RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565712.1

C15orf40-211, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene C15orf40, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-211ENST00000565712 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.59■■□□□ 1.21
C15orf40-211ENST00000565712 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
C15orf40-211ENST00000565712 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.59■■□□□ 1.21
C15orf40-211ENST00000565712 NPATQ14207 1427 aa22.58■■□□□ 1.21
C15orf40-211ENST00000565712 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.58■■□□□ 1.21
C15orf40-211ENST00000565712 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.58■■□□□ 1.21
C15orf40-211ENST00000565712 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.57■■□□□ 1.2
C15orf40-211ENST00000565712 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.57■■□□□ 1.2
C15orf40-211ENST00000565712 HSPA2P54652 639 aa22.56■■□□□ 1.2
C15orf40-211ENST00000565712 ERBINQ96RT1 1412 aa22.56■■□□□ 1.2
C15orf40-211ENST00000565712 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
C15orf40-211ENST00000565712 PTPRKQ15262 1439 aa22.53■■□□□ 1.2
C15orf40-211ENST00000565712 NCOA1Q15788 1441 aa22.53■■□□□ 1.2
C15orf40-211ENST00000565712 ADGRL2O95490 1459 aa22.53■■□□□ 1.2
C15orf40-211ENST00000565712 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
C15orf40-211ENST00000565712 PZPP20742 1482 aa22.47■■□□□ 1.19
C15orf40-211ENST00000565712 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
C15orf40-211ENST00000565712 ABCC3O15438 1527 aa22.47■■□□□ 1.19
C15orf40-211ENST00000565712 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.46■■□□□ 1.19
C15orf40-211ENST00000565712 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
C15orf40-211ENST00000565712 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
C15orf40-211ENST00000565712 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.42■■□□□ 1.18
C15orf40-211ENST00000565712 ROCK1Q13464 1354 aa22.42■■□□□ 1.18
C15orf40-211ENST00000565712 KANK1Q14678 1352 aa22.42■■□□□ 1.18
C15orf40-211ENST00000565712 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
C15orf40-211ENST00000565712 DEPDC5O75140 1603 aa22.42■■□□□ 1.18
C15orf40-211ENST00000565712 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
C15orf40-211ENST00000565712 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.41■■□□□ 1.18
C15orf40-211ENST00000565712 TNRQ92752 1358 aa22.41■■□□□ 1.18
C15orf40-211ENST00000565712 ITGAEP38570 1179 aa22.4■■□□□ 1.18
C15orf40-211ENST00000565712 CEP152O94986 1710 aa22.38■■□□□ 1.17
C15orf40-211ENST00000565712 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.38■■□□□ 1.17
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
C15orf40-211ENST00000565712 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
C15orf40-211ENST00000565712 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.37■■□□□ 1.17
C15orf40-211ENST00000565712 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.36■■□□□ 1.17
C15orf40-211ENST00000565712 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.35■■□□□ 1.17
C15orf40-211ENST00000565712 STRCQ7RTU9 1775 aa22.34■■□□□ 1.17
C15orf40-211ENST00000565712 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.33■■□□□ 1.17
C15orf40-211ENST00000565712 ERVK-7P63135 1459 aa22.33■■□□□ 1.16
C15orf40-211ENST00000565712 NLRP1Q9C000 1473 aa22.33■■□□□ 1.16
C15orf40-211ENST00000565712 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.33■■□□□ 1.16
C15orf40-211ENST00000565712 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.32■■□□□ 1.16
C15orf40-211ENST00000565712 PLA2R1Q13018 1463 aa22.3■■□□□ 1.16
C15orf40-211ENST00000565712 PTPRTO14522 1441 aa22.28■■□□□ 1.16
C15orf40-211ENST00000565712 PKD2Q13563 968 aa22.27■■□□□ 1.16
C15orf40-211ENST00000565712 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
C15orf40-211ENST00000565712 UNC13BO14795 1591 aa22.25■■□□□ 1.15
C15orf40-211ENST00000565712 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
