RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537248.5

ZNF384-208, Transcript of zinc finger protein 384, human

TSL 2

Gene ZNF384, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF384-208	ENST00000537248	PIP4K2B	P78356	416 aa		29.63	■■■□□ 2.33
ZNF384-208	ENST00000537248	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	29.62	■■■□□ 2.33
ZNF384-208	ENST00000537248	TOM1	O60784	492 aa		29.6	■■■□□ 2.33
ZNF384-208	ENST00000537248	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		29.6	■■■□□ 2.33
ZNF384-208	ENST00000537248	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		29.6	■■■□□ 2.33
ZNF384-208	ENST00000537248	TNR	Q92752	1358 aa		29.59	■■■□□ 2.33
ZNF384-208	ENST00000537248	PZP	P20742	1482 aa		29.58	■■■□□ 2.33
ZNF384-208	ENST00000537248	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		29.58	■■■□□ 2.33
ZNF384-208	ENST00000537248	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	29.58	■■■□□ 2.33
ZNF384-208	ENST00000537248	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	29.58	■■■□□ 2.33
ZNF384-208	ENST00000537248	ALK	Q9UM73	1620 aa		29.58	■■■□□ 2.33
ZNF384-208	ENST00000537248	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		29.56	■■■□□ 2.32
ZNF384-208	ENST00000537248	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		29.55	■■■□□ 2.32
ZNF384-208	ENST00000537248	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	29.52	■■■□□ 2.32
ZNF384-208	ENST00000537248	DEPDC5	O75140	1603 aa		29.52	■■■□□ 2.32
ZNF384-208	ENST00000537248	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		29.5	■■■□□ 2.31
ZNF384-208	ENST00000537248	MED14	O60244	1454 aa		29.5	■■■□□ 2.31
ZNF384-208	ENST00000537248	KIF3B	O15066	747 aa		29.49	■■■□□ 2.31
ZNF384-208	ENST00000537248	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		29.49	■■■□□ 2.31
ZNF384-208	ENST00000537248	NLRP1	Q9C000	1473 aa		29.48	■■■□□ 2.31
ZNF384-208	ENST00000537248	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		29.47	■■■□□ 2.31
ZNF384-208	ENST00000537248	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		29.47	■■■□□ 2.31
ZNF384-208	ENST00000537248	IQGAP1	P46940	1657 aa		29.47	■■■□□ 2.31
ZNF384-208	ENST00000537248	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	29.45	■■■□□ 2.31
ZNF384-208	ENST00000537248	MIA2	Q96PC5	1412 aa		29.45	■■■□□ 2.31
ZNF384-208	ENST00000537248	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		29.45	■■■□□ 2.31
ZNF384-208	ENST00000537248	CEP162	Q5TB80	1403 aa		29.45	■■■□□ 2.3
ZNF384-208	ENST00000537248	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	29.44	■■■□□ 2.3
ZNF384-208	ENST00000537248	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		29.44	■■■□□ 2.3
ZNF384-208	ENST00000537248	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	29.4	■■■□□ 2.3
ZNF384-208	ENST00000537248	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		29.4	■■■□□ 2.3
ZNF384-208	ENST00000537248	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	29.38	■■■□□ 2.29
ZNF384-208	ENST00000537248	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		29.37	■■■□□ 2.29
ZNF384-208	ENST00000537248	SYNM	O15061	1565 aa		29.37	■■■□□ 2.29
ZNF384-208	ENST00000537248	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
ZNF384-208	ENST00000537248	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		29.32	■■■□□ 2.28
ZNF384-208	ENST00000537248	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		29.31	■■■□□ 2.28
ZNF384-208	ENST00000537248	NCOA2	Q15596	1464 aa		29.3	■■■□□ 2.28
ZNF384-208	ENST00000537248	ABCC3	O15438	1527 aa		29.3	■■■□□ 2.28
ZNF384-208	ENST00000537248	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
ZNF384-208	ENST00000537248	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		29.26	■■■□□ 2.27
ZNF384-208	ENST00000537248	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	29.26	■■■□□ 2.27
ZNF384-208	ENST00000537248	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
ZNF384-208	ENST00000537248	ERVK-7	P63135	1459 aa		29.25	■■■□□ 2.27
ZNF384-208	ENST00000537248	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		29.22	■■■□□ 2.27
ZNF384-208	ENST00000537248	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
ZNF384-208	ENST00000537248	CEP152	O94986	1710 aa		29.21	■■■□□ 2.27
ZNF384-208	ENST00000537248	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		29.2	■■■□□ 2.26
ZNF384-208	ENST00000537248	TSPY4	P0CV99	314 aa		29.19	■■■□□ 2.26
