RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599794.5

TIMM50-213, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TIMM50, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-213ENST00000599794 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.49■■■□□ 2.63
TIMM50-213ENST00000599794 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.47■■■□□ 2.63
TIMM50-213ENST00000599794 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
TIMM50-213ENST00000599794 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.46■■■□□ 2.63
TIMM50-213ENST00000599794 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.46■■■□□ 2.63
TIMM50-213ENST00000599794 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.46■■■□□ 2.63
TIMM50-213ENST00000599794 KIF15Q9NS87 1388 aa31.45■■■□□ 2.63
TIMM50-213ENST00000599794 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.62
TIMM50-213ENST00000599794 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
TIMM50-213ENST00000599794 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.44■■■□□ 2.62
TIMM50-213ENST00000599794 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.44■■■□□ 2.62
TIMM50-213ENST00000599794 NCOA1Q15788 1441 aa31.41■■■□□ 2.62
TIMM50-213ENST00000599794 PZPP20742 1482 aa31.4■■■□□ 2.62
TIMM50-213ENST00000599794 ABCC3O15438 1527 aa31.39■■■□□ 2.62
TIMM50-213ENST00000599794 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.39■■■□□ 2.62
TIMM50-213ENST00000599794 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.39■■■□□ 2.62
TIMM50-213ENST00000599794 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
TIMM50-213ENST00000599794 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
TIMM50-213ENST00000599794 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.37■■■□□ 2.61
TIMM50-213ENST00000599794 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.36■■■□□ 2.61
TIMM50-213ENST00000599794 TNRQ92752 1358 aa31.35■■■□□ 2.61
TIMM50-213ENST00000599794 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
TIMM50-213ENST00000599794 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.34■■■□□ 2.61
TIMM50-213ENST00000599794 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
TIMM50-213ENST00000599794 PTPRTO14522 1441 aa31.32■■■□□ 2.61
TIMM50-213ENST00000599794 ERBINQ96RT1 1412 aa31.32■■■□□ 2.61
TIMM50-213ENST00000599794 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.31■■■□□ 2.6
TIMM50-213ENST00000599794 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.3■■■□□ 2.6
TIMM50-213ENST00000599794 ADGRL2O95490 1459 aa31.28■■■□□ 2.6
TIMM50-213ENST00000599794 FBXO41Q8TF61 875 aa31.28■■■□□ 2.6
TIMM50-213ENST00000599794 CERKQ8TCT0 537 aa31.27■■■□□ 2.6
TIMM50-213ENST00000599794 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.26■■■□□ 2.59
TIMM50-213ENST00000599794 CEP152O94986 1710 aa31.25■■■□□ 2.59
TIMM50-213ENST00000599794 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
TIMM50-213ENST00000599794 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
TIMM50-213ENST00000599794 PLA2R1Q13018 1463 aa31.23■■■□□ 2.59
TIMM50-213ENST00000599794 DEPDC5O75140 1603 aa31.22■■■□□ 2.59
TIMM50-213ENST00000599794 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.21■■■□□ 2.59
TIMM50-213ENST00000599794 ERVK-7P63135 1459 aa31.21■■■□□ 2.59
TIMM50-213ENST00000599794 PKD2Q13563 968 aa31.19■■■□□ 2.58
TIMM50-213ENST00000599794 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
TIMM50-213ENST00000599794 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.17■■■□□ 2.58
TIMM50-213ENST00000599794 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.16■■■□□ 2.58
TIMM50-213ENST00000599794 NLRP1Q9C000 1473 aa31.16■■■□□ 2.58
TIMM50-213ENST00000599794 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.15■■■□□ 2.58
TIMM50-213ENST00000599794 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.15■■■□□ 2.58
TIMM50-213ENST00000599794 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.13■■■□□ 2.57
TIMM50-213ENST00000599794 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.1■■■□□ 2.57
