RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530939.5

CHID1-217, Transcript of chitinase domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene CHID1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1-217ENST00000530939 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.13■■■■■ 4.17
CHID1-217ENST00000530939 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
CHID1-217ENST00000530939 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
CHID1-217ENST00000530939 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
CHID1-217ENST00000530939 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.1■■■■■ 4.17
CHID1-217ENST00000530939 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
CHID1-217ENST00000530939 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.09■■■■■ 4.17
CHID1-217ENST00000530939 DAPK1P53355 1430 aa41.09■■■■■ 4.17
CHID1-217ENST00000530939 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.08■■■■■ 4.17
CHID1-217ENST00000530939 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
CHID1-217ENST00000530939 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.04■■■■■ 4.16
CHID1-217ENST00000530939 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
CHID1-217ENST00000530939 KIF15Q9NS87 1388 aa41.03■■■■■ 4.16
CHID1-217ENST00000530939 PZPP20742 1482 aa41.02■■■■■ 4.16
CHID1-217ENST00000530939 NCOA1Q15788 1441 aa41.01■■■■■ 4.16
CHID1-217ENST00000530939 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.01■■■■■ 4.16
CHID1-217ENST00000530939 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
CHID1-217ENST00000530939 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
CHID1-217ENST00000530939 FBXO41Q8TF61 875 aa40.96■■■■■ 4.15
CHID1-217ENST00000530939 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.96■■■■■ 4.15
CHID1-217ENST00000530939 ABCC3O15438 1527 aa40.95■■■■■ 4.15
CHID1-217ENST00000530939 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
CHID1-217ENST00000530939 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.95■■■■■ 4.15
CHID1-217ENST00000530939 TNRQ92752 1358 aa40.95■■■■■ 4.15
CHID1-217ENST00000530939 PTPRTO14522 1441 aa40.93■■■■■ 4.14
CHID1-217ENST00000530939 CEP152O94986 1710 aa40.93■■■■■ 4.14
CHID1-217ENST00000530939 ERBINQ96RT1 1412 aa40.92■■■■■ 4.14
CHID1-217ENST00000530939 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.91■■■■■ 4.14
CHID1-217ENST00000530939 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.89■■■■■ 4.14
CHID1-217ENST00000530939 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.88■■■■■ 4.13
CHID1-217ENST00000530939 CERKQ8TCT0 537 aa40.87■■■■■ 4.13
CHID1-217ENST00000530939 PLA2R1Q13018 1463 aa40.85■■■■■ 4.13
CHID1-217ENST00000530939 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
CHID1-217ENST00000530939 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.12
CHID1-217ENST00000530939 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.8■■■■■ 4.12
CHID1-217ENST00000530939 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
CHID1-217ENST00000530939 PKD2Q13563 968 aa40.78■■■■■ 4.12
CHID1-217ENST00000530939 DEPDC5O75140 1603 aa40.78■■■■■ 4.12
CHID1-217ENST00000530939 ADGRL2O95490 1459 aa40.76■■■■■ 4.12
CHID1-217ENST00000530939 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.75■■■■■ 4.11
CHID1-217ENST00000530939 NLRP1Q9C000 1473 aa40.75■■■■■ 4.11
CHID1-217ENST00000530939 ERVK-7P63135 1459 aa40.73■■■■■ 4.11
CHID1-217ENST00000530939 KANK1Q14678 1352 aa40.72■■■■■ 4.11
CHID1-217ENST00000530939 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
CHID1-217ENST00000530939 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.69■■■■■ 4.1
CHID1-217ENST00000530939 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
CHID1-217ENST00000530939 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.64■■■■■ 4.1
CHID1-217ENST00000530939 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.63■■■■■ 4.1
CHID1-217ENST00000530939 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.62■■■■■ 4.09
