RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586531.5

USP36-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 3

Gene USP36, Length 898 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-205	ENST00000586531	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	43.26	■■■■■ 4.52
USP36-205	ENST00000586531	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	43.26	■■■■■ 4.52
USP36-205	ENST00000586531	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	43.26	■■■■■ 4.52
USP36-205	ENST00000586531	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	43.26	■■■■■ 4.52
USP36-205	ENST00000586531	ABCC5	O15440	1437 aa		43.25	■■■■■ 4.51
USP36-205	ENST00000586531	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		43.24	■■■■■ 4.51
USP36-205	ENST00000586531	DAPK1	P53355	1430 aa		43.19	■■■■■ 4.5
USP36-205	ENST00000586531	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		43.18	■■■■■ 4.5
USP36-205	ENST00000586531	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	43.17	■■■■■ 4.5
USP36-205	ENST00000586531	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		43.17	■■■■■ 4.5
USP36-205	ENST00000586531	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		43.17	■■■■■ 4.5
USP36-205	ENST00000586531	NCOA1	Q15788	1441 aa		43.14	■■■■■ 4.5
USP36-205	ENST00000586531	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		43.14	■■■■■ 4.5
USP36-205	ENST00000586531	PZP	P20742	1482 aa		43.13	■■■■■ 4.5
USP36-205	ENST00000586531	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	43.13	■■■■■ 4.49
USP36-205	ENST00000586531	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		43.11	■■■■■ 4.49
USP36-205	ENST00000586531	KIF15	Q9NS87	1388 aa		43.11	■■■■■ 4.49
USP36-205	ENST00000586531	ABCC3	O15438	1527 aa		43.08	■■■■■ 4.49
USP36-205	ENST00000586531	CEP152	O94986	1710 aa		43.08	■■■■■ 4.49
USP36-205	ENST00000586531	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	43.06	■■■■■ 4.48
USP36-205	ENST00000586531	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		43.05	■■■■■ 4.48
USP36-205	ENST00000586531	PTPRT	O14522	1441 aa		43.05	■■■■■ 4.48
USP36-205	ENST00000586531	FBXO41	Q8TF61	875 aa		43.02	■■■■■ 4.48
USP36-205	ENST00000586531	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		43.02	■■■■■ 4.48
USP36-205	ENST00000586531	TNR	Q92752	1358 aa		43.02	■■■■■ 4.48
USP36-205	ENST00000586531	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		43.01	■■■■■ 4.48
USP36-205	ENST00000586531	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.98	■■■■■ 4.47
USP36-205	ENST00000586531	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.97	■■■■■ 4.47
USP36-205	ENST00000586531	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	42.97	■■■■■ 4.47
USP36-205	ENST00000586531	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	42.96	■■■■■ 4.47
USP36-205	ENST00000586531	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.95	■■■■■ 4.47
USP36-205	ENST00000586531	DEPDC5	O75140	1603 aa		42.94	■■■■■ 4.46
USP36-205	ENST00000586531	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.94	■■■■■ 4.46
USP36-205	ENST00000586531	CERK	Q8TCT0	537 aa		42.93	■■■■■ 4.46
USP36-205	ENST00000586531	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		42.93	■■■■■ 4.46
USP36-205	ENST00000586531	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.88	■■■■■ 4.46
USP36-205	ENST00000586531	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		42.88	■■■■■ 4.45
USP36-205	ENST00000586531	NLRP1	Q9C000	1473 aa		42.85	■■■■■ 4.45
USP36-205	ENST00000586531	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	42.85	■■■■■ 4.45
USP36-205	ENST00000586531	ERVK-7	P63135	1459 aa		42.83	■■■■■ 4.45
USP36-205	ENST00000586531	PKD2	Q13563	968 aa		42.83	■■■■■ 4.45
USP36-205	ENST00000586531	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	42.79	■■■■■ 4.44
USP36-205	ENST00000586531	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	42.79	■■■■■ 4.44	7e-9	■■□□□ 14.1
USP36-205	ENST00000586531	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		42.78	■■■■■ 4.44
USP36-205	ENST00000586531	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		42.78	■■■■■ 4.44
USP36-205	ENST00000586531	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		42.73	■■■■■ 4.43
USP36-205	ENST00000586531	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		42.72	■■■■■ 4.43
USP36-205	ENST00000586531	KANK1	Q14678	1352 aa		42.72	■■■■■ 4.43
