□□□□□ -0.41
YLR349WYLR349W PDI1P17967 522 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
YLR349WYLR349W RRT14P40470 206 aa12.47□□□□□ -0.41
YLR349WYLR349W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
YLR349WYLR349W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
YLR349WYLR349W FKH1P40466 484 aa12.45□□□□□ -0.42
YLR349WYLR349W CTI6Q08923 506 aa12.45□□□□□ -0.42
YLR349WYLR349W YBP2P53169 641 aa12.44□□□□□ -0.42
YLR349WYLR349W FAP1P53971 965 aa12.42□□□□□ -0.42
YLR349WYLR349W HIM1Q06674 414 aa12.42□□□□□ -0.42
YLR349WYLR349W FPK1P53739 893 aa12.41□□□□□ -0.42
YLR349WYLR349W TOP1P04786 769 aa12.4□□□□□ -0.42
YLR349WYLR349W RTG3P38165 486 aa12.4□□□□□ -0.42
YLR349WYLR349W SLI15P38283 698 aa12.4□□□□□ -0.42
YLR349WYLR349W SMY1P32364 656 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
YLR349WYLR349W NYV1Q12255 253 aa12.38□□□□□ -0.43
YLR349WYLR349W GRX4P32642 244 aa12.37□□□□□ -0.43
YLR349WYLR349W NUP145P49687 1317 aa12.37□□□□□ -0.43
YLR349WYLR349W THS1P04801 734 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
YLR349WYLR349W TAP42Q04372 366 aa12.36□□□□□ -0.43
YLR349WYLR349W UTP10P42945 1769 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
YLR349WYLR349W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data12.35□□□□□ -0.43not detected
YLR349WYLR349W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data12.34□□□□□ -0.43not detected
YLR349WYLR349W NST1P53935 1240 aa12.34□□□□□ -0.43
YLR349WYLR349W PMD1P32634 1753 aa12.33□□□□□ -0.44
YLR349WYLR349W SCT1P32784 759 aa12.32□□□□□ -0.44
YLR349WYLR349W PFF1P38244 976 aa12.32□□□□□ -0.44
YLR349WYLR349W TEA1P47988 759 aa12.32□□□□□ -0.44
YLR349WYLR349W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
YLR349WYLR349W HSP104P31539 908 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
YLR349WYLR349W DUS1P53759 423 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
YLR349WYLR349W YLR278CQ05854 1341 aa12.31□□□□□ -0.44
YLR349WYLR349W FAS2P19097 1887 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
YLR349WYLR349W RET1P22276 1149 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
YLR349WYLR349W ATG20Q07528 640 aa12.28□□□□□ -0.44
YLR349WYLR349W LPD1P09624 499 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
YLR349WYLR349W ETP1P38748 585 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
YLR349WYLR349W DSD1P53095 428 aa12.27□□□□□ -0.45
YLR349WYLR349W CAF20P12962 161 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
YLR349WYLR349W SER1P33330 395 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
YLR349WYLR349W RMT2Q03305 412 aa12.25□□□□□ -0.45
YLR349WYLR349W KAR2P16474 682 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
YLR349WYLR349W RTG2P32608 588 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
YLR349WYLR349W ERO1Q03103 563 aa12.23□□□□□ -0.45
YLR349WYLR349W SHC1P39000 512 aa12.22□□□□□ -0.45
YLR349WYLR349W VHR2P40041 505 aa12.22□□□□□ -0.45
YLR349WYLR349W IRC3Q06683 689 aa12.22□□□□□ -0.45
YLR349WYLR349W ALE1Q08548 619 aa12.21□□□□□ -0.45
YLR349WYLR349W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
YLR349WYLR349W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
YLR349WYLR349W YGL082WP53155 381 aa12.2□□□□□ -0.46
YLR349WYLR349W BDF2Q07442 638 aa12.2□□□□□ -0.46
YLR349WYLR349W FIG2P25653 1609 aa12.19□□□□□ -0.46
YLR349WYLR349W YKU70P32807 602 aa12.19□□□□□ -0.46
YLR349WYLR349W CTF4Q01454 927 aa12.19□□□□□ -0.46
YLR349WYLR349W RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
YLR349WYLR349W POM152P39685 1337 aa12.18□□□□□ -0.46
YLR349WYLR349W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
YLR349WYLR349W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
YLR349WYLR349W YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
YLR349WYLR349W PHM7Q12252 991 aa12.15□□□□□ -0.46
YLR349WYLR349W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
YLR349WYLR349W PAP2P53632 584 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
YLR349WYLR349W MDG1P53885 366 aa12.14□□□□□ -0.47
YLR349WYLR349W AOS1Q06624 347 aa12.14□□□□□ -0.47
YLR349WYLR349W FET4P40988 552 aa12.13□□□□□ -0.47
YLR349WYLR349W SDH2P21801 266 aa12.12□□□□□ -0.47
YLR349WYLR349W YIL089WP40500 205 aa12.12□□□□□ -0.47
YLR349WYLR349W GRX6Q12438 231 aa12.12□□□□□ -0.47
YLR349WYLR349W SIT4P20604 311 aa12.11□□□□□ -0.47
YLR349WYLR349W KCC4P25389 1037 aa12.11□□□□□ -0.47
YLR349WYLR349W AIM7Q12156 149 aa12.09□□□□□ -0.47
YLR349WYLR349W DCD1P06773 312 aa12.07□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W RPN1P38764 993 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W UBP16Q02863 499 aa12.07□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W MSM1P22438 575 aa12.06□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W PDS5Q04264 1277 aa12.06□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W SSP2Q08646 371 aa12.06□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W HKR1P41809 1802 aa12.06□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W ARG8P18544 423 aa12.05□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W FRD1P32614 470 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W NTH2P35172 780 aa12.05□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W TIM50Q02776 476 aa12.05□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W SAS4Q04003 481 aa12.05□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W TRK1P12685 1235 aa12.04□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W GLC3P32775 704 aa12.04□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W DPL1Q05567 589 aa12.04□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W VPS13Q07878 3144 aa12.03□□□□□ -0.48
YLR349WYLR349W APL2P36000 726 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45.4 ms