RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-215ENST00000596522 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
FCHO1-215ENST00000596522 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
FCHO1-215ENST00000596522 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
FCHO1-215ENST00000596522 MROH2AA6NES4 1674 aa21.53■■□□□ 1.04
FCHO1-215ENST00000596522 KIF3BO15066 747 aa21.52■■□□□ 1.04
FCHO1-215ENST00000596522 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.5■■□□□ 1.03
FCHO1-215ENST00000596522 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.49■■□□□ 1.03
FCHO1-215ENST00000596522 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.47■■□□□ 1.03
FCHO1-215ENST00000596522 PTPRKQ15262 1439 aa21.46■■□□□ 1.03
FCHO1-215ENST00000596522 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.45■■□□□ 1.03
FCHO1-215ENST00000596522 ZMYM3Q14202 1370 aa21.45■■□□□ 1.02
FCHO1-215ENST00000596522 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.45■■□□□ 1.02
FCHO1-215ENST00000596522 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-215ENST00000596522 ITGAEP38570 1179 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-215ENST00000596522 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.42■■□□□ 1.02
FCHO1-215ENST00000596522 KANK1Q14678 1352 aa21.39■■□□□ 1.02
FCHO1-215ENST00000596522 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
FCHO1-215ENST00000596522 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-215ENST00000596522 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
FCHO1-215ENST00000596522 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
FCHO1-215ENST00000596522 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.37■■□□□ 1.01
FCHO1-215ENST00000596522 HSPA2P54652 639 aa21.37■■□□□ 1.01
FCHO1-215ENST00000596522 CEP152O94986 1710 aa21.37■■□□□ 1.01
FCHO1-215ENST00000596522 HFM1A2PYH4 1435 aa21.36■■□□□ 1.01
FCHO1-215ENST00000596522 DEPDC5O75140 1603 aa21.36■■□□□ 1.01
FCHO1-215ENST00000596522 NPATQ14207 1427 aa21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-215ENST00000596522 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-215ENST00000596522 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
FCHO1-215ENST00000596522 ABCC3O15438 1527 aa21.32■■□□□ 1
FCHO1-215ENST00000596522 NAIPQ13075 1403 aa21.3■■□□□ 1
FCHO1-215ENST00000596522 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.3■■□□□ 1
FCHO1-215ENST00000596522 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-215ENST00000596522 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-215ENST00000596522 PZPP20742 1482 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-215ENST00000596522 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
FCHO1-215ENST00000596522 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-215ENST00000596522 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.28■■□□□ 1
FCHO1-215ENST00000596522 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
FCHO1-215ENST00000596522 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.28■■□□□ 1
FCHO1-215ENST00000596522 UNC13BO14795 1591 aa21.27■■□□□ 1
FCHO1-215ENST00000596522 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
FCHO1-215ENST00000596522 STRCQ7RTU9 1775 aa21.25■□□□□ 0.99
FCHO1-215ENST00000596522 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
FCHO1-215ENST00000596522 TNRQ92752 1358 aa21.22■□□□□ 0.99
FCHO1-215ENST00000596522 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
FCHO1-215ENST00000596522 NUP155O75694 1391 aa21.21■□□□□ 0.99
FCHO1-215ENST00000596522 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.19■□□□□ 0.98
FCHO1-215ENST00000596522 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.19■□□□□ 0.98
FCHO1-215ENST00000596522 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.18■□□□□ 0.98
FCHO1-215ENST00000596522 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.17■□□□□ 0.98
FCHO1-215ENST00000596522 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.17■□□□□ 0.98
FCHO1-215ENST00000596522 ERVK-7P63135 1459 aa21.17■□□□□ 0.98
FCHO1-215ENST00000596522 TET3O43151 1660 aa21.17■□□□□ 0.98
FCHO1-215ENST00000596522 NLRP1Q9C000 1473 aa21.16■□□□□ 0.98
FCHO1-215ENST00000596522 HRCP23327 699 aa21.1■□□□□ 0.97
FCHO1-215ENST00000596522 TRIM52Q96A61 297 aa21.1■□□□□ 0.97
FCHO1-215ENST00000596522 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.1■□□□□ 0.97
FCHO1-215ENST00000596522 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.1■□□□□ 0.97
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FCHO1-215ENST00000596522 PLA2R1Q13018 1463 aa21.08■□□□□ 0.97
FCHO1-215ENST00000596522 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
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FCHO1-215ENST00000596522 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.07■□□□□ 0.96
FCHO1-215ENST00000596522 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.07■□□□□ 0.96
FCHO1-215ENST00000596522 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.07■□□□□ 0.96
FCHO1-215ENST00000596522 E9PCH4 1651 aa21.06■□□□□ 0.96
FCHO1-215ENST00000596522 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
FCHO1-215ENST00000596522 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
FCHO1-215ENST00000596522 PTPRTO14522 1441 aa21.04■□□□□ 0.96
FCHO1-215ENST00000596522 PIK3C2BO00750 1634 aa21.04■□□□□ 0.96
FCHO1-215ENST00000596522 PKD2Q13563 968 aa21.04■□□□□ 0.96
FCHO1-215ENST00000596522 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
FCHO1-215ENST00000596522 SYNMO15061 1565 aa21.04■□□□□ 0.96
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FCHO1-215ENST00000596522 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.99■□□□□ 0.95
FCHO1-215ENST00000596522 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.98■□□□□ 0.95
FCHO1-215ENST00000596522 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
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FCHO1-215ENST00000596522 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.96■□□□□ 0.95
FCHO1-215ENST00000596522 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.96■□□□□ 0.95
FCHO1-215ENST00000596522 TRPM2O94759 1503 aa20.94■□□□□ 0.94
FCHO1-215ENST00000596522 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.94■□□□□ 0.94
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FCHO1-215ENST00000596522 IQGAP1P46940 1657 aa20.92■□□□□ 0.94
FCHO1-215ENST00000596522 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.91■□□□□ 0.94
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FCHO1-215ENST00000596522 CERKQ8TCT0 537 aa20.89■□□□□ 0.93
FCHO1-215ENST00000596522 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.89■□□□□ 0.93
FCHO1-215ENST00000596522 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.89■□□□□ 0.93
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FCHO1-215ENST00000596522 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
FCHO1-215ENST00000596522 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.88■□□□□ 0.93
FCHO1-215ENST00000596522 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
FCHO1-215ENST00000596522 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.87■□□□□ 0.93
FCHO1-215ENST00000596522 EID1Q9Y6B2 187 aa20.87■□□□□ 0.93
FCHO1-215ENST00000596522 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
FCHO1-215ENST00000596522 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.86■□□□□ 0.93
FCHO1-215ENST00000596522 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
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