RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
LETMD1-238	ENST00000623495	PKD2	Q13563	968 aa		10.4	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP7A	Q04656	1500 aa		10.39	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	NCOA1	Q15788	1441 aa		10.39	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	ZMYM3	Q14202	1370 aa		10.36	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	KANK1	Q14678	1352 aa		10.36	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		10.36	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		10.36	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		10.35	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		10.35	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		10.35	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
LETMD1-238	ENST00000623495	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCA6	Q8N139	1617 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	RICTOR	Q6R327	1708 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	NAIP	Q13075	1403 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	IDI1	Q13907	227 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	PTPRM	P28827	1452 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	KDM5C	P41229	1560 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	MADD	Q8WXG6	1647 aa		10.27	□□□□□ -0.76
LETMD1-238	ENST00000623495	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	TNR	Q92752	1358 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	HFM1	A2PYH4	1435 aa		10.25	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	PLEKHG5	O94827	1062 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	ROCK1	Q13464	1354 aa		10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	C14orf37	Q86TY3	774 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	STK26	Q9P289	416 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	NPAT	Q14207	1427 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	EID1	Q9Y6B2	187 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		10.21	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	NUTM2F	A1L443	756 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	LTK	P29376	864 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	ADGRL2	O95490	1459 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCC3	O15438	1527 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	PIP4K2B	P78356	416 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-238	ENST00000623495	AGL	P35573	1532 aa		10.15	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	PLXNC1	O60486	1568 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	ERVK-7	P63135	1459 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-238	ENST00000623495	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		10.12	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.2 ms