ZNF384-208	ENST00000537248	TSPY10	P0CW01	314 aa		29.19	■■■□□ 2.26
ZNF384-208	ENST00000537248	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
ZNF384-208	ENST00000537248	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
ZNF384-208	ENST00000537248	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		29.13	■■■□□ 2.25
ZNF384-208	ENST00000537248	SLIT1	O75093	1534 aa		29.13	■■■□□ 2.25
ZNF384-208	ENST00000537248	LTK	P29376	864 aa		29.1	■■■□□ 2.25
ZNF384-208	ENST00000537248	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		29.04	■■■□□ 2.24
ZNF384-208	ENST00000537248	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		29.03	■■■□□ 2.24
ZNF384-208	ENST00000537248	PIK3C2B	O00750	1634 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ZNF384-208	ENST00000537248	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
ZNF384-208	ENST00000537248	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ZNF384-208	ENST00000537248	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ZNF384-208	ENST00000537248	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ZNF384-208	ENST00000537248	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		28.98	■■■□□ 2.23
ZNF384-208	ENST00000537248	POTEA	Q6S8J7	498 aa		28.97	■■■□□ 2.23
ZNF384-208	ENST00000537248	EID1	Q9Y6B2	187 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ZNF384-208	ENST00000537248	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
ZNF384-208	ENST00000537248	MAP3K1	Q13233	1512 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ZNF384-208	ENST00000537248	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ZNF384-208	ENST00000537248	TMEM94	Q12767	1356 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ZNF384-208	ENST00000537248	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ZNF384-208	ENST00000537248	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ZNF384-208	ENST00000537248	TET3	O43151	1660 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ZNF384-208	ENST00000537248	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ZNF384-208	ENST00000537248	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.89	■■■□□ 2.21
ZNF384-208	ENST00000537248	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.21
ZNF384-208	ENST00000537248	KIF15	Q9NS87	1388 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ZNF384-208	ENST00000537248	KCNA6	P17658	529 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ZNF384-208	ENST00000537248	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ZNF384-208	ENST00000537248	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
ZNF384-208	ENST00000537248	NWD1	Q149M9	1564 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ZNF384-208	ENST00000537248	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
ZNF384-208	ENST00000537248	PHLPP1	O60346	1717 aa		28.81	■■■□□ 2.2
ZNF384-208	ENST00000537248	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
ZNF384-208	ENST00000537248	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		28.81	■■■□□ 2.2
ZNF384-208	ENST00000537248	ABCC5	O15440	1437 aa		28.8	■■■□□ 2.2
ZNF384-208	ENST00000537248	IDI1	Q13907	227 aa		28.8	■■■□□ 2.2
ZNF384-208	ENST00000537248	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
ZNF384-208	ENST00000537248	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		28.8	■■■□□ 2.2
ZNF384-208	ENST00000537248	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	28.8	■■■□□ 2.2	9e-9	■□□□□ 11.2
ZNF384-208	ENST00000537248	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.79	■■■□□ 2.2
ZNF384-208	ENST00000537248	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		28.79	■■■□□ 2.2
ZNF384-208	ENST00000537248	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.76	■■■□□ 2.19
ZNF384-208	ENST00000537248	KANK1	Q14678	1352 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ZNF384-208	ENST00000537248	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		28.74	■■■□□ 2.19
ZNF384-208	ENST00000537248	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
ZNF384-208	ENST00000537248	NOS1	P29475	1434 aa		28.72	■■■□□ 2.19
ZNF384-208	ENST00000537248	MSH6	P52701	1360 aa		28.72	■■■□□ 2.19
ZNF384-208	ENST00000537248	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
ZNF384-208	ENST00000537248	JCAD	Q9P266	1359 aa		28.71	■■■□□ 2.19
ZNF384-208	ENST00000537248	DAPK1	P53355	1430 aa		28.7	■■■□□ 2.19

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