TIMM50-213ENST00000599794 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
TIMM50-213ENST00000599794 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.09■■■□□ 2.57
TIMM50-213ENST00000599794 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
TIMM50-213ENST00000599794 ITGAEP38570 1179 aa31.09■■■□□ 2.57
TIMM50-213ENST00000599794 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.09■■■□□ 2.57
TIMM50-213ENST00000599794 KANK1Q14678 1352 aa31.07■■■□□ 2.56
TIMM50-213ENST00000599794 ROCK1Q13464 1354 aa31.06■■■□□ 2.56
TIMM50-213ENST00000599794 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.03■■■□□ 2.56
TIMM50-213ENST00000599794 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
TIMM50-213ENST00000599794 IDI1Q13907 227 aa30.98■■■□□ 2.55
TIMM50-213ENST00000599794 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
TIMM50-213ENST00000599794 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.98■■■□□ 2.55
TIMM50-213ENST00000599794 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.98■■■□□ 2.55
TIMM50-213ENST00000599794 NOS1P29475 1434 aa30.97■■■□□ 2.55
TIMM50-213ENST00000599794 MED14O60244 1454 aa30.96■■■□□ 2.55
TIMM50-213ENST00000599794 SYNMO15061 1565 aa30.96■■■□□ 2.55
TIMM50-213ENST00000599794 LTKP29376 864 aa30.95■■■□□ 2.55
TIMM50-213ENST00000599794 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
TIMM50-213ENST00000599794 UNC13BO14795 1591 aa30.92■■■□□ 2.54
TIMM50-213ENST00000599794 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.91■■■□□ 2.54
TIMM50-213ENST00000599794 PIK3C2BO00750 1634 aa30.91■■■□□ 2.54
TIMM50-213ENST00000599794 SLIT1O75093 1534 aa30.87■■■□□ 2.53
TIMM50-213ENST00000599794 TET3O43151 1660 aa30.85■■■□□ 2.53
TIMM50-213ENST00000599794 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.84■■■□□ 2.53
TIMM50-213ENST00000599794 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.83■■■□□ 2.53
TIMM50-213ENST00000599794 NUP155O75694 1391 aa30.83■■■□□ 2.53
TIMM50-213ENST00000599794 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.53
TIMM50-213ENST00000599794 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.82■■■□□ 2.52
TIMM50-213ENST00000599794 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
TIMM50-213ENST00000599794 IQGAP1P46940 1657 aa30.81■■■□□ 2.52
TIMM50-213ENST00000599794 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30.8■■■□□ 2.52
TIMM50-213ENST00000599794 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.8■■■□□ 2.52
TIMM50-213ENST00000599794 NAIPQ13075 1403 aa30.78■■■□□ 2.52
TIMM50-213ENST00000599794 E9PCH4 1651 aa30.78■■■□□ 2.52
TIMM50-213ENST00000599794 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.78■■■□□ 2.52
TIMM50-213ENST00000599794 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.77■■■□□ 2.52
TIMM50-213ENST00000599794 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.75■■■□□ 2.51
TIMM50-213ENST00000599794 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
TIMM50-213ENST00000599794 EID1Q9Y6B2 187 aa30.73■■■□□ 2.51
TIMM50-213ENST00000599794 ADGRB3O60242 1522 aa30.73■■■□□ 2.51
TIMM50-213ENST00000599794 CPS1P31327 1500 aa30.71■■■□□ 2.51
TIMM50-213ENST00000599794 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.69■■■□□ 2.5
TIMM50-213ENST00000599794 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.66■■■□□ 2.5
TIMM50-213ENST00000599794 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.66■■■□□ 2.5
TIMM50-213ENST00000599794 ZFYVE9O95405 1425 aa30.65■■■□□ 2.5
TIMM50-213ENST00000599794 HFM1A2PYH4 1435 aa30.64■■■□□ 2.5
TIMM50-213ENST00000599794 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.63■■■□□ 2.49
TIMM50-213ENST00000599794 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.63■■■□□ 2.49
TIMM50-213ENST00000599794 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
TIMM50-213ENST00000599794 ALKQ9UM73 1620 aa30.59■■■□□ 2.49
TIMM50-213ENST00000599794 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.59■■■□□ 2.49
TIMM50-213ENST00000599794 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms