RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590954.5

TXNL1-211, Transcript of thioredoxin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TXNL1, Length 1,339 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1-211ENST00000590954 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.7■■■■■ 5.23
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TXNL1-211ENST00000590954 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38■■■■□ 3.67
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TXNL1-211ENST00000590954 SMARCA2P51531 1590 aa36.97■■■■□ 3.51
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TXNL1-211ENST00000590954 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.72■■■■□ 3.47
TXNL1-211ENST00000590954 ERCC6Q03468 1493 aa36.35■■■■□ 3.41
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TXNL1-211ENST00000590954 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.83■■■■□ 3.33
TXNL1-211ENST00000590954 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
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TXNL1-211ENST00000590954 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.55■■■■□ 3.28
TXNL1-211ENST00000590954 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.5■■■■□ 3.27
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TXNL1-211ENST00000590954 PRDM2Q13029 1718 aa35.37■■■■□ 3.25
TXNL1-211ENST00000590954 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.27■■■■□ 3.24
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TXNL1-211ENST00000590954 ABCC8Q09428 1581 aa34.9■■■■□ 3.18
TXNL1-211ENST00000590954 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.87■■■■□ 3.17
TXNL1-211ENST00000590954 IFT140Q96RY7 1462 aa34.81■■■■□ 3.16
TXNL1-211ENST00000590954 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
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TXNL1-211ENST00000590954 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.14■■■■□ 3.06
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TXNL1-211ENST00000590954 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.13■■■■□ 3.05
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TXNL1-211ENST00000590954 SYNJ1O43426 1573 aa34.11■■■■□ 3.05
TXNL1-211ENST00000590954 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.1■■■■□ 3.05
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TXNL1-211ENST00000590954 PBRM1Q86U86 1689 aa34.03■■■■□ 3.04
TXNL1-211ENST00000590954 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.02■■■■□ 3.04
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TXNL1-211ENST00000590954 ARHGEF11O15085 1522 aa33.91■■■■□ 3.02
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TXNL1-211ENST00000590954 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.59■■■□□ 2.97
TXNL1-211ENST00000590954 CEP170Q5SW79 1584 aa33.51■■■□□ 2.96
TXNL1-211ENST00000590954 NUP160Q12769 1436 aa33.51■■■□□ 2.95
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TXNL1-211ENST00000590954 SHROOM2Q13796 1616 aa33.3■■■□□ 2.92
TXNL1-211ENST00000590954 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.27■■■□□ 2.92
TXNL1-211ENST00000590954 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.26■■■□□ 2.92
TXNL1-211ENST00000590954 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.18■■■□□ 2.9
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