RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543803.5

TM7SF3-214, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-214ENST00000543803 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.56■■■■■ 4.08
TM7SF3-214ENST00000543803 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
TM7SF3-214ENST00000543803 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
TM7SF3-214ENST00000543803 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
TM7SF3-214ENST00000543803 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
TM7SF3-214ENST00000543803 ABCC5O15440 1437 aa40.52■■■■■ 4.08
TM7SF3-214ENST00000543803 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.5■■■■■ 4.07
TM7SF3-214ENST00000543803 DAPK1P53355 1430 aa40.49■■■■■ 4.07
TM7SF3-214ENST00000543803 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.46■■■■■ 4.07
TM7SF3-214ENST00000543803 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
TM7SF3-214ENST00000543803 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
TM7SF3-214ENST00000543803 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.44■■■■■ 4.06
TM7SF3-214ENST00000543803 PZPP20742 1482 aa40.43■■■■■ 4.06
TM7SF3-214ENST00000543803 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.42■■■■■ 4.06
TM7SF3-214ENST00000543803 KIF15Q9NS87 1388 aa40.4■■■■■ 4.06
TM7SF3-214ENST00000543803 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.4■■■■■ 4.06
TM7SF3-214ENST00000543803 NCOA1Q15788 1441 aa40.4■■■■■ 4.06
TM7SF3-214ENST00000543803 ABCC3O15438 1527 aa40.36■■■■■ 4.05
TM7SF3-214ENST00000543803 CEP152O94986 1710 aa40.36■■■■■ 4.05
TM7SF3-214ENST00000543803 ERBINQ96RT1 1412 aa40.34■■■■■ 4.05
TM7SF3-214ENST00000543803 PTPRTO14522 1441 aa40.33■■■■■ 4.05
TM7SF3-214ENST00000543803 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.32■■■■■ 4.05
TM7SF3-214ENST00000543803 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
TM7SF3-214ENST00000543803 TNRQ92752 1358 aa40.31■■■■■ 4.04
TM7SF3-214ENST00000543803 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.31■■■■■ 4.04
TM7SF3-214ENST00000543803 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.28■■■■■ 4.04
TM7SF3-214ENST00000543803 FBXO41Q8TF61 875 aa40.28■■■■■ 4.04
TM7SF3-214ENST00000543803 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
TM7SF3-214ENST00000543803 PLA2R1Q13018 1463 aa40.27■■■■■ 4.04
TM7SF3-214ENST00000543803 DEPDC5O75140 1603 aa40.27■■■■■ 4.04
TM7SF3-214ENST00000543803 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
TM7SF3-214ENST00000543803 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
TM7SF3-214ENST00000543803 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.26■■■■■ 4.04
TM7SF3-214ENST00000543803 ADGRL2O95490 1459 aa40.21■■■■■ 4.03
TM7SF3-214ENST00000543803 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.18■■■■■ 4.02
TM7SF3-214ENST00000543803 CERKQ8TCT0 537 aa40.18■■■■■ 4.02
TM7SF3-214ENST00000543803 NLRP1Q9C000 1473 aa40.18■■■■■ 4.02
TM7SF3-214ENST00000543803 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.16■■■■■ 4.02
TM7SF3-214ENST00000543803 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
TM7SF3-214ENST00000543803 PKD2Q13563 968 aa40.15■■■■■ 4.02
TM7SF3-214ENST00000543803 ERVK-7P63135 1459 aa40.13■■■■■ 4.01
TM7SF3-214ENST00000543803 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.09■■■■■ 4.01
TM7SF3-214ENST00000543803 KANK1Q14678 1352 aa40.09■■■■■ 4.01
TM7SF3-214ENST00000543803 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.08■■■■■ 4.01
TM7SF3-214ENST00000543803 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.07■■■■■ 4
TM7SF3-214ENST00000543803 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.05■■■■■ 4
TM7SF3-214ENST00000543803 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
TM7SF3-214ENST00000543803 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.04■■■■■ 4
TM7SF3-214ENST00000543803 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.01■■■■■ 4
