RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-215ENST00000510074 TNRQ92752 1358 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-215ENST00000510074 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-215ENST00000510074 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-215ENST00000510074 MBD5Q9P267 1494 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-215ENST00000510074 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-215ENST00000510074 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-215ENST00000510074 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-215ENST00000510074 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-215ENST00000510074 CPS1P31327 1500 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-215ENST00000510074 TSPY4P0CV99 314 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-215ENST00000510074 TSPY10P0CW01 314 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-215ENST00000510074 TIAM1Q13009 1591 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-215ENST00000510074 CEP162Q5TB80 1403 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-215ENST00000510074 PZPP20742 1482 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-215ENST00000510074 MIA2Q96PC5 1412 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-215ENST00000510074 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-215ENST00000510074 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-215ENST00000510074 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-215ENST00000510074 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2-215ENST00000510074 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2-215ENST00000510074 NLRP1Q9C000 1473 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2-215ENST00000510074 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SH3BP2-215ENST00000510074 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP2-215ENST00000510074 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-215ENST00000510074 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2-215ENST00000510074 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2-215ENST00000510074 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP2-215ENST00000510074 NCOA2Q15596 1464 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP2-215ENST00000510074 MED14O60244 1454 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-215ENST00000510074 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP2-215ENST00000510074 DEPDC5O75140 1603 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-215ENST00000510074 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-215ENST00000510074 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-215ENST00000510074 IQGAP1P46940 1657 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-215ENST00000510074 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-215ENST00000510074 ABCC3O15438 1527 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-215ENST00000510074 EID1Q9Y6B2 187 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-215ENST00000510074 ALKQ9UM73 1620 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2-215ENST00000510074 ERVK-7P63135 1459 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2-215ENST00000510074 LTKP29376 864 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP2-215ENST00000510074 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2-215ENST00000510074 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2-215ENST00000510074 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SH3BP2-215ENST00000510074 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-215ENST00000510074 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.64e-9■□□□□ 9.6
SH3BP2-215ENST00000510074 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-215ENST00000510074 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-215ENST00000510074 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-215ENST00000510074 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-215ENST00000510074 SYNMO15061 1565 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-215ENST00000510074 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-215ENST00000510074 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-215ENST00000510074 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SH3BP2-215ENST00000510074 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP2-215ENST00000510074 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SH3BP2-215ENST00000510074 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP2-215ENST00000510074 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP2-215ENST00000510074 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP2-215ENST00000510074 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BP2-215ENST00000510074 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BP2-215ENST00000510074 SLIT1O75093 1534 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-215ENST00000510074 KIF15Q9NS87 1388 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-215ENST00000510074 CEP152O94986 1710 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-215ENST00000510074 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-215ENST00000510074 KANK1Q14678 1352 aa24.95■■□□□ 1.59
SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.95■■□□□ 1.59
SH3BP2-215ENST00000510074 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-215ENST00000510074 KCNA6P17658 529 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-215ENST00000510074 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-215ENST00000510074 BCANQ96GW7 911 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-215ENST00000510074 IDI1Q13907 227 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM94Q12767 1356 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-215ENST00000510074 ERBINQ96RT1 1412 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-215ENST00000510074 APLP2Q06481 763 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-215ENST00000510074 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-215ENST00000510074 ABCC5O15440 1437 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-215ENST00000510074 MAP3K1Q13233 1512 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-215ENST00000510074 POTEAQ6S8J7 498 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-215ENST00000510074 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-215ENST00000510074 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-215ENST00000510074 PIK3C2BO00750 1634 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-215ENST00000510074 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-215ENST00000510074 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-215ENST00000510074 SLAIN2Q9P270 581 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-215ENST00000510074 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-215ENST00000510074 MSH6P52701 1360 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-215ENST00000510074 DAPK1P53355 1430 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-215ENST00000510074 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-215ENST00000510074 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-215ENST00000510074 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-215ENST00000510074 TET3O43151 1660 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-215ENST00000510074 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2-215ENST00000510074 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-215ENST00000510074 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-215ENST00000510074 C14orf37Q86TY3 774 aa24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms