RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511309.5

PRELID1-208, Transcript of PRELI domain containing 1, human

TSL 2

Gene PRELID1, Length 778 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRELID1-208	ENST00000511309	NPAT	Q14207	1427 aa		34.05	■■■■□ 3.04
PRELID1-208	ENST00000511309	ZMYM3	Q14202	1370 aa		34.05	■■■■□ 3.04
PRELID1-208	ENST00000511309	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	34.04	■■■■□ 3.04
PRELID1-208	ENST00000511309	NCOA1	Q15788	1441 aa		34.02	■■■■□ 3.04
PRELID1-208	ENST00000511309	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.99	■■■■□ 3.03
PRELID1-208	ENST00000511309	ITGAE	P38570	1179 aa		33.99	■■■■□ 3.03
PRELID1-208	ENST00000511309	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		33.99	■■■■□ 3.03
PRELID1-208	ENST00000511309	GGT6	Q6P531	493 aa		33.96	■■■■□ 3.03
PRELID1-208	ENST00000511309	KIF3B	O15066	747 aa		33.95	■■■■□ 3.03
PRELID1-208	ENST00000511309	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33.95	■■■■□ 3.02
PRELID1-208	ENST00000511309	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.95	■■■■□ 3.02
PRELID1-208	ENST00000511309	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.94	■■■■□ 3.02
PRELID1-208	ENST00000511309	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		33.94	■■■■□ 3.02
PRELID1-208	ENST00000511309	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.93	■■■■□ 3.02
PRELID1-208	ENST00000511309	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.91	■■■■□ 3.02
PRELID1-208	ENST00000511309	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PRELID1-208	ENST00000511309	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PRELID1-208	ENST00000511309	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PRELID1-208	ENST00000511309	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.87	■■■■□ 3.01
PRELID1-208	ENST00000511309	ADGRL2	O95490	1459 aa		33.87	■■■■□ 3.01
PRELID1-208	ENST00000511309	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.86	■■■■□ 3.01
PRELID1-208	ENST00000511309	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
PRELID1-208	ENST00000511309	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.82	■■■■□ 3.01
PRELID1-208	ENST00000511309	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.82	■■■■□ 3
PRELID1-208	ENST00000511309	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.79	■■■■□ 3
PRELID1-208	ENST00000511309	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.79	■■■■□ 3
PRELID1-208	ENST00000511309	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.78	■■■■□ 3
PRELID1-208	ENST00000511309	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.76	■■■■□ 3
PRELID1-208	ENST00000511309	PKD2	Q13563	968 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PRELID1-208	ENST00000511309	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PRELID1-208	ENST00000511309	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PRELID1-208	ENST00000511309	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.7	■■■□□ 2.99
PRELID1-208	ENST00000511309	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
PRELID1-208	ENST00000511309	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.7	■■■□□ 2.98
PRELID1-208	ENST00000511309	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PRELID1-208	ENST00000511309	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PRELID1-208	ENST00000511309	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PRELID1-208	ENST00000511309	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PRELID1-208	ENST00000511309	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PRELID1-208	ENST00000511309	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.63	■■■□□ 2.97
PRELID1-208	ENST00000511309	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PRELID1-208	ENST00000511309	CEP152	O94986	1710 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PRELID1-208	ENST00000511309	TNR	Q92752	1358 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PRELID1-208	ENST00000511309	PZP	P20742	1482 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PRELID1-208	ENST00000511309	ABCC3	O15438	1527 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PRELID1-208	ENST00000511309	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
PRELID1-208	ENST00000511309	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
PRELID1-208	ENST00000511309	KANK1	Q14678	1352 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PRELID1-208	ENST00000511309	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PRELID1-208	ENST00000511309	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.96
PRELID1-208	ENST00000511309	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PRELID1-208	ENST00000511309	NAIP	Q13075	1403 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PRELID1-208	ENST00000511309	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PRELID1-208	ENST00000511309	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PRELID1-208	ENST00000511309	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PRELID1-208	ENST00000511309	UNC13B	O14795	1591 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PRELID1-208	ENST00000511309	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PRELID1-208	ENST00000511309	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
PRELID1-208	ENST00000511309	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PRELID1-208	ENST00000511309	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PRELID1-208	ENST00000511309	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PRELID1-208	ENST00000511309	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
PRELID1-208	ENST00000511309	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PRELID1-208	ENST00000511309	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PRELID1-208	ENST00000511309	NUP155	O75694	1391 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PRELID1-208	ENST00000511309	CPS1	P31327	1500 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PRELID1-208	ENST00000511309	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PRELID1-208	ENST00000511309	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PRELID1-208	ENST00000511309	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PRELID1-208	ENST00000511309	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PRELID1-208	ENST00000511309	TET3	O43151	1660 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PRELID1-208	ENST00000511309	MED14	O60244	1454 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PRELID1-208	ENST00000511309	SOCS7	O14512	581 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PRELID1-208	ENST00000511309	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
PRELID1-208	ENST00000511309	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PRELID1-208	ENST00000511309	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PRELID1-208	ENST00000511309	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
PRELID1-208	ENST00000511309	TOM1	O60784	492 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PRELID1-208	ENST00000511309		E9PCH4	1651 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PRELID1-208	ENST00000511309	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PRELID1-208	ENST00000511309	PIP4K2B	P78356	416 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PRELID1-208	ENST00000511309	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
PRELID1-208	ENST00000511309	HSPA1L	P34931	641 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PRELID1-208	ENST00000511309	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PRELID1-208	ENST00000511309	SYNM	O15061	1565 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PRELID1-208	ENST00000511309	NOS1	P29475	1434 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PRELID1-208	ENST00000511309	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PRELID1-208	ENST00000511309	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PRELID1-208	ENST00000511309	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
PRELID1-208	ENST00000511309	PIK3C2B	O00750	1634 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PRELID1-208	ENST00000511309	ALK	Q9UM73	1620 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PRELID1-208	ENST00000511309	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
PRELID1-208	ENST00000511309	IDI1	Q13907	227 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PRELID1-208	ENST00000511309	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PRELID1-208	ENST00000511309	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PRELID1-208	ENST00000511309	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PRELID1-208	ENST00000511309	SLIT1	O75093	1534 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PRELID1-208	ENST00000511309	LTK	P29376	864 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PRELID1-208	ENST00000511309	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PRELID1-208	ENST00000511309	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		33.04	■■■□□ 2.88

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