RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522721.1

SORBS3-215, Transcript of sorbin and SH3 domain containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene SORBS3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3-215ENST00000522721 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.2■■■■□ 3.39
SORBS3-215ENST00000522721 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
SORBS3-215ENST00000522721 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
SORBS3-215ENST00000522721 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.16■■■■□ 3.38
SORBS3-215ENST00000522721 KIF15Q9NS87 1388 aa36.13■■■■□ 3.37
SORBS3-215ENST00000522721 STRCQ7RTU9 1775 aa36.11■■■■□ 3.37
SORBS3-215ENST00000522721 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.1■■■■□ 3.37
SORBS3-215ENST00000522721 PZPP20742 1482 aa36.1■■■■□ 3.37
SORBS3-215ENST00000522721 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.09■■■■□ 3.37
SORBS3-215ENST00000522721 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.08■■■■□ 3.37
SORBS3-215ENST00000522721 ERBINQ96RT1 1412 aa36.07■■■■□ 3.36
SORBS3-215ENST00000522721 ABCC3O15438 1527 aa36.05■■■■□ 3.36
SORBS3-215ENST00000522721 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
SORBS3-215ENST00000522721 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.05■■■■□ 3.36
SORBS3-215ENST00000522721 NCOA1Q15788 1441 aa36.03■■■■□ 3.36
SORBS3-215ENST00000522721 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
SORBS3-215ENST00000522721 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
SORBS3-215ENST00000522721 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
SORBS3-215ENST00000522721 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.01■■■■□ 3.35
SORBS3-215ENST00000522721 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
SORBS3-215ENST00000522721 ADGRL2O95490 1459 aa36■■■■□ 3.35
SORBS3-215ENST00000522721 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36■■■■□ 3.35
SORBS3-215ENST00000522721 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
SORBS3-215ENST00000522721 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.98■■■■□ 3.35
SORBS3-215ENST00000522721 TNRQ92752 1358 aa35.98■■■■□ 3.35
SORBS3-215ENST00000522721 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
SORBS3-215ENST00000522721 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.96■■■■□ 3.35
SORBS3-215ENST00000522721 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.95■■■■□ 3.35
SORBS3-215ENST00000522721 PTPRTO14522 1441 aa35.95■■■■□ 3.35
SORBS3-215ENST00000522721 PLA2R1Q13018 1463 aa35.92■■■■□ 3.34
SORBS3-215ENST00000522721 DEPDC5O75140 1603 aa35.92■■■■□ 3.34
SORBS3-215ENST00000522721 CEP152O94986 1710 aa35.88■■■■□ 3.34
SORBS3-215ENST00000522721 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.88■■■■□ 3.33
SORBS3-215ENST00000522721 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
SORBS3-215ENST00000522721 ERVK-7P63135 1459 aa35.85■■■■□ 3.33
SORBS3-215ENST00000522721 NLRP1Q9C000 1473 aa35.84■■■■□ 3.33
SORBS3-215ENST00000522721 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.83■■■■□ 3.33
SORBS3-215ENST00000522721 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.82■■■■□ 3.32
SORBS3-215ENST00000522721 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.82■■■■□ 3.32
SORBS3-215ENST00000522721 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.8■■■■□ 3.32
SORBS3-215ENST00000522721 PKD2Q13563 968 aa35.79■■■■□ 3.32
SORBS3-215ENST00000522721 FBXO41Q8TF61 875 aa35.79■■■■□ 3.32
SORBS3-215ENST00000522721 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.78■■■■□ 3.32
SORBS3-215ENST00000522721 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.77■■■■□ 3.32
SORBS3-215ENST00000522721 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.77■■■■□ 3.322e-8■■□□□ 14.2
SORBS3-215ENST00000522721 CERKQ8TCT0 537 aa35.76■■■■□ 3.32
SORBS3-215ENST00000522721 KANK1Q14678 1352 aa35.76■■■■□ 3.31
SORBS3-215ENST00000522721 ROCK1Q13464 1354 aa35.75■■■■□ 3.31
SORBS3-215ENST00000522721 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.72■■■■□ 3.31
