RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.24□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 NCOA1Q15788 1441 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 ERBINQ96RT1 1412 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 PLPPR3Q6T4P5 718 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 GGT6Q6P531 493 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 KIF3BO15066 747 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 ITGAEP38570 1179 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 UNC13BO14795 1591 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-211ENST00000548041 ABCC3O15438 1527 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-211ENST00000548041 CNTLNQ9NXG0 1405 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-211ENST00000548041 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-211ENST00000548041 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-211ENST00000548041 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CS-211ENST00000548041 ROCK1Q13464 1354 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-211ENST00000548041 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-211ENST00000548041 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CS-211ENST00000548041 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CS-211ENST00000548041 LMTK3Q96Q04 1460 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-211ENST00000548041 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-211ENST00000548041 ZMYM3Q14202 1370 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-211ENST00000548041 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-211ENST00000548041 TET3O43151 1660 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-211ENST00000548041 PZPP20742 1482 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-211ENST00000548041 E9PCH4 1651 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-211ENST00000548041 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-211ENST00000548041 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-211ENST00000548041 PPP6R1Q9UPN7 881 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-211ENST00000548041 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-211ENST00000548041 NAIPQ13075 1403 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-211ENST00000548041 NPATQ14207 1427 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-211ENST00000548041 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-211ENST00000548041 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CS-211ENST00000548041 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.316e-9■□□□□ 10
CS-211ENST00000548041 STRCQ7RTU9 1775 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-211ENST00000548041 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-211ENST00000548041 HFM1A2PYH4 1435 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-211ENST00000548041 ERVK-7P63135 1459 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-211ENST00000548041 MYO5BQ9ULV0 1848 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-211ENST00000548041 KANK1Q14678 1352 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-211ENST00000548041 SYNMO15061 1565 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-211ENST00000548041 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-211ENST00000548041 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-211ENST00000548041 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-211ENST00000548041 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CS-211ENST00000548041 PIK3C2BO00750 1634 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-211ENST00000548041 HSPA2P54652 639 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-211ENST00000548041 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-211ENST00000548041 TNRQ92752 1358 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-211ENST00000548041 A2ML1A8K2U0 1454 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-211ENST00000548041 NLRP1Q9C000 1473 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-211ENST00000548041 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CS-211ENST00000548041 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13□□□□□ -0.33
CS-211ENST00000548041 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CS-211ENST00000548041 NUP155O75694 1391 aa13□□□□□ -0.33
CS-211ENST00000548041 NOS1P29475 1434 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-211ENST00000548041 NEURL4Q96JN8 1562 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-211ENST00000548041 ADGRB3O60242 1522 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-211ENST00000548041 CLTCL1P53675 1640 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-211ENST00000548041 KIF1BO60333 1816 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-211ENST00000548041 PLA2R1Q13018 1463 aa12.96□□□□□ -0.34
CS-211ENST00000548041 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.96□□□□□ -0.34
CS-211ENST00000548041 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-211ENST00000548041 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-211ENST00000548041 TRPM2O94759 1503 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-211ENST00000548041 IQGAP1P46940 1657 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-211ENST00000548041 TRIM52Q96A61 297 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-211ENST00000548041 SLIT1O75093 1534 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-211ENST00000548041 ARHGAP23Q9P227 1491 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-211ENST00000548041 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-211ENST00000548041 PTPRTO14522 1441 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-211ENST00000548041 IDI1Q13907 227 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-211ENST00000548041 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CS-211ENST00000548041 PKD2Q13563 968 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-211ENST00000548041 STRCP1A6NGW2 1772 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-211ENST00000548041 IFT172Q9UG01 1749 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-211ENST00000548041 FOXD1Q16676 465 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-211ENST00000548041 PPLO60437 1756 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-211ENST00000548041 MED14O60244 1454 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-211ENST00000548041 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-211ENST00000548041 SLC52A1Q9NWF4 448 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-211ENST00000548041 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-211ENST00000548041 TMEM2Q9UHN6 1383 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 ZFYVE9O95405 1425 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 CHGAP10645 457 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 LTBP4Q8N2S1 1624 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 LTKP29376 864 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 ANKLE2Q86XL3 938 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-211ENST00000548041 RIMS2Q9UQ26 1411 aa12.8□□□□□ -0.36
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