C15orf40-211ENST00000565712 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.25■■□□□ 1.15
C15orf40-211ENST00000565712 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.25■■□□□ 1.15
C15orf40-211ENST00000565712 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.24■■□□□ 1.15
C15orf40-211ENST00000565712 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
C15orf40-211ENST00000565712 TET3O43151 1660 aa22.2■■□□□ 1.14
C15orf40-211ENST00000565712 NUP155O75694 1391 aa22.19■■□□□ 1.14
C15orf40-211ENST00000565712 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.18■■□□□ 1.14
C15orf40-211ENST00000565712 NOS1P29475 1434 aa22.17■■□□□ 1.14
C15orf40-211ENST00000565712 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.17■■□□□ 1.14
C15orf40-211ENST00000565712 NAIPQ13075 1403 aa22.16■■□□□ 1.14
C15orf40-211ENST00000565712 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.15■■□□□ 1.14
C15orf40-211ENST00000565712 HFM1A2PYH4 1435 aa22.14■■□□□ 1.14
C15orf40-211ENST00000565712 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.14■■□□□ 1.13
C15orf40-211ENST00000565712 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.14■■□□□ 1.13
C15orf40-211ENST00000565712 IDI1Q13907 227 aa22.13■■□□□ 1.13
C15orf40-211ENST00000565712 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.13■■□□□ 1.13
C15orf40-211ENST00000565712 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
C15orf40-211ENST00000565712 SYNMO15061 1565 aa22.12■■□□□ 1.13
C15orf40-211ENST00000565712 CERKQ8TCT0 537 aa22.12■■□□□ 1.13
C15orf40-211ENST00000565712 PIK3C2BO00750 1634 aa22.11■■□□□ 1.13
C15orf40-211ENST00000565712 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.1■■□□□ 1.13
C15orf40-211ENST00000565712 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
C15orf40-211ENST00000565712 E9PCH4 1651 aa22.09■■□□□ 1.13
C15orf40-211ENST00000565712 MED14O60244 1454 aa22.09■■□□□ 1.13
C15orf40-211ENST00000565712 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
C15orf40-211ENST00000565712 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
C15orf40-211ENST00000565712 SLIT1O75093 1534 aa22.07■■□□□ 1.12
C15orf40-211ENST00000565712 FBXO41Q8TF61 875 aa22.07■■□□□ 1.12
C15orf40-211ENST00000565712 EID1Q9Y6B2 187 aa22.06■■□□□ 1.12
C15orf40-211ENST00000565712 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.06■■□□□ 1.12
C15orf40-211ENST00000565712 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.05■■□□□ 1.12
C15orf40-211ENST00000565712 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.05■■□□□ 1.12
C15orf40-211ENST00000565712 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
C15orf40-211ENST00000565712 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.04■■□□□ 1.12
C15orf40-211ENST00000565712 ADGRB3O60242 1522 aa22.04■■□□□ 1.12
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
C15orf40-211ENST00000565712 TRIM52Q96A61 297 aa22.03■■□□□ 1.12
C15orf40-211ENST00000565712 LTKP29376 864 aa22.02■■□□□ 1.12
C15orf40-211ENST00000565712 IQGAP1P46940 1657 aa22.01■■□□□ 1.11
C15orf40-211ENST00000565712 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
C15orf40-211ENST00000565712 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
C15orf40-211ENST00000565712 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.96■■□□□ 1.11
C15orf40-211ENST00000565712 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.95■■□□□ 1.1
C15orf40-211ENST00000565712 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
C15orf40-211ENST00000565712 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
C15orf40-211ENST00000565712 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.94■■□□□ 1.1
C15orf40-211ENST00000565712 CPS1P31327 1500 aa21.93■■□□□ 1.1
C15orf40-211ENST00000565712 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.92■■□□□ 1.1
C15orf40-211ENST00000565712 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.91■■□□□ 1.1
C15orf40-211ENST00000565712 ZFYVE9O95405 1425 aa21.9■■□□□ 1.1
C15orf40-211ENST00000565712 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms