RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 KIF15Q9NS87 1388 aa38.39■■■■□ 3.74
PMS1-220ENST00000618056 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
PMS1-220ENST00000618056 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.35■■■■□ 3.73
PMS1-220ENST00000618056 NPATQ14207 1427 aa38.35■■■■□ 3.73
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.33■■■■□ 3.73
PMS1-220ENST00000618056 ADGRL2O95490 1459 aa38.32■■■■□ 3.73
PMS1-220ENST00000618056 ERBINQ96RT1 1412 aa38.32■■■■□ 3.73
PMS1-220ENST00000618056 NCOA1Q15788 1441 aa38.31■■■■□ 3.72
PMS1-220ENST00000618056 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa38.3■■■■□ 3.72
PMS1-220ENST00000618056 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.3■■■■□ 3.72
PMS1-220ENST00000618056 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.29■■■■□ 3.72
PMS1-220ENST00000618056 CHIC2Q9UKJ5 165 aa38.28■■■■□ 3.72
PMS1-220ENST00000618056 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP38.26■■■■□ 3.72
PMS1-220ENST00000618056 PTPRKQ15262 1439 aa38.26■■■■□ 3.72
PMS1-220ENST00000618056 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP38.26■■■■□ 3.71
PMS1-220ENST00000618056 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.25■■■■□ 3.71
PMS1-220ENST00000618056 HSPA2P54652 639 aa38.23■■■■□ 3.71
PMS1-220ENST00000618056 DEPDC5O75140 1603 aa38.2■■■■□ 3.71
PMS1-220ENST00000618056 ABCC3O15438 1527 aa38.19■■■■□ 3.7
PMS1-220ENST00000618056 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
PMS1-220ENST00000618056 PZPP20742 1482 aa38.18■■■■□ 3.7
PMS1-220ENST00000618056 CEP152O94986 1710 aa38.16■■■■□ 3.7
PMS1-220ENST00000618056 MYO3AQ8NEV4 1616 aa38.15■■■■□ 3.7
PMS1-220ENST00000618056 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
PMS1-220ENST00000618056 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
PMS1-220ENST00000618056 ROCK1Q13464 1354 aa38.11■■■■□ 3.69
PMS1-220ENST00000618056 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.09■■■■□ 3.69
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.07■■■■□ 3.68
PMS1-220ENST00000618056 STRCQ7RTU9 1775 aa38.06■■■■□ 3.68
PMS1-220ENST00000618056 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
PMS1-220ENST00000618056 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
PMS1-220ENST00000618056 VWDEQ8N2E2 1590 aa38.03■■■■□ 3.68
PMS1-220ENST00000618056 TNRQ92752 1358 aa38.03■■■■□ 3.68
PMS1-220ENST00000618056 KANK1Q14678 1352 aa38.02■■■■□ 3.68
PMS1-220ENST00000618056 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.68
PMS1-220ENST00000618056 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.99■■■■□ 3.67
PMS1-220ENST00000618056 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.98■■■■□ 3.67
PMS1-220ENST00000618056 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.98■■■■□ 3.674e-6■■□□□ 13.1
PMS1-220ENST00000618056 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.98■■■■□ 3.67
PMS1-220ENST00000618056 ITGAEP38570 1179 aa37.97■■■■□ 3.67
PMS1-220ENST00000618056 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.97■■■■□ 3.67
PMS1-220ENST00000618056 ERVK-7P63135 1459 aa37.94■■■■□ 3.66
PMS1-220ENST00000618056 NLRP1Q9C000 1473 aa37.92■■■■□ 3.66
PMS1-220ENST00000618056 UNC13BO14795 1591 aa37.9■■■■□ 3.66
PMS1-220ENST00000618056 PLA2R1Q13018 1463 aa37.88■■■■□ 3.65
PMS1-220ENST00000618056 DMRT2Q9Y5R5 561 aa37.87■■■■□ 3.65
PMS1-220ENST00000618056 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.85■■■■□ 3.65
PMS1-220ENST00000618056 PTPRTO14522 1441 aa37.81■■■■□ 3.64
PMS1-220ENST00000618056 TET3O43151 1660 aa37.8■■■■□ 3.64
PMS1-220ENST00000618056 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.79■■■■□ 3.64
PMS1-220ENST00000618056 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.77■■■■□ 3.64
