RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590954.5

TXNL1-211, Transcript of thioredoxin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TXNL1, Length 1,339 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1-211ENST00000590954 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
TXNL1-211ENST00000590954 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.1■■■□□ 2.41
TXNL1-211ENST00000590954 PTPRKQ15262 1439 aa30.09■■■□□ 2.41
TXNL1-211ENST00000590954 KIF15Q9NS87 1388 aa30.09■■■□□ 2.41
TXNL1-211ENST00000590954 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
TXNL1-211ENST00000590954 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.08■■■□□ 2.41
TXNL1-211ENST00000590954 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.06■■■□□ 2.4
TXNL1-211ENST00000590954 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
TXNL1-211ENST00000590954 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.02■■■□□ 2.4
TXNL1-211ENST00000590954 PZPP20742 1482 aa30.01■■■□□ 2.39
TXNL1-211ENST00000590954 ERBINQ96RT1 1412 aa30■■■□□ 2.39
TXNL1-211ENST00000590954 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
TXNL1-211ENST00000590954 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
TXNL1-211ENST00000590954 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30■■■□□ 2.39
TXNL1-211ENST00000590954 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
TXNL1-211ENST00000590954 STRCQ7RTU9 1775 aa29.98■■■□□ 2.39
TXNL1-211ENST00000590954 ABCC3O15438 1527 aa29.98■■■□□ 2.39
TXNL1-211ENST00000590954 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.98■■■□□ 2.39
TXNL1-211ENST00000590954 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.97■■■□□ 2.39
TXNL1-211ENST00000590954 TNRQ92752 1358 aa29.95■■■□□ 2.39
TXNL1-211ENST00000590954 NCOA1Q15788 1441 aa29.95■■■□□ 2.39
TXNL1-211ENST00000590954 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.95■■■□□ 2.39
TXNL1-211ENST00000590954 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.95■■■□□ 2.39
TXNL1-211ENST00000590954 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
TXNL1-211ENST00000590954 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
TXNL1-211ENST00000590954 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
TXNL1-211ENST00000590954 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.9■■■□□ 2.38
TXNL1-211ENST00000590954 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
TXNL1-211ENST00000590954 CEP152O94986 1710 aa29.89■■■□□ 2.38
TXNL1-211ENST00000590954 ADGRL2O95490 1459 aa29.89■■■□□ 2.37
TXNL1-211ENST00000590954 PTPRTO14522 1441 aa29.87■■■□□ 2.37
TXNL1-211ENST00000590954 KANK1Q14678 1352 aa29.86■■■□□ 2.37
TXNL1-211ENST00000590954 DEPDC5O75140 1603 aa29.85■■■□□ 2.37
TXNL1-211ENST00000590954 PLA2R1Q13018 1463 aa29.85■■■□□ 2.37
TXNL1-211ENST00000590954 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.85■■■□□ 2.371e-6■□□□□ 9.5
TXNL1-211ENST00000590954 NLRP1Q9C000 1473 aa29.83■■■□□ 2.37
TXNL1-211ENST00000590954 ERVK-7P63135 1459 aa29.81■■■□□ 2.36
TXNL1-211ENST00000590954 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.8■■■□□ 2.36
TXNL1-211ENST00000590954 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.8■■■□□ 2.36
TXNL1-211ENST00000590954 PKD2Q13563 968 aa29.77■■■□□ 2.36
TXNL1-211ENST00000590954 FBXO41Q8TF61 875 aa29.77■■■□□ 2.36
TXNL1-211ENST00000590954 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.76■■■□□ 2.36
TXNL1-211ENST00000590954 CERKQ8TCT0 537 aa29.74■■■□□ 2.35
TXNL1-211ENST00000590954 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.74■■■□□ 2.35
TXNL1-211ENST00000590954 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.74■■■□□ 2.35
TXNL1-211ENST00000590954 ITGAEP38570 1179 aa29.72■■■□□ 2.35
TXNL1-211ENST00000590954 ROCK1Q13464 1354 aa29.7■■■□□ 2.35
TXNL1-211ENST00000590954 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.7■■■□□ 2.35
TXNL1-211ENST00000590954 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.7■■■□□ 2.35
