RNA–Protein interactions for RNA: YHR206W

SKN7, Transcript of Nuclear response regulator and transcription factor, yeast

Gene SKN7, Length 1,869 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKN7	YHR206W	APP1	P53933	587 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SKN7	YHR206W	TEC1	P18412	486 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	AFT1	P22149	690 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	CSE4	P36012	229 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	BRE2	P43132	505 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	DMA2	P53924	522 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	ISF1	P32488	338 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	YJL007C	P47080	104 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	HST3	P53687	447 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	YNL108C	P53929	270 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	MCM16	Q12262	181 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	YJR115W	P47152	169 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	YBL086C	P38177	466 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	ATG32	P40458	529 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	FRA1	Q07825	749 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	BIM1	P40013	344 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	EMP47	P43555	445 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	GUT2	P32191	649 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	AIM44	Q99299	758 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SKN7	YHR206W	UGA3	P26370	528 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	GCR2	Q01722	534 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	APL6	P46682	809 aa		5	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	IOC4	Q04213	475 aa		5	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	MET22	P32179	357 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	RIM21	P48565	533 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	MKS1	P34072	584 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	DFG5	Q05031	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	ATG20	Q07528	640 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	FBP26	P32604	452 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
SKN7	YHR206W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	AAD14	P42884	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	MRX10	Q05648	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	ENV9	Q08651	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	STE6	P12866	1290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	DLD1	P32891	587 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	MRX12	P47084	519 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	ISU1	Q03020	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	SOH1	P38633	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	SRF1	Q12516	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	RTT106	P40161	455 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	YPP1	P46951	817 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	OPT2	Q06593	877 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	NUP85	P46673	744 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	BDS1	Q08347	646 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	ARG82	P07250	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	YJR098C	P47139	656 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SKN7	YHR206W	PEP12	P32854	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	HDA3	Q06623	655 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
SKN7	YHR206W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	WTM2	Q12206	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	MIP1	P15801	1254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	UTR2	P32623	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	LSC2	P53312	427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	ATG3	P40344	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	RLF2	Q12495	606 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	SLX8	P40072	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	KTR7	P40504	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	TTI1	P36097	1038 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	SCW11	P53189	542 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	CAF120	P53836	1060 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SKN7	YHR206W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
SKN7	YHR206W	SSN3	P39073	555 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SKN7	YHR206W	ACO2	P39533	789 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SKN7	YHR206W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SKN7	YHR206W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SKN7	YHR206W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SKN7	YHR206W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.1 ms