RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565712.1

C15orf40-211, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene C15orf40, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-211ENST00000565712 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.81■■■■□ 3.32
C15orf40-211ENST00000565712 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.89■■■□□ 2.7
C15orf40-211ENST00000565712 ABCC9O60706 1549 aa31.32■■■□□ 2.6
C15orf40-211ENST00000565712 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.09■■■□□ 2.41
C15orf40-211ENST00000565712 NACADO15069 1562 aa30.03■■■□□ 2.4
C15orf40-211ENST00000565712 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.01■■■□□ 2.39
C15orf40-211ENST00000565712 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.82■■■□□ 2.36
C15orf40-211ENST00000565712 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
C15orf40-211ENST00000565712 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.63■■■□□ 2.33
C15orf40-211ENST00000565712 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.34■■■□□ 2.29
C15orf40-211ENST00000565712 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.26■■■□□ 2.27
C15orf40-211ENST00000565712 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.14■■■□□ 2.26
C15orf40-211ENST00000565712 SCRIBQ14160 1630 aa29.07■■■□□ 2.24
C15orf40-211ENST00000565712 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.89■■■□□ 2.22
C15orf40-211ENST00000565712 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.85■■■□□ 2.21
C15orf40-211ENST00000565712 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
C15orf40-211ENST00000565712 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.32■■■□□ 2.12
C15orf40-211ENST00000565712 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.17■■■□□ 2.1
C15orf40-211ENST00000565712 SMARCA4P51532 1647 aa27.8■■■□□ 2.04
C15orf40-211ENST00000565712 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
C15orf40-211ENST00000565712 NCAPD3P42695 1498 aa27.71■■■□□ 2.03
C15orf40-211ENST00000565712 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.7■■■□□ 2.02
C15orf40-211ENST00000565712 SMARCA2P51531 1590 aa27.68■■■□□ 2.02
C15orf40-211ENST00000565712 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.58■■■□□ 2.01
C15orf40-211ENST00000565712 HMGXB3Q12766 1538 aa27.56■■■□□ 2
C15orf40-211ENST00000565712 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.54■■■□□ 2
C15orf40-211ENST00000565712 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
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C15orf40-211ENST00000565712 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
C15orf40-211ENST00000565712 NESP48681 1621 aa27.05■■□□□ 1.92
C15orf40-211ENST00000565712 ERCC6Q03468 1493 aa27.04■■□□□ 1.92
C15orf40-211ENST00000565712 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27■■□□□ 1.91
C15orf40-211ENST00000565712 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
C15orf40-211ENST00000565712 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.91■■□□□ 1.9
C15orf40-211ENST00000565712 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.85■■□□□ 1.89
C15orf40-211ENST00000565712 CUX2O14529 1486 aa26.8■■□□□ 1.88
C15orf40-211ENST00000565712 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.72■■□□□ 1.87
C15orf40-211ENST00000565712 CFTRP13569 1480 aa26.71■■□□□ 1.87
C15orf40-211ENST00000565712 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.68■■□□□ 1.86
C15orf40-211ENST00000565712 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
C15orf40-211ENST00000565712 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.58■■□□□ 1.85
C15orf40-211ENST00000565712 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.57■■□□□ 1.84
C15orf40-211ENST00000565712 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.55■■□□□ 1.84
C15orf40-211ENST00000565712 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
C15orf40-211ENST00000565712 WDR62O43379 1518 aa26.46■■□□□ 1.83
C15orf40-211ENST00000565712 PRDM2Q13029 1718 aa26.46■■□□□ 1.83
C15orf40-211ENST00000565712 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
C15orf40-211ENST00000565712 ABCC8Q09428 1581 aa26.17■■□□□ 1.78