TXNL1-211ENST00000590954 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.7■■■□□ 2.35
TXNL1-211ENST00000590954 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
TXNL1-211ENST00000590954 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
TXNL1-211ENST00000590954 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
TXNL1-211ENST00000590954 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.65■■■□□ 2.34
TXNL1-211ENST00000590954 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.63■■■□□ 2.33
TXNL1-211ENST00000590954 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.61■■■□□ 2.33
TXNL1-211ENST00000590954 UNC13BO14795 1591 aa29.6■■■□□ 2.33
TXNL1-211ENST00000590954 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
TXNL1-211ENST00000590954 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.6■■■□□ 2.33
TXNL1-211ENST00000590954 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.58■■■□□ 2.33
TXNL1-211ENST00000590954 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.33
TXNL1-211ENST00000590954 TET3O43151 1660 aa29.56■■■□□ 2.32
TXNL1-211ENST00000590954 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
TXNL1-211ENST00000590954 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.53■■■□□ 2.32
TXNL1-211ENST00000590954 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
TXNL1-211ENST00000590954 PIK3C2BO00750 1634 aa29.53■■■□□ 2.32
TXNL1-211ENST00000590954 SYNMO15061 1565 aa29.52■■■□□ 2.32
TXNL1-211ENST00000590954 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.51■■■□□ 2.31
TXNL1-211ENST00000590954 IQGAP1P46940 1657 aa29.5■■■□□ 2.31
TXNL1-211ENST00000590954 MED14O60244 1454 aa29.5■■■□□ 2.31
TXNL1-211ENST00000590954 NOS1P29475 1434 aa29.5■■■□□ 2.31
TXNL1-211ENST00000590954 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.49■■■□□ 2.31
TXNL1-211ENST00000590954 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.48■■■□□ 2.31
TXNL1-211ENST00000590954 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
TXNL1-211ENST00000590954 NUP155O75694 1391 aa29.46■■■□□ 2.31
TXNL1-211ENST00000590954 SLIT1O75093 1534 aa29.45■■■□□ 2.31
TXNL1-211ENST00000590954 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
TXNL1-211ENST00000590954 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.45■■■□□ 2.3
TXNL1-211ENST00000590954 ADGRB3O60242 1522 aa29.44■■■□□ 2.3
TXNL1-211ENST00000590954 IDI1Q13907 227 aa29.44■■■□□ 2.3
TXNL1-211ENST00000590954 EID1Q9Y6B2 187 aa29.44■■■□□ 2.3
TXNL1-211ENST00000590954 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.42■■■□□ 2.3
TXNL1-211ENST00000590954 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.41■■■□□ 2.3
TXNL1-211ENST00000590954 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.41■■■□□ 2.3
TXNL1-211ENST00000590954 E9PCH4 1651 aa29.4■■■□□ 2.3
TXNL1-211ENST00000590954 CPS1P31327 1500 aa29.4■■■□□ 2.3
TXNL1-211ENST00000590954 LTKP29376 864 aa29.36■■■□□ 2.29
TXNL1-211ENST00000590954 NAIPQ13075 1403 aa29.35■■■□□ 2.29
TXNL1-211ENST00000590954 HFM1A2PYH4 1435 aa29.31■■■□□ 2.28
TXNL1-211ENST00000590954 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.28■■■□□ 2.28
TXNL1-211ENST00000590954 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
TXNL1-211ENST00000590954 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.26■■■□□ 2.27
TXNL1-211ENST00000590954 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.25■■■□□ 2.27
TXNL1-211ENST00000590954 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
TXNL1-211ENST00000590954 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.22■■■□□ 2.27
TXNL1-211ENST00000590954 BCANQ96GW7 911 aa29.22■■■□□ 2.27
TXNL1-211ENST00000590954 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.22■■■□□ 2.27
TXNL1-211ENST00000590954 TRIM52Q96A61 297 aa29.21■■■□□ 2.27
TXNL1-211ENST00000590954 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.2■■■□□ 2.27
TXNL1-211ENST00000590954 ZFYVE9O95405 1425 aa29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms