RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560514.1

TSPAN3-208, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-208ENST00000560514 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.79■■■□□ 2.2
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TSPAN3-208ENST00000560514 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
TSPAN3-208ENST00000560514 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.78■■■□□ 2.2
TSPAN3-208ENST00000560514 TIAM1Q13009 1591 aa28.77■■■□□ 2.2
TSPAN3-208ENST00000560514 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.77■■■□□ 2.2
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TSPAN3-208ENST00000560514 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.73■■■□□ 2.19
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TSPAN3-208ENST00000560514 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.67■■■□□ 2.18
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TSPAN3-208ENST00000560514 CEP162Q5TB80 1403 aa28.66■■■□□ 2.18
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TSPAN3-208ENST00000560514 NLRP1Q9C000 1473 aa28.66■■■□□ 2.18
TSPAN3-208ENST00000560514 MIA2Q96PC5 1412 aa28.65■■■□□ 2.18
TSPAN3-208ENST00000560514 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
TSPAN3-208ENST00000560514 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.62■■■□□ 2.17
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TSPAN3-208ENST00000560514 MED14O60244 1454 aa28.59■■■□□ 2.17
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TSPAN3-208ENST00000560514 TSPY10P0CW01 314 aa28.59■■■□□ 2.17
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TSPAN3-208ENST00000560514 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.47■■■□□ 2.15
TSPAN3-208ENST00000560514 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.45■■■□□ 2.15
TSPAN3-208ENST00000560514 ABCC3O15438 1527 aa28.43■■■□□ 2.14
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TSPAN3-208ENST00000560514 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.35■■■□□ 2.13
TSPAN3-208ENST00000560514 CEP152O94986 1710 aa28.35■■■□□ 2.13
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TSPAN3-208ENST00000560514 EID1Q9Y6B2 187 aa28.32■■■□□ 2.12
TSPAN3-208ENST00000560514 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.28■■■□□ 2.12
TSPAN3-208ENST00000560514 LTKP29376 864 aa28.27■■■□□ 2.12
TSPAN3-208ENST00000560514 SLIT1O75093 1534 aa28.26■■■□□ 2.11
TSPAN3-208ENST00000560514 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.25■■■□□ 2.11
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TSPAN3-208ENST00000560514 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPAN3-208ENST00000560514 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.24■■■□□ 2.11
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TSPAN3-208ENST00000560514 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
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TSPAN3-208ENST00000560514 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPAN3-208ENST00000560514 KANK1Q14678 1352 aa28.14■■■□□ 2.1
TSPAN3-208ENST00000560514 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.14■■■□□ 2.1
TSPAN3-208ENST00000560514 TMEM94Q12767 1356 aa28.13■■■□□ 2.09
TSPAN3-208ENST00000560514 ERBINQ96RT1 1412 aa28.13■■■□□ 2.09
TSPAN3-208ENST00000560514 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.12■■■□□ 2.09
TSPAN3-208ENST00000560514 KCNA6P17658 529 aa28.11■■■□□ 2.09
TSPAN3-208ENST00000560514 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
TSPAN3-208ENST00000560514 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.09■■■□□ 2.09
TSPAN3-208ENST00000560514 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
TSPAN3-208ENST00000560514 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.09■■■□□ 2.09
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TSPAN3-208ENST00000560514 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
TSPAN3-208ENST00000560514 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.06■■■□□ 2.08
TSPAN3-208ENST00000560514 MAP3K1Q13233 1512 aa28.06■■■□□ 2.08
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TSPAN3-208ENST00000560514 IDI1Q13907 227 aa28.04■■■□□ 2.08
TSPAN3-208ENST00000560514 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
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TSPAN3-208ENST00000560514 MSH6P52701 1360 aa28.01■■■□□ 2.07
TSPAN3-208ENST00000560514 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.99■■■□□ 2.07
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TSPAN3-208ENST00000560514 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
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TSPAN3-208ENST00000560514 APLP2Q06481 763 aa27.95■■■□□ 2.06
TSPAN3-208ENST00000560514 SLAIN2Q9P270 581 aa27.95■■■□□ 2.06
TSPAN3-208ENST00000560514 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.95■■■□□ 2.06
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TSPAN3-208ENST00000560514 ADGRB3O60242 1522 aa27.94■■■□□ 2.06
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TSPAN3-208ENST00000560514 NWD1Q149M9 1564 aa27.94■■■□□ 2.06
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