USP36-205	ENST00000586531	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		42.72	■■■■■ 4.43
USP36-205	ENST00000586531	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.69	■■■■■ 4.42
USP36-205	ENST00000586531	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		42.67	■■■■■ 4.42
USP36-205	ENST00000586531	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	42.66	■■■■■ 4.42
USP36-205	ENST00000586531	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		42.66	■■■■■ 4.42
USP36-205	ENST00000586531	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		42.65	■■■■■ 4.42
USP36-205	ENST00000586531	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.62	■■■■■ 4.41
USP36-205	ENST00000586531	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		42.58	■■■■■ 4.41
USP36-205	ENST00000586531	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		42.57	■■■■■ 4.41
USP36-205	ENST00000586531	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.53	■■■■■ 4.4
USP36-205	ENST00000586531	PIK3C2B	O00750	1634 aa		42.53	■■■■■ 4.4
USP36-205	ENST00000586531	UNC13B	O14795	1591 aa		42.52	■■■■■ 4.4
USP36-205	ENST00000586531	IQGAP1	P46940	1657 aa		42.51	■■■■■ 4.4
USP36-205	ENST00000586531	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.51	■■■■■ 4.4
USP36-205	ENST00000586531	MED14	O60244	1454 aa		42.5	■■■■■ 4.39
USP36-205	ENST00000586531	ITGAE	P38570	1179 aa		42.5	■■■■■ 4.39
USP36-205	ENST00000586531	SYNM	O15061	1565 aa		42.48	■■■■■ 4.39
USP36-205	ENST00000586531	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	42.48	■■■■■ 4.39
USP36-205	ENST00000586531	TET3	O43151	1660 aa		42.47	■■■■■ 4.39
USP36-205	ENST00000586531	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.44	■■■■■ 4.38
USP36-205	ENST00000586531	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
USP36-205	ENST00000586531	NOS1	P29475	1434 aa		42.4	■■■■■ 4.38
USP36-205	ENST00000586531	SLIT1	O75093	1534 aa		42.4	■■■■■ 4.38
USP36-205	ENST00000586531	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		42.39	■■■■■ 4.38
USP36-205	ENST00000586531	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.38
USP36-205	ENST00000586531	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
USP36-205	ENST00000586531	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	42.36	■■■■■ 4.37
USP36-205	ENST00000586531	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		42.35	■■■■■ 4.37
USP36-205	ENST00000586531	IDI1	Q13907	227 aa		42.33	■■■■■ 4.37
USP36-205	ENST00000586531		E9PCH4	1651 aa		42.31	■■■■■ 4.36
USP36-205	ENST00000586531	CPS1	P31327	1500 aa		42.31	■■■■■ 4.36
USP36-205	ENST00000586531	LTK	P29376	864 aa		42.29	■■■■■ 4.36
USP36-205	ENST00000586531	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		42.29	■■■■■ 4.36
USP36-205	ENST00000586531	ADGRB3	O60242	1522 aa		42.28	■■■■■ 4.36
USP36-205	ENST00000586531	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		42.28	■■■■■ 4.36
USP36-205	ENST00000586531	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		42.27	■■■■■ 4.36
USP36-205	ENST00000586531	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		42.27	■■■■■ 4.36
USP36-205	ENST00000586531	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		42.26	■■■■■ 4.36
USP36-205	ENST00000586531	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		42.21	■■■■■ 4.35
USP36-205	ENST00000586531	EID1	Q9Y6B2	187 aa		42.2	■■■■■ 4.35
USP36-205	ENST00000586531	NUP155	O75694	1391 aa		42.19	■■■■■ 4.34
USP36-205	ENST00000586531	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		42.17	■■■■■ 4.34
USP36-205	ENST00000586531	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		42.13	■■■■■ 4.33
USP36-205	ENST00000586531	NAIP	Q13075	1403 aa		42.07	■■■■■ 4.33
USP36-205	ENST00000586531	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		42.05	■■■■■ 4.32
USP36-205	ENST00000586531	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		42.02	■■■■■ 4.32
USP36-205	ENST00000586531	ZFYVE9	O95405	1425 aa		42	■■■■■ 4.31
USP36-205	ENST00000586531	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
USP36-205	ENST00000586531	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		41.95	■■■■■ 4.31
USP36-205	ENST00000586531	ALK	Q9UM73	1620 aa		41.95	■■■■■ 4.31
USP36-205	ENST00000586531	HFM1	A2PYH4	1435 aa		41.95	■■■■■ 4.31
USP36-205	ENST00000586531	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	41.94	■■■■■ 4.3

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