RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550047.5

SLC8B1-210, Transcript of solute carrier family 8 member B1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SLC8B1, Length 2,493 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1-210ENST00000550047 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SLC8B1-210ENST00000550047 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC8B1-210ENST00000550047 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SLC8B1-210ENST00000550047 PDE4AP27815 886 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC8B1-210ENST00000550047 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.64■■□□□ 1.22
SLC8B1-210ENST00000550047 FBLN2P98095 1184 aa22.64■■□□□ 1.21
SLC8B1-210ENST00000550047 NUP155O75694 1391 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC8B1-210ENST00000550047 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC8B1-210ENST00000550047 PDE3BQ13370 1112 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC8B1-210ENST00000550047 BACH2Q9BYV9 841 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC8B1-210ENST00000550047 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SLC8B1-210ENST00000550047 MS4A1P11836 297 aa22.6■■□□□ 1.21
SLC8B1-210ENST00000550047 NLRP13Q86W25 1043 aa22.6■■□□□ 1.21
SLC8B1-210ENST00000550047 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.6■■□□□ 1.21
SLC8B1-210ENST00000550047 ABCA8O94911 1581 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC8B1-210ENST00000550047 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.58■■□□□ 1.2
SLC8B1-210ENST00000550047 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.57■■□□□ 1.2
SLC8B1-210ENST00000550047 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.57■■□□□ 1.2
SLC8B1-210ENST00000550047 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SLC8B1-210ENST00000550047 USP35Q9P2H5 1018 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC8B1-210ENST00000550047 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC8B1-210ENST00000550047 NEFMP07197 916 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC8B1-210ENST00000550047 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC8B1-210ENST00000550047 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC8B1-210ENST00000550047 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC8B1-210ENST00000550047 PTPRGP23470 1445 aa22.49■■□□□ 1.19
SLC8B1-210ENST00000550047 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC8B1-210ENST00000550047 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SLC8B1-210ENST00000550047 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SLC8B1-210ENST00000550047 PLIN1O60240 522 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC8B1-210ENST00000550047 IL27Q8NEV9 243 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC8B1-210ENST00000550047 ATP10BO94823 1461 aa22.47■■□□□ 1.19
SLC8B1-210ENST00000550047 CHD1O14646 1710 aa22.47■■□□□ 1.19
SLC8B1-210ENST00000550047 SHROOM2Q13796 1616 aa22.46■■□□□ 1.19
SLC8B1-210ENST00000550047 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SLC8B1-210ENST00000550047 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.45■■□□□ 1.18
SLC8B1-210ENST00000550047 TSPY4P0CV99 314 aa22.45■■□□□ 1.18
SLC8B1-210ENST00000550047 TSPY10P0CW01 314 aa22.45■■□□□ 1.18
SLC8B1-210ENST00000550047 INSRP06213 1382 aa22.45■■□□□ 1.18
SLC8B1-210ENST00000550047 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.45■■□□□ 1.18
SLC8B1-210ENST00000550047 CRBNQ96SW2 442 aa22.44■■□□□ 1.18
SLC8B1-210ENST00000550047 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.44■■□□□ 1.18
SLC8B1-210ENST00000550047 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.43■■□□□ 1.18
SLC8B1-210ENST00000550047 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.42■■□□□ 1.18
SLC8B1-210ENST00000550047 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.42■■□□□ 1.18
SLC8B1-210ENST00000550047 SKAP1Q86WV1 359 aa22.41■■□□□ 1.18
SLC8B1-210ENST00000550047 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SLC8B1-210ENST00000550047 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SLC8B1-210ENST00000550047 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.4■■□□□ 1.18
SLC8B1-210ENST00000550047 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.39■■□□□ 1.17
SLC8B1-210ENST00000550047 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.39■■□□□ 1.17
SLC8B1-210ENST00000550047 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SLC8B1-210ENST00000550047 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.37■■□□□ 1.17
SLC8B1-210ENST00000550047 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.37■■□□□ 1.17
SLC8B1-210ENST00000550047 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.37■■□□□ 1.17
SLC8B1-210ENST00000550047 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.36■■□□□ 1.17
SLC8B1-210ENST00000550047 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
SLC8B1-210ENST00000550047 LAMC1P11047 1609 aa22.35■■□□□ 1.17
SLC8B1-210ENST00000550047 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SLC8B1-210ENST00000550047 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SLC8B1-210ENST00000550047 TESK2Q96S53 571 aa22.34■■□□□ 1.17
SLC8B1-210ENST00000550047 PANK3Q9H999 370 aa22.34■■□□□ 1.17
SLC8B1-210ENST00000550047 RGL3Q3MIN7 710 aa22.34■■□□□ 1.17
SLC8B1-210ENST00000550047 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.33■■□□□ 1.17
SLC8B1-210ENST00000550047 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.33■■□□□ 1.16
SLC8B1-210ENST00000550047 A2MP01023 1474 aa22.31■■□□□ 1.16
SLC8B1-210ENST00000550047 ERBINQ96RT1 1412 aa22.3■■□□□ 1.16
SLC8B1-210ENST00000550047 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SLC8B1-210ENST00000550047 PLA2R1Q13018 1463 aa22.28■■□□□ 1.16
SLC8B1-210ENST00000550047 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.28■■□□□ 1.16
SLC8B1-210ENST00000550047 GSE1Q14687 1217 aa22.28■■□□□ 1.16
SLC8B1-210ENST00000550047 NFKBIBQ15653 356 aa22.28■■□□□ 1.16
SLC8B1-210ENST00000550047 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.28■■□□□ 1.16
SLC8B1-210ENST00000550047 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.27■■□□□ 1.16
SLC8B1-210ENST00000550047 TMF1P82094 1093 aa22.26■■□□□ 1.15
SLC8B1-210ENST00000550047 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SLC8B1-210ENST00000550047 SLC4A3P48751 1232 aa22.25■■□□□ 1.15
SLC8B1-210ENST00000550047 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SLC8B1-210ENST00000550047 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.25■■□□□ 1.15
SLC8B1-210ENST00000550047 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SLC8B1-210ENST00000550047 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.24■■□□□ 1.15
SLC8B1-210ENST00000550047 FAM161AQ3B820 660 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC8B1-210ENST00000550047 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC8B1-210ENST00000550047 ABCC2Q92887 1545 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC8B1-210ENST00000550047 UNC13BO14795 1591 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC8B1-210ENST00000550047 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC8B1-210ENST00000550047 PREX2Q70Z35 1606 aa22.22■■□□□ 1.15
SLC8B1-210ENST00000550047 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.22■■□□□ 1.15
SLC8B1-210ENST00000550047 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.21■■□□□ 1.15
SLC8B1-210ENST00000550047 C8orf34Q49A92 452 aa22.21■■□□□ 1.15
SLC8B1-210ENST00000550047 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC8B1-210ENST00000550047 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
SLC8B1-210ENST00000550047 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
SLC8B1-210ENST00000550047 ZNF521Q96K83 1311 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC8B1-210ENST00000550047 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC8B1-210ENST00000550047 PPP2R1AP30153 589 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC8B1-210ENST00000550047 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SLC8B1-210ENST00000550047 GOLGA2Q08379 1002 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC8B1-210ENST00000550047 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC8B1-210ENST00000550047 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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