SORBS3-215ENST00000522721 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.68■■■■□ 3.3
SORBS3-215ENST00000522721 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
SORBS3-215ENST00000522721 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
SORBS3-215ENST00000522721 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.66■■■■□ 3.3
SORBS3-215ENST00000522721 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.63■■■■□ 3.29
SORBS3-215ENST00000522721 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
SORBS3-215ENST00000522721 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
SORBS3-215ENST00000522721 UNC13BO14795 1591 aa35.59■■■■□ 3.29
SORBS3-215ENST00000522721 ITGAEP38570 1179 aa35.58■■■■□ 3.29
SORBS3-215ENST00000522721 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.57■■■■□ 3.28
SORBS3-215ENST00000522721 NOS1P29475 1434 aa35.57■■■■□ 3.28
SORBS3-215ENST00000522721 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.56■■■■□ 3.28
SORBS3-215ENST00000522721 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
SORBS3-215ENST00000522721 MED14O60244 1454 aa35.55■■■■□ 3.28
SORBS3-215ENST00000522721 SYNMO15061 1565 aa35.52■■■■□ 3.28
SORBS3-215ENST00000522721 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
SORBS3-215ENST00000522721 TET3O43151 1660 aa35.5■■■■□ 3.27
SORBS3-215ENST00000522721 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.49■■■■□ 3.27
SORBS3-215ENST00000522721 PIK3C2BO00750 1634 aa35.49■■■■□ 3.27
SORBS3-215ENST00000522721 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
SORBS3-215ENST00000522721 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.48■■■■□ 3.27
SORBS3-215ENST00000522721 SLIT1O75093 1534 aa35.47■■■■□ 3.27
SORBS3-215ENST00000522721 IDI1Q13907 227 aa35.45■■■■□ 3.27
SORBS3-215ENST00000522721 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.43■■■■□ 3.26
SORBS3-215ENST00000522721 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.43■■■■□ 3.26
SORBS3-215ENST00000522721 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
SORBS3-215ENST00000522721 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
SORBS3-215ENST00000522721 IQGAP1P46940 1657 aa35.4■■■■□ 3.26
SORBS3-215ENST00000522721 LTKP29376 864 aa35.38■■■■□ 3.25
SORBS3-215ENST00000522721 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.38■■■■□ 3.25
SORBS3-215ENST00000522721 NUP155O75694 1391 aa35.38■■■■□ 3.25
SORBS3-215ENST00000522721 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.38■■■■□ 3.25
SORBS3-215ENST00000522721 NAIPQ13075 1403 aa35.35■■■■□ 3.25
SORBS3-215ENST00000522721 E9PCH4 1651 aa35.35■■■■□ 3.25
SORBS3-215ENST00000522721 ADGRB3O60242 1522 aa35.35■■■■□ 3.25
SORBS3-215ENST00000522721 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.32■■■■□ 3.24
SORBS3-215ENST00000522721 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.31■■■■□ 3.24
SORBS3-215ENST00000522721 CPS1P31327 1500 aa35.31■■■■□ 3.24
SORBS3-215ENST00000522721 EID1Q9Y6B2 187 aa35.27■■■■□ 3.24
SORBS3-215ENST00000522721 HFM1A2PYH4 1435 aa35.26■■■■□ 3.24
SORBS3-215ENST00000522721 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.2■■■■□ 3.23
SORBS3-215ENST00000522721 ZFYVE9O95405 1425 aa35.19■■■■□ 3.22
SORBS3-215ENST00000522721 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.18■■■■□ 3.22
SORBS3-215ENST00000522721 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.13■■■■□ 3.21
SORBS3-215ENST00000522721 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.11■■■■□ 3.21
SORBS3-215ENST00000522721 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.11■■■■□ 3.21
SORBS3-215ENST00000522721 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.1■■■■□ 3.21
SORBS3-215ENST00000522721 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.07■■■■□ 3.2
SORBS3-215ENST00000522721 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.05■■■■□ 3.2
SORBS3-215ENST00000522721 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
SORBS3-215ENST00000522721 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.02■■■■□ 3.2
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