RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623687.1

DUX4L28-201, Transcript of double homeobox 4 like 28, humanhuman

BASIC

Gene DUX4L28, Length 678 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L28-201ENST00000623687 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.64■■■■■ 4.26
DUX4L28-201ENST00000623687 STRCQ7RTU9 1775 aa41.63■■■■■ 4.26
DUX4L28-201ENST00000623687 DAPK1P53355 1430 aa41.63■■■■■ 4.26
DUX4L28-201ENST00000623687 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
DUX4L28-201ENST00000623687 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.59■■■■■ 4.25
DUX4L28-201ENST00000623687 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.58■■■■■ 4.25
DUX4L28-201ENST00000623687 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
DUX4L28-201ENST00000623687 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.53■■■■■ 4.24
DUX4L28-201ENST00000623687 KIF15Q9NS87 1388 aa41.52■■■■■ 4.24
DUX4L28-201ENST00000623687 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.51■■■■■ 4.24
DUX4L28-201ENST00000623687 PZPP20742 1482 aa41.48■■■■■ 4.23
DUX4L28-201ENST00000623687 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
DUX4L28-201ENST00000623687 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
DUX4L28-201ENST00000623687 ABCC3O15438 1527 aa41.46■■■■■ 4.23
DUX4L28-201ENST00000623687 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
DUX4L28-201ENST00000623687 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.45■■■■■ 4.23
DUX4L28-201ENST00000623687 ERBINQ96RT1 1412 aa41.44■■■■■ 4.22
DUX4L28-201ENST00000623687 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.43■■■■■ 4.22
DUX4L28-201ENST00000623687 CEP152O94986 1710 aa41.42■■■■■ 4.22
DUX4L28-201ENST00000623687 NCOA1Q15788 1441 aa41.42■■■■■ 4.22
DUX4L28-201ENST00000623687 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
DUX4L28-201ENST00000623687 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
DUX4L28-201ENST00000623687 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.41■■■■■ 4.22
DUX4L28-201ENST00000623687 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.37■■■■■ 4.21
DUX4L28-201ENST00000623687 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
DUX4L28-201ENST00000623687 TNRQ92752 1358 aa41.36■■■■■ 4.21
DUX4L28-201ENST00000623687 ADGRL2O95490 1459 aa41.35■■■■■ 4.21
DUX4L28-201ENST00000623687 DEPDC5O75140 1603 aa41.35■■■■■ 4.21
DUX4L28-201ENST00000623687 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.34■■■■■ 4.21
DUX4L28-201ENST00000623687 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.34■■■■■ 4.21
DUX4L28-201ENST00000623687 PTPRTO14522 1441 aa41.31■■■■■ 4.2
DUX4L28-201ENST00000623687 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
DUX4L28-201ENST00000623687 PLA2R1Q13018 1463 aa41.28■■■■■ 4.2
DUX4L28-201ENST00000623687 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.25■■■■■ 4.19
DUX4L28-201ENST00000623687 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
DUX4L28-201ENST00000623687 ERVK-7P63135 1459 aa41.21■■■■■ 4.19
DUX4L28-201ENST00000623687 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.2■■■■■ 4.19
DUX4L28-201ENST00000623687 NLRP1Q9C000 1473 aa41.19■■■■■ 4.18
DUX4L28-201ENST00000623687 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.18■■■■■ 4.18
DUX4L28-201ENST00000623687 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.16■■■■■ 4.18
DUX4L28-201ENST00000623687 FBXO41Q8TF61 875 aa41.16■■■■■ 4.18
DUX4L28-201ENST00000623687 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.13■■■■■ 4.17
DUX4L28-201ENST00000623687 CERKQ8TCT0 537 aa41.12■■■■■ 4.17
DUX4L28-201ENST00000623687 KANK1Q14678 1352 aa41.12■■■■■ 4.17
DUX4L28-201ENST00000623687 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
DUX4L28-201ENST00000623687 PKD2Q13563 968 aa41.11■■■■■ 4.17
DUX4L28-201ENST00000623687 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.11■■■■■ 4.17
DUX4L28-201ENST00000623687 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.1■■■■■ 4.17
DUX4L28-201ENST00000623687 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.1■■■■■ 4.17