TM7SF3-214ENST00000543803 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
TM7SF3-214ENST00000543803 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.99■■■■□ 3.99
TM7SF3-214ENST00000543803 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.99■■■■□ 3.99
TM7SF3-214ENST00000543803 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.97■■■■□ 3.99
TM7SF3-214ENST00000543803 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.97■■■■□ 3.99
TM7SF3-214ENST00000543803 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.91■■■■□ 3.98
TM7SF3-214ENST00000543803 ROCK1Q13464 1354 aa39.91■■■■□ 3.98
TM7SF3-214ENST00000543803 EFCAB6Q5THR3 1501 aa39.91■■■■□ 3.98
TM7SF3-214ENST00000543803 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
TM7SF3-214ENST00000543803 UNC13BO14795 1591 aa39.86■■■■□ 3.97
TM7SF3-214ENST00000543803 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.86■■■■□ 3.97
TM7SF3-214ENST00000543803 PIK3C2BO00750 1634 aa39.84■■■■□ 3.97
TM7SF3-214ENST00000543803 MED14O60244 1454 aa39.84■■■■□ 3.97
TM7SF3-214ENST00000543803 TET3O43151 1660 aa39.83■■■■□ 3.97
TM7SF3-214ENST00000543803 IQGAP1P46940 1657 aa39.83■■■■□ 3.97
TM7SF3-214ENST00000543803 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.81■■■■□ 3.96
TM7SF3-214ENST00000543803 ITGAEP38570 1179 aa39.81■■■■□ 3.96
TM7SF3-214ENST00000543803 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
TM7SF3-214ENST00000543803 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
TM7SF3-214ENST00000543803 SYNMO15061 1565 aa39.79■■■■□ 3.96
TM7SF3-214ENST00000543803 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
TM7SF3-214ENST00000543803 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
TM7SF3-214ENST00000543803 NOS1P29475 1434 aa39.74■■■■□ 3.95
TM7SF3-214ENST00000543803 SLIT1O75093 1534 aa39.74■■■■□ 3.95
TM7SF3-214ENST00000543803 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.72■■■■□ 3.95
TM7SF3-214ENST00000543803 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39.71■■■■□ 3.95
TM7SF3-214ENST00000543803 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
TM7SF3-214ENST00000543803 CPS1P31327 1500 aa39.66■■■■□ 3.94
TM7SF3-214ENST00000543803 E9PCH4 1651 aa39.66■■■■□ 3.94
TM7SF3-214ENST00000543803 IDI1Q13907 227 aa39.65■■■■□ 3.94
TM7SF3-214ENST00000543803 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.65■■■■□ 3.94
TM7SF3-214ENST00000543803 ADGRB3O60242 1522 aa39.62■■■■□ 3.93
TM7SF3-214ENST00000543803 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.6■■■■□ 3.93
TM7SF3-214ENST00000543803 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.6■■■■□ 3.93
TM7SF3-214ENST00000543803 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.6■■■■□ 3.93
TM7SF3-214ENST00000543803 LTKP29376 864 aa39.59■■■■□ 3.93
TM7SF3-214ENST00000543803 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.59■■■■□ 3.93
TM7SF3-214ENST00000543803 EID1Q9Y6B2 187 aa39.58■■■■□ 3.93
TM7SF3-214ENST00000543803 STRCP1A6NGW2 1772 aa39.57■■■■□ 3.93
TM7SF3-214ENST00000543803 NUP155O75694 1391 aa39.56■■■■□ 3.92
TM7SF3-214ENST00000543803 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.47■■■■□ 3.91
TM7SF3-214ENST00000543803 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.47■■■■□ 3.91
TM7SF3-214ENST00000543803 NAIPQ13075 1403 aa39.45■■■■□ 3.91
TM7SF3-214ENST00000543803 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa39.41■■■■□ 3.9
TM7SF3-214ENST00000543803 LRRC7Q96NW7 1537 aa39.37■■■■□ 3.89
TM7SF3-214ENST00000543803 HFM1A2PYH4 1435 aa39.35■■■■□ 3.89
TM7SF3-214ENST00000543803 ZFYVE9O95405 1425 aa39.35■■■■□ 3.89
TM7SF3-214ENST00000543803 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.31■■■■□ 3.88
TM7SF3-214ENST00000543803 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
TM7SF3-214ENST00000543803 TOM1O60784 492 aa39.29■■■■□ 3.88
TM7SF3-214ENST00000543803 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 161.1 ms