C15orf40-211ENST00000565712 TOPBP1Q92547 1522 aa26.14■■□□□ 1.77
C15orf40-211ENST00000565712 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.12■■□□□ 1.77
C15orf40-211ENST00000565712 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.1■■□□□ 1.77
C15orf40-211ENST00000565712 IFT140Q96RY7 1462 aa26.04■■□□□ 1.76
C15orf40-211ENST00000565712 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
C15orf40-211ENST00000565712 CUX1P39880 1505 aa25.88■■□□□ 1.73
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
C15orf40-211ENST00000565712 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
C15orf40-211ENST00000565712 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.83■■□□□ 1.73
C15orf40-211ENST00000565712 SOGA1O94964 1423 aa25.82■■□□□ 1.72
C15orf40-211ENST00000565712 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.79■■□□□ 1.72
C15orf40-211ENST00000565712 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
C15orf40-211ENST00000565712 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.716e-6■■■■□ 25.1
C15orf40-211ENST00000565712 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.7
C15orf40-211ENST00000565712 OSCARQ8IYS5 282 aa25.69■■□□□ 1.7
C15orf40-211ENST00000565712 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
C15orf40-211ENST00000565712 WDR97A6NE52 1622 aa25.67■■□□□ 1.7
C15orf40-211ENST00000565712 TOP2BQ02880 1626 aa25.63■■□□□ 1.69
C15orf40-211ENST00000565712 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.63■■□□□ 1.69
C15orf40-211ENST00000565712 SYNJ1O43426 1573 aa25.61■■□□□ 1.69
C15orf40-211ENST00000565712 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.58■■□□□ 1.69
C15orf40-211ENST00000565712 GRIN2BQ13224 1484 aa25.53■■□□□ 1.68
C15orf40-211ENST00000565712 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.52■■□□□ 1.68
C15orf40-211ENST00000565712 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.5■■□□□ 1.67
C15orf40-211ENST00000565712 FBLN2P98095 1184 aa25.49■■□□□ 1.67
C15orf40-211ENST00000565712 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
C15orf40-211ENST00000565712 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.47■■□□□ 1.67
C15orf40-211ENST00000565712 CHD1O14646 1710 aa25.46■■□□□ 1.67
C15orf40-211ENST00000565712 PBRM1Q86U86 1689 aa25.43■■□□□ 1.66
C15orf40-211ENST00000565712 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
C15orf40-211ENST00000565712 SYNJ2O15056 1496 aa25.38■■□□□ 1.65
C15orf40-211ENST00000565712 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.28■■□□□ 1.64
C15orf40-211ENST00000565712 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.23■■□□□ 1.63
C15orf40-211ENST00000565712 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.23■■□□□ 1.63
C15orf40-211ENST00000565712 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.23■■□□□ 1.63
C15orf40-211ENST00000565712 ADAMTS12P58397 1594 aa25.23■■□□□ 1.63
C15orf40-211ENST00000565712 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.23■■□□□ 1.63
C15orf40-211ENST00000565712 ARHGEF11O15085 1522 aa25.22■■□□□ 1.63
C15orf40-211ENST00000565712 TRIM41Q8WV44 630 aa25.21■■□□□ 1.63
C15orf40-211ENST00000565712 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.2■■□□□ 1.62
C15orf40-211ENST00000565712 GRIN2AQ12879 1464 aa25.19■■□□□ 1.62
C15orf40-211ENST00000565712 KIF27Q86VH2 1401 aa25.19■■□□□ 1.62
C15orf40-211ENST00000565712 NUP160Q12769 1436 aa25.09■■□□□ 1.61
C15orf40-211ENST00000565712 IGF1RP08069 1367 aa25.08■■□□□ 1.61
C15orf40-211ENST00000565712 CEP170Q5SW79 1584 aa25.05■■□□□ 1.6
C15orf40-211ENST00000565712 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.03■■□□□ 1.6
C15orf40-211ENST00000565712 CUL7Q14999 1698 aa25.01■■□□□ 1.59
C15orf40-211ENST00000565712 ARAP1Q96P48 1450 aa25.01■■□□□ 1.59
C15orf40-211ENST00000565712 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.95■■□□□ 1.59
C15orf40-211ENST00000565712 SHROOM2Q13796 1616 aa24.89■■□□□ 1.57
C15orf40-211ENST00000565712 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.86■■□□□ 1.57
C15orf40-211ENST00000565712 JPH4Q96JJ6 628 aa24.86■■□□□ 1.57
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