CHID1-217ENST00000530939 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.59■■■■■ 4.09
CHID1-217ENST00000530939 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.57■■■■■ 4.09
CHID1-217ENST00000530939 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.57■■■■■ 4.08
CHID1-217ENST00000530939 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.56■■■■■ 4.08
CHID1-217ENST00000530939 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
CHID1-217ENST00000530939 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.55■■■■■ 4.08
CHID1-217ENST00000530939 ITGAEP38570 1179 aa40.54■■■■■ 4.08
CHID1-217ENST00000530939 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.52■■■■■ 4.08
CHID1-217ENST00000530939 ROCK1Q13464 1354 aa40.47■■■■■ 4.07
CHID1-217ENST00000530939 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.47■■■■■ 4.07
CHID1-217ENST00000530939 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
CHID1-217ENST00000530939 PIK3C2BO00750 1634 aa40.42■■■■■ 4.06
CHID1-217ENST00000530939 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.41■■■■■ 4.06
CHID1-217ENST00000530939 IQGAP1P46940 1657 aa40.4■■■■■ 4.06
CHID1-217ENST00000530939 MED14O60244 1454 aa40.39■■■■■ 4.06
CHID1-217ENST00000530939 UNC13BO14795 1591 aa40.39■■■■■ 4.06
CHID1-217ENST00000530939 SYNMO15061 1565 aa40.36■■■■■ 4.05
CHID1-217ENST00000530939 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.36■■■■■ 4.05
CHID1-217ENST00000530939 TET3O43151 1660 aa40.36■■■■■ 4.05
CHID1-217ENST00000530939 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.32■■■■■ 4.05
CHID1-217ENST00000530939 NOS1P29475 1434 aa40.32■■■■■ 4.04
CHID1-217ENST00000530939 IDI1Q13907 227 aa40.3■■■■■ 4.04
CHID1-217ENST00000530939 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
CHID1-217ENST00000530939 SLIT1O75093 1534 aa40.29■■■■■ 4.04
CHID1-217ENST00000530939 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
CHID1-217ENST00000530939 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
CHID1-217ENST00000530939 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.28■■■■■ 4.04
CHID1-217ENST00000530939 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
CHID1-217ENST00000530939 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.26■■■■■ 4.04
CHID1-217ENST00000530939 CPS1P31327 1500 aa40.25■■■■■ 4.03
CHID1-217ENST00000530939 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.24■■■■■ 4.03
CHID1-217ENST00000530939 LTKP29376 864 aa40.23■■■■■ 4.03
CHID1-217ENST00000530939 EID1Q9Y6B2 187 aa40.23■■■■■ 4.03
CHID1-217ENST00000530939 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.21■■■■■ 4.03
CHID1-217ENST00000530939 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.2■■■■■ 4.03
CHID1-217ENST00000530939 E9PCH4 1651 aa40.2■■■■■ 4.03
CHID1-217ENST00000530939 ADGRB3O60242 1522 aa40.2■■■■■ 4.03
CHID1-217ENST00000530939 NUP155O75694 1391 aa40.19■■■■■ 4.02
CHID1-217ENST00000530939 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.18■■■■■ 4.02
CHID1-217ENST00000530939 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.13■■■■■ 4.02
CHID1-217ENST00000530939 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.13■■■■■ 4.01
CHID1-217ENST00000530939 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.02■■■■■ 4
CHID1-217ENST00000530939 NAIPQ13075 1403 aa40.01■■■■■ 4
CHID1-217ENST00000530939 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
CHID1-217ENST00000530939 LRRC7Q96NW7 1537 aa39.97■■■■□ 3.99
CHID1-217ENST00000530939 BCANQ96GW7 911 aa39.96■■■■□ 3.99
CHID1-217ENST00000530939 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
CHID1-217ENST00000530939 TOM1O60784 492 aa39.95■■■■□ 3.99
CHID1-217ENST00000530939 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.93■■■■□ 3.98
CHID1-217ENST00000530939 PIP4K2BP78356 416 aa39.93■■■■□ 3.98
CHID1-217ENST00000530939 SLC26A8Q96RN1 970 aa39.93■■■■□ 3.98
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