DUX4L28-201ENST00000623687 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.06■■■■■ 4.16
DUX4L28-201ENST00000623687 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.05■■■■■ 4.16
DUX4L28-201ENST00000623687 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.04■■■■■ 4.16
DUX4L28-201ENST00000623687 ROCK1Q13464 1354 aa41.03■■■■■ 4.16
DUX4L28-201ENST00000623687 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.99■■■■■ 4.15
DUX4L28-201ENST00000623687 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.99■■■■■ 4.15
DUX4L28-201ENST00000623687 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
DUX4L28-201ENST00000623687 UNC13BO14795 1591 aa40.97■■■■■ 4.15
DUX4L28-201ENST00000623687 ITGAEP38570 1179 aa40.97■■■■■ 4.15
DUX4L28-201ENST00000623687 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
DUX4L28-201ENST00000623687 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
DUX4L28-201ENST00000623687 PIK3C2BO00750 1634 aa40.89■■■■■ 4.14
DUX4L28-201ENST00000623687 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.89■■■■■ 4.14
DUX4L28-201ENST00000623687 SYNMO15061 1565 aa40.89■■■■■ 4.14
DUX4L28-201ENST00000623687 TET3O43151 1660 aa40.88■■■■■ 4.14
DUX4L28-201ENST00000623687 MED14O60244 1454 aa40.85■■■■■ 4.13
DUX4L28-201ENST00000623687 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.85■■■■■ 4.13
DUX4L28-201ENST00000623687 NOS1P29475 1434 aa40.84■■■■■ 4.13
DUX4L28-201ENST00000623687 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
DUX4L28-201ENST00000623687 IQGAP1P46940 1657 aa40.81■■■■■ 4.12
DUX4L28-201ENST00000623687 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
DUX4L28-201ENST00000623687 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.79■■■■■ 4.12
DUX4L28-201ENST00000623687 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
DUX4L28-201ENST00000623687 SLIT1O75093 1534 aa40.77■■■■■ 4.12
DUX4L28-201ENST00000623687 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.77■■■■■ 4.12
DUX4L28-201ENST00000623687 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.77■■■■■ 4.12
DUX4L28-201ENST00000623687 E9PCH4 1651 aa40.74■■■■■ 4.11
DUX4L28-201ENST00000623687 IDI1Q13907 227 aa40.73■■■■■ 4.11
DUX4L28-201ENST00000623687 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
DUX4L28-201ENST00000623687 ADGRB3O60242 1522 aa40.67■■■■■ 4.1
DUX4L28-201ENST00000623687 NUP155O75694 1391 aa40.66■■■■■ 4.1
DUX4L28-201ENST00000623687 LTKP29376 864 aa40.66■■■■■ 4.1
DUX4L28-201ENST00000623687 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.64■■■■■ 4.1
DUX4L28-201ENST00000623687 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.64■■■■■ 4.1
DUX4L28-201ENST00000623687 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.62■■■■■ 4.09
DUX4L28-201ENST00000623687 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.62■■■■■ 4.09
DUX4L28-201ENST00000623687 CPS1P31327 1500 aa40.62■■■■■ 4.09
DUX4L28-201ENST00000623687 NAIPQ13075 1403 aa40.61■■■■■ 4.09
DUX4L28-201ENST00000623687 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.6■■■■■ 4.09
DUX4L28-201ENST00000623687 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.58■■■■■ 4.09
DUX4L28-201ENST00000623687 EID1Q9Y6B2 187 aa40.55■■■■■ 4.08
DUX4L28-201ENST00000623687 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.53■■■■■ 4.08
DUX4L28-201ENST00000623687 HFM1A2PYH4 1435 aa40.49■■■■■ 4.07
DUX4L28-201ENST00000623687 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.45■■■■■ 4.07
DUX4L28-201ENST00000623687 ZFYVE9O95405 1425 aa40.42■■■■■ 4.06
DUX4L28-201ENST00000623687 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.41■■■■■ 4.06
DUX4L28-201ENST00000623687 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.38■■■■■ 4.06
DUX4L28-201ENST00000623687 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.36■■■■■ 4.05
DUX4L28-201ENST00000623687 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
DUX4L28-201ENST00000623687 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.29■■■■■ 4.04
DUX4L28-201ENST00000623687 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms