RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502470.5

MIB2-215, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 5

Gene MIB2, Length 780 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-215	ENST00000502470	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
MIB2-215	ENST00000502470	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		42.25	■■■■■ 4.35
MIB2-215	ENST00000502470	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	42.25	■■■■■ 4.35
MIB2-215	ENST00000502470	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	42.25	■■■■■ 4.35
MIB2-215	ENST00000502470	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.23	■■■■■ 4.35
MIB2-215	ENST00000502470	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.22	■■■■■ 4.35
MIB2-215	ENST00000502470	DAPK1	P53355	1430 aa		42.21	■■■■■ 4.35
MIB2-215	ENST00000502470	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		42.19	■■■■■ 4.34
MIB2-215	ENST00000502470	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		42.18	■■■■■ 4.34
MIB2-215	ENST00000502470	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	42.15	■■■■■ 4.34
MIB2-215	ENST00000502470	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.14	■■■■■ 4.34
MIB2-215	ENST00000502470	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		42.14	■■■■■ 4.34
MIB2-215	ENST00000502470	PZP	P20742	1482 aa		42.12	■■■■■ 4.33
MIB2-215	ENST00000502470	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	42.12	■■■■■ 4.33
MIB2-215	ENST00000502470	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.12	■■■■■ 4.33
MIB2-215	ENST00000502470	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.12	■■■■■ 4.33
MIB2-215	ENST00000502470	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		42.09	■■■■■ 4.33
MIB2-215	ENST00000502470	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	42.08	■■■■■ 4.33
MIB2-215	ENST00000502470	ABCC3	O15438	1527 aa		42.08	■■■■■ 4.33
MIB2-215	ENST00000502470	CEP152	O94986	1710 aa		42.08	■■■■■ 4.33
MIB2-215	ENST00000502470	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.07	■■■■■ 4.33
MIB2-215	ENST00000502470	PTPRT	O14522	1441 aa		42.03	■■■■■ 4.32
MIB2-215	ENST00000502470	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.03	■■■■■ 4.32
MIB2-215	ENST00000502470	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.02	■■■■■ 4.32
MIB2-215	ENST00000502470	TNR	Q92752	1358 aa		42.01	■■■■■ 4.32
MIB2-215	ENST00000502470	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		42	■■■■■ 4.31
MIB2-215	ENST00000502470	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	41.99	■■■■■ 4.31
MIB2-215	ENST00000502470	FBXO41	Q8TF61	875 aa		41.99	■■■■■ 4.31
MIB2-215	ENST00000502470	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
MIB2-215	ENST00000502470	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	41.96	■■■■■ 4.31
MIB2-215	ENST00000502470	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		41.96	■■■■■ 4.31
MIB2-215	ENST00000502470	DEPDC5	O75140	1603 aa		41.95	■■■■■ 4.31
MIB2-215	ENST00000502470	PLA2R1	Q13018	1463 aa		41.95	■■■■■ 4.31
MIB2-215	ENST00000502470	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		41.93	■■■■■ 4.3
MIB2-215	ENST00000502470	ADGRL2	O95490	1459 aa		41.91	■■■■■ 4.3
MIB2-215	ENST00000502470	CERK	Q8TCT0	537 aa		41.9	■■■■■ 4.3
MIB2-215	ENST00000502470	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		41.88	■■■■■ 4.3
MIB2-215	ENST00000502470	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	41.86	■■■■■ 4.29
MIB2-215	ENST00000502470	ERVK-7	P63135	1459 aa		41.84	■■■■■ 4.29
MIB2-215	ENST00000502470	NLRP1	Q9C000	1473 aa		41.84	■■■■■ 4.29
MIB2-215	ENST00000502470	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	41.83	■■■■■ 4.29
MIB2-215	ENST00000502470	PKD2	Q13563	968 aa		41.82	■■■■■ 4.29
MIB2-215	ENST00000502470	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	41.82	■■■■■ 4.29
MIB2-215	ENST00000502470	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		41.77	■■■■■ 4.28
MIB2-215	ENST00000502470	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		41.77	■■■■■ 4.28
MIB2-215	ENST00000502470	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		41.75	■■■■■ 4.27
MIB2-215	ENST00000502470	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		41.74	■■■■■ 4.27
MIB2-215	ENST00000502470	KANK1	Q14678	1352 aa		41.74	■■■■■ 4.27
MIB2-215	ENST00000502470	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		41.71	■■■■■ 4.27
MIB2-215	ENST00000502470	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	41.7	■■■■■ 4.27	3e-6	■■■■□ 23.3
MIB2-215	ENST00000502470	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		41.69	■■■■■ 4.27
MIB2-215	ENST00000502470	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		41.69	■■■■■ 4.26
MIB2-215	ENST00000502470	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	41.68	■■■■■ 4.26
MIB2-215	ENST00000502470	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		41.66	■■■■■ 4.26
MIB2-215	ENST00000502470	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	41.62	■■■■■ 4.25
MIB2-215	ENST00000502470	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		41.59	■■■■■ 4.25
MIB2-215	ENST00000502470	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		41.58	■■■■■ 4.25
MIB2-215	ENST00000502470	ROCK1	Q13464	1354 aa		41.58	■■■■■ 4.25
MIB2-215	ENST00000502470	ITGAE	P38570	1179 aa		41.55	■■■■■ 4.24
MIB2-215	ENST00000502470	UNC13B	O14795	1591 aa		41.54	■■■■■ 4.24
MIB2-215	ENST00000502470	PIK3C2B	O00750	1634 aa		41.54	■■■■■ 4.24
MIB2-215	ENST00000502470	MED14	O60244	1454 aa		41.51	■■■■■ 4.24
MIB2-215	ENST00000502470	SYNM	O15061	1565 aa		41.5	■■■■■ 4.23
MIB2-215	ENST00000502470	IQGAP1	P46940	1657 aa		41.49	■■■■■ 4.23
MIB2-215	ENST00000502470	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		41.49	■■■■■ 4.23
MIB2-215	ENST00000502470	TET3	O43151	1660 aa		41.49	■■■■■ 4.23
MIB2-215	ENST00000502470	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	41.48	■■■■■ 4.23
MIB2-215	ENST00000502470	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		41.45	■■■■■ 4.23
MIB2-215	ENST00000502470	NOS1	P29475	1434 aa		41.44	■■■■■ 4.23
MIB2-215	ENST00000502470	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	41.44	■■■■■ 4.23
MIB2-215	ENST00000502470	SLIT1	O75093	1534 aa		41.41	■■■■■ 4.22
MIB2-215	ENST00000502470	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	41.41	■■■■■ 4.22
MIB2-215	ENST00000502470	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		41.41	■■■■■ 4.22
MIB2-215	ENST00000502470	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	41.39	■■■■■ 4.22
MIB2-215	ENST00000502470	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		41.37	■■■■■ 4.21
MIB2-215	ENST00000502470	IDI1	Q13907	227 aa		41.37	■■■■■ 4.21
MIB2-215	ENST00000502470	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	41.36	■■■■■ 4.21
MIB2-215	ENST00000502470		E9PCH4	1651 aa		41.35	■■■■■ 4.21
MIB2-215	ENST00000502470	LTK	P29376	864 aa		41.32	■■■■■ 4.21
MIB2-215	ENST00000502470	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		41.31	■■■■■ 4.2
MIB2-215	ENST00000502470	CPS1	P31327	1500 aa		41.3	■■■■■ 4.2
MIB2-215	ENST00000502470	ADGRB3	O60242	1522 aa		41.29	■■■■■ 4.2
MIB2-215	ENST00000502470	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		41.29	■■■■■ 4.2
MIB2-215	ENST00000502470	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		41.29	■■■■■ 4.2
MIB2-215	ENST00000502470	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		41.28	■■■■■ 4.2
MIB2-215	ENST00000502470	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		41.28	■■■■■ 4.2
MIB2-215	ENST00000502470	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		41.24	■■■■■ 4.19
MIB2-215	ENST00000502470	NUP155	O75694	1391 aa		41.24	■■■■■ 4.19
MIB2-215	ENST00000502470	EID1	Q9Y6B2	187 aa		41.22	■■■■■ 4.19
MIB2-215	ENST00000502470	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		41.16	■■■■■ 4.18
MIB2-215	ENST00000502470	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		41.15	■■■■■ 4.18
MIB2-215	ENST00000502470	NAIP	Q13075	1403 aa		41.14	■■■■■ 4.18
MIB2-215	ENST00000502470	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		41.05	■■■■■ 4.16
MIB2-215	ENST00000502470	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		41.05	■■■■■ 4.16
MIB2-215	ENST00000502470	ZFYVE9	O95405	1425 aa		41.03	■■■■■ 4.16
MIB2-215	ENST00000502470	HFM1	A2PYH4	1435 aa		41	■■■■■ 4.15
MIB2-215	ENST00000502470	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	40.99	■■■■■ 4.15
MIB2-215	ENST00000502470	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	40.99	■■■■■ 4.15
MIB2-215	ENST00000502470	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		40.98	■■■■■ 4.15
MIB2-215	ENST00000502470	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		40.95	■■■■■ 4.15

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms