RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527225.1

SPCS2-204, Transcript of signal peptidase complex subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPCS2, Length 321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2-204ENST00000527225 PTPRKQ15262 1439 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2-204ENST00000527225 STRCQ7RTU9 1775 aa26.57■■□□□ 1.84
SPCS2-204ENST00000527225 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SPCS2-204ENST00000527225 DAPK1P53355 1430 aa26.56■■□□□ 1.84
SPCS2-204ENST00000527225 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.55■■□□□ 1.84
SPCS2-204ENST00000527225 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.54■■□□□ 1.84
SPCS2-204ENST00000527225 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SPCS2-204ENST00000527225 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.52■■□□□ 1.84
SPCS2-204ENST00000527225 KIF15Q9NS87 1388 aa26.5■■□□□ 1.83
SPCS2-204ENST00000527225 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SPCS2-204ENST00000527225 PZPP20742 1482 aa26.49■■□□□ 1.83
SPCS2-204ENST00000527225 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.47■■□□□ 1.83
SPCS2-204ENST00000527225 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.47■■□□□ 1.83
SPCS2-204ENST00000527225 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SPCS2-204ENST00000527225 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SPCS2-204ENST00000527225 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.46■■□□□ 1.83
SPCS2-204ENST00000527225 ERBINQ96RT1 1412 aa26.46■■□□□ 1.83
SPCS2-204ENST00000527225 ABCC3O15438 1527 aa26.44■■□□□ 1.82
SPCS2-204ENST00000527225 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.44■■□□□ 1.82
SPCS2-204ENST00000527225 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.44■■□□□ 1.82
SPCS2-204ENST00000527225 CEP152O94986 1710 aa26.43■■□□□ 1.82
SPCS2-204ENST00000527225 NCOA1Q15788 1441 aa26.43■■□□□ 1.82
SPCS2-204ENST00000527225 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SPCS2-204ENST00000527225 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SPCS2-204ENST00000527225 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.41■■□□□ 1.82
SPCS2-204ENST00000527225 TNRQ92752 1358 aa26.41■■□□□ 1.82
SPCS2-204ENST00000527225 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.4■■□□□ 1.82
SPCS2-204ENST00000527225 PTPRTO14522 1441 aa26.39■■□□□ 1.82
SPCS2-204ENST00000527225 ADGRL2O95490 1459 aa26.39■■□□□ 1.82
SPCS2-204ENST00000527225 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
SPCS2-204ENST00000527225 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
SPCS2-204ENST00000527225 DEPDC5O75140 1603 aa26.38■■□□□ 1.81
SPCS2-204ENST00000527225 PLA2R1Q13018 1463 aa26.36■■□□□ 1.81
SPCS2-204ENST00000527225 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.33■■□□□ 1.8
SPCS2-204ENST00000527225 FBXO41Q8TF61 875 aa26.32■■□□□ 1.8
SPCS2-204ENST00000527225 NLRP1Q9C000 1473 aa26.31■■□□□ 1.8
SPCS2-204ENST00000527225 PKD2Q13563 968 aa26.3■■□□□ 1.8
SPCS2-204ENST00000527225 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SPCS2-204ENST00000527225 ERVK-7P63135 1459 aa26.3■■□□□ 1.8
SPCS2-204ENST00000527225 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.29■■□□□ 1.8
SPCS2-204ENST00000527225 KANK1Q14678 1352 aa26.29■■□□□ 1.8
SPCS2-204ENST00000527225 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
SPCS2-204ENST00000527225 CERKQ8TCT0 537 aa26.27■■□□□ 1.8
SPCS2-204ENST00000527225 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.27■■□□□ 1.8
SPCS2-204ENST00000527225 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SPCS2-204ENST00000527225 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.25■■□□□ 1.79
SPCS2-204ENST00000527225 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.24■■□□□ 1.79
SPCS2-204ENST00000527225 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.24■■□□□ 1.79
SPCS2-204ENST00000527225 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
SPCS2-204ENST00000527225 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.24■■□□□ 1.79
SPCS2-204ENST00000527225 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SPCS2-204ENST00000527225 ROCK1Q13464 1354 aa26.2■■□□□ 1.79
SPCS2-204ENST00000527225 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.18■■□□□ 1.78
SPCS2-204ENST00000527225 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.17■■□□□ 1.78
SPCS2-204ENST00000527225 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.16■■□□□ 1.78
SPCS2-204ENST00000527225 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.15■■□□□ 1.78
SPCS2-204ENST00000527225 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.15■■□□□ 1.78
SPCS2-204ENST00000527225 UNC13BO14795 1591 aa26.13■■□□□ 1.77
SPCS2-204ENST00000527225 ITGAEP38570 1179 aa26.13■■□□□ 1.77
SPCS2-204ENST00000527225 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SPCS2-204ENST00000527225 TET3O43151 1660 aa26.11■■□□□ 1.77
SPCS2-204ENST00000527225 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.09■■□□□ 1.77
SPCS2-204ENST00000527225 PIK3C2BO00750 1634 aa26.09■■□□□ 1.77
SPCS2-204ENST00000527225 MED14O60244 1454 aa26.09■■□□□ 1.77
SPCS2-204ENST00000527225 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SPCS2-204ENST00000527225 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.07■■□□□ 1.76
SPCS2-204ENST00000527225 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SPCS2-204ENST00000527225 SYNMO15061 1565 aa26.07■■□□□ 1.76
SPCS2-204ENST00000527225 NOS1P29475 1434 aa26.06■■□□□ 1.76
SPCS2-204ENST00000527225 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SPCS2-204ENST00000527225 IQGAP1P46940 1657 aa26.06■■□□□ 1.76
SPCS2-204ENST00000527225 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SPCS2-204ENST00000527225 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.03■■□□□ 1.76
SPCS2-204ENST00000527225 SLIT1O75093 1534 aa26.03■■□□□ 1.76
SPCS2-204ENST00000527225 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.02■■□□□ 1.76
SPCS2-204ENST00000527225 IDI1Q13907 227 aa26■■□□□ 1.75
SPCS2-204ENST00000527225 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SPCS2-204ENST00000527225 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.99■■□□□ 1.75
SPCS2-204ENST00000527225 E9PCH4 1651 aa25.99■■□□□ 1.75
SPCS2-204ENST00000527225 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.98■■□□□ 1.75
SPCS2-204ENST00000527225 NUP155O75694 1391 aa25.95■■□□□ 1.75
SPCS2-204ENST00000527225 ADGRB3O60242 1522 aa25.95■■□□□ 1.74
SPCS2-204ENST00000527225 CPS1P31327 1500 aa25.95■■□□□ 1.74
SPCS2-204ENST00000527225 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.95■■□□□ 1.74
SPCS2-204ENST00000527225 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.95■■□□□ 1.74
SPCS2-204ENST00000527225 LTKP29376 864 aa25.94■■□□□ 1.74
SPCS2-204ENST00000527225 EID1Q9Y6B2 187 aa25.94■■□□□ 1.74
SPCS2-204ENST00000527225 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.93■■□□□ 1.74
SPCS2-204ENST00000527225 NAIPQ13075 1403 aa25.89■■□□□ 1.74
SPCS2-204ENST00000527225 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.88■■□□□ 1.73
SPCS2-204ENST00000527225 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.86■■□□□ 1.73
SPCS2-204ENST00000527225 HFM1A2PYH4 1435 aa25.84■■□□□ 1.73
SPCS2-204ENST00000527225 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.83■■□□□ 1.72
SPCS2-204ENST00000527225 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.82■■□□□ 1.72
SPCS2-204ENST00000527225 ZFYVE9O95405 1425 aa25.79■■□□□ 1.72
SPCS2-204ENST00000527225 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.77■■□□□ 1.72
SPCS2-204ENST00000527225 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SPCS2-204ENST00000527225 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SPCS2-204ENST00000527225 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.76■■□□□ 1.71
SPCS2-204ENST00000527225 TOM1O60784 492 aa25.72■■□□□ 1.71
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