PMS1-220ENST00000618056 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.75■■■■□ 3.63
PMS1-220ENST00000618056 PKD2Q13563 968 aa37.75■■■■□ 3.63
PMS1-220ENST00000618056 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
PMS1-220ENST00000618056 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
PMS1-220ENST00000618056 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
PMS1-220ENST00000618056 NAIPQ13075 1403 aa37.7■■■■□ 3.63
PMS1-220ENST00000618056 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.7■■■■□ 3.63
PMS1-220ENST00000618056 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.7■■■■□ 3.63
PMS1-220ENST00000618056 NOS1P29475 1434 aa37.69■■■■□ 3.62
PMS1-220ENST00000618056 SYNMO15061 1565 aa37.67■■■■□ 3.62
PMS1-220ENST00000618056 HFM1A2PYH4 1435 aa37.66■■■■□ 3.62
PMS1-220ENST00000618056 NUP155O75694 1391 aa37.65■■■■□ 3.62
PMS1-220ENST00000618056 E9PCH4 1651 aa37.63■■■■□ 3.61
PMS1-220ENST00000618056 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
PMS1-220ENST00000618056 PIK3C2BO00750 1634 aa37.63■■■■□ 3.61
PMS1-220ENST00000618056 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.61■■■■□ 3.61
PMS1-220ENST00000618056 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.57■■■■□ 3.6
PMS1-220ENST00000618056 IDI1Q13907 227 aa37.54■■■■□ 3.6
PMS1-220ENST00000618056 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.53■■■■□ 3.6
PMS1-220ENST00000618056 MED14O60244 1454 aa37.53■■■■□ 3.6
PMS1-220ENST00000618056 SLIT1O75093 1534 aa37.52■■■■□ 3.6
PMS1-220ENST00000618056 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.52■■■■□ 3.6
PMS1-220ENST00000618056 ADGRB3O60242 1522 aa37.48■■■■□ 3.59
PMS1-220ENST00000618056 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.47■■■■□ 3.59
PMS1-220ENST00000618056 CERKQ8TCT0 537 aa37.46■■■■□ 3.59
PMS1-220ENST00000618056 IQGAP1P46940 1657 aa37.45■■■■□ 3.59
PMS1-220ENST00000618056 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
PMS1-220ENST00000618056 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.45■■■■□ 3.59
PMS1-220ENST00000618056 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
PMS1-220ENST00000618056 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.42■■■■□ 3.58
PMS1-220ENST00000618056 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.42■■■■□ 3.58
PMS1-220ENST00000618056 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.41■■■■□ 3.58
PMS1-220ENST00000618056 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
PMS1-220ENST00000618056 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.38■■■■□ 3.57
PMS1-220ENST00000618056 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.37■■■■□ 3.57
PMS1-220ENST00000618056 LTKP29376 864 aa37.36■■■■□ 3.57
PMS1-220ENST00000618056 FBXO41Q8TF61 875 aa37.36■■■■□ 3.57
PMS1-220ENST00000618056 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.35■■■■□ 3.57
PMS1-220ENST00000618056 EID1Q9Y6B2 187 aa37.34■■■■□ 3.57
PMS1-220ENST00000618056 TRIM52Q96A61 297 aa37.33■■■■□ 3.57
PMS1-220ENST00000618056 IQSEC2Q5JU85 1478 aa37.29■■■■□ 3.56
PMS1-220ENST00000618056 TRPM2O94759 1503 aa37.25■■■■□ 3.55
PMS1-220ENST00000618056 ZFYVE9O95405 1425 aa37.24■■■■□ 3.55
PMS1-220ENST00000618056 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.24■■■■□ 3.55
PMS1-220ENST00000618056 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
PMS1-220ENST00000618056 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
PMS1-220ENST00000618056 CPS1P31327 1500 aa37.21■■■■□ 3.55
PMS1-220ENST00000618056 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.19■■■■□ 3.54
PMS1-220ENST00000618056 CLTCL1P53675 1640 aa37.18■■■■□ 3.54
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