RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593062.5

EIF3K-212, Transcript of eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, human

TSL 2

Gene EIF3K, Length 704 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EIF3K-212	ENST00000593062	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
EIF3K-212	ENST00000593062	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		14.98	□□□□□ -0.01
EIF3K-212	ENST00000593062	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		14.98	□□□□□ -0.01
EIF3K-212	ENST00000593062	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		14.98	□□□□□ -0.01
EIF3K-212	ENST00000593062	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		14.97	□□□□□ -0.01
EIF3K-212	ENST00000593062	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		14.97	□□□□□ -0.01
EIF3K-212	ENST00000593062	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		14.96	□□□□□ -0.01
EIF3K-212	ENST00000593062	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		14.96	□□□□□ -0.01
EIF3K-212	ENST00000593062	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	14.96	□□□□□ -0.01	5e-6	■■□□□ 11.7
EIF3K-212	ENST00000593062	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		14.95	□□□□□ -0.02
EIF3K-212	ENST00000593062	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
EIF3K-212	ENST00000593062	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		14.95	□□□□□ -0.02
EIF3K-212	ENST00000593062	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	14.95	□□□□□ -0.02	1e-7	■■□□□ 12.3
EIF3K-212	ENST00000593062	MIA2	Q96PC5	1412 aa		14.94	□□□□□ -0.02
EIF3K-212	ENST00000593062	MAP3K1	Q13233	1512 aa		14.94	□□□□□ -0.02
EIF3K-212	ENST00000593062	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		14.94	□□□□□ -0.02
EIF3K-212	ENST00000593062	PZP	P20742	1482 aa		14.94	□□□□□ -0.02
EIF3K-212	ENST00000593062	PLA2R1	Q13018	1463 aa		14.94	□□□□□ -0.02
EIF3K-212	ENST00000593062	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
EIF3K-212	ENST00000593062	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
EIF3K-212	ENST00000593062	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
EIF3K-212	ENST00000593062	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		14.92	□□□□□ -0.02
EIF3K-212	ENST00000593062	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
EIF3K-212	ENST00000593062	ABCC5	O15440	1437 aa		14.9	□□□□□ -0.02
EIF3K-212	ENST00000593062	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
EIF3K-212	ENST00000593062	KIF15	Q9NS87	1388 aa		14.88	□□□□□ -0.03
EIF3K-212	ENST00000593062	PIP4K2B	P78356	416 aa		14.88	□□□□□ -0.03
EIF3K-212	ENST00000593062	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
EIF3K-212	ENST00000593062	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		14.88	□□□□□ -0.03
EIF3K-212	ENST00000593062	ABCC3	O15438	1527 aa		14.87	□□□□□ -0.03
EIF3K-212	ENST00000593062	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		14.86	□□□□□ -0.03
EIF3K-212	ENST00000593062	ILDR2	Q71H61	639 aa		14.86	□□□□□ -0.03
EIF3K-212	ENST00000593062	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		14.86	□□□□□ -0.03
EIF3K-212	ENST00000593062	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		14.85	□□□□□ -0.03
EIF3K-212	ENST00000593062	NLRP1	Q9C000	1473 aa		14.85	□□□□□ -0.03
EIF3K-212	ENST00000593062	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		14.85	□□□□□ -0.03
EIF3K-212	ENST00000593062	DAPK1	P53355	1430 aa		14.84	□□□□□ -0.03
EIF3K-212	ENST00000593062	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		14.84	□□□□□ -0.03
EIF3K-212	ENST00000593062	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		14.84	□□□□□ -0.03
EIF3K-212	ENST00000593062	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.03
EIF3K-212	ENST00000593062	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		14.83	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	ERVK-7	P63135	1459 aa		14.82	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		14.82	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		14.82	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		14.82	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	CEP152	O94986	1710 aa		14.82	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		14.81	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	TOM1	O60784	492 aa		14.81	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	LTK	P29376	864 aa		14.81	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		14.81	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	KANK1	Q14678	1352 aa		14.8	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		14.8	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	HSPA1L	P34931	641 aa		14.79	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		14.78	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	IDI1	Q13907	227 aa		14.78	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.04
EIF3K-212	ENST00000593062	EID1	Q9Y6B2	187 aa		14.77	□□□□□ -0.05
EIF3K-212	ENST00000593062	MED14	O60244	1454 aa		14.76	□□□□□ -0.05
EIF3K-212	ENST00000593062	ITGAE	P38570	1179 aa		14.76	□□□□□ -0.05
EIF3K-212	ENST00000593062	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		14.76	□□□□□ -0.05
EIF3K-212	ENST00000593062	CPS1	P31327	1500 aa		14.76	□□□□□ -0.05
EIF3K-212	ENST00000593062	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		14.75	□□□□□ -0.05
EIF3K-212	ENST00000593062	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		14.75	□□□□□ -0.05
EIF3K-212	ENST00000593062	BCAN	Q96GW7	911 aa		14.74	□□□□□ -0.05
EIF3K-212	ENST00000593062	DEPDC5	O75140	1603 aa		14.74	□□□□□ -0.05
EIF3K-212	ENST00000593062	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
EIF3K-212	ENST00000593062	IQGAP1	P46940	1657 aa		14.73	□□□□□ -0.05
EIF3K-212	ENST00000593062	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
EIF3K-212	ENST00000593062	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		14.72	□□□□□ -0.05
EIF3K-212	ENST00000593062	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		14.71	□□□□□ -0.05
EIF3K-212	ENST00000593062	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		14.71	□□□□□ -0.06
EIF3K-212	ENST00000593062	SOCS7	O14512	581 aa		14.7	□□□□□ -0.06
EIF3K-212	ENST00000593062	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
EIF3K-212	ENST00000593062	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		14.69	□□□□□ -0.06
EIF3K-212	ENST00000593062	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
EIF3K-212	ENST00000593062	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		14.69	□□□□□ -0.06
EIF3K-212	ENST00000593062	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		14.69	□□□□□ -0.06
EIF3K-212	ENST00000593062	PIK3C2B	O00750	1634 aa		14.69	□□□□□ -0.06
EIF3K-212	ENST00000593062	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		14.68	□□□□□ -0.06
EIF3K-212	ENST00000593062	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		14.67	□□□□□ -0.06
EIF3K-212	ENST00000593062	SLIT1	O75093	1534 aa		14.66	□□□□□ -0.06
EIF3K-212	ENST00000593062	ADGRL2	O95490	1459 aa		14.66	□□□□□ -0.06
EIF3K-212	ENST00000593062	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
EIF3K-212	ENST00000593062	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
EIF3K-212	ENST00000593062	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		14.65	□□□□□ -0.06
EIF3K-212	ENST00000593062	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
EIF3K-212	ENST00000593062	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		14.64	□□□□□ -0.07
EIF3K-212	ENST00000593062	NOS1	P29475	1434 aa		14.64	□□□□□ -0.07
EIF3K-212	ENST00000593062	KCNA6	P17658	529 aa		14.63	□□□□□ -0.07
EIF3K-212	ENST00000593062	SYNM	O15061	1565 aa		14.63	□□□□□ -0.07
EIF3K-212	ENST00000593062	ALK	Q9UM73	1620 aa		14.63	□□□□□ -0.07
EIF3K-212	ENST00000593062	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
EIF3K-212	ENST00000593062	NUP155	O75694	1391 aa		14.6	□□□□□ -0.07
EIF3K-212	ENST00000593062	TMEM94	Q12767	1356 aa		14.6	□□□□□ -0.07
EIF3K-212	ENST00000593062	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07

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