RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.02■■□□□ 1.76
KCNQ1-205ENST00000496887 KIF15Q9NS87 1388 aa26.02■■□□□ 1.76
KCNQ1-205ENST00000496887 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
KCNQ1-205ENST00000496887 HSPA2P54652 639 aa25.99■■□□□ 1.75
KCNQ1-205ENST00000496887 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.98■■□□□ 1.75
KCNQ1-205ENST00000496887 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.97■■□□□ 1.75
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.97■■□□□ 1.75
KCNQ1-205ENST00000496887 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.97■■□□□ 1.75
KCNQ1-205ENST00000496887 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.96■■□□□ 1.75
KCNQ1-205ENST00000496887 NPATQ14207 1427 aa25.96■■□□□ 1.75
KCNQ1-205ENST00000496887 NCOA1Q15788 1441 aa25.95■■□□□ 1.74
KCNQ1-205ENST00000496887 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.94■■□□□ 1.74
KCNQ1-205ENST00000496887 ERBINQ96RT1 1412 aa25.94■■□□□ 1.74
KCNQ1-205ENST00000496887 ADGRL2O95490 1459 aa25.93■■□□□ 1.74
KCNQ1-205ENST00000496887 PTPRKQ15262 1439 aa25.93■■□□□ 1.74
KCNQ1-205ENST00000496887 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
KCNQ1-205ENST00000496887 CEP152O94986 1710 aa25.89■■□□□ 1.74
KCNQ1-205ENST00000496887 ABCC3O15438 1527 aa25.88■■□□□ 1.73
KCNQ1-205ENST00000496887 DEPDC5O75140 1603 aa25.87■■□□□ 1.73
KCNQ1-205ENST00000496887 PZPP20742 1482 aa25.86■■□□□ 1.73
KCNQ1-205ENST00000496887 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
KCNQ1-205ENST00000496887 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.86■■□□□ 1.73
KCNQ1-205ENST00000496887 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
KCNQ1-205ENST00000496887 ITGAEP38570 1179 aa25.84■■□□□ 1.73
KCNQ1-205ENST00000496887 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
KCNQ1-205ENST00000496887 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.83■■□□□ 1.73
KCNQ1-205ENST00000496887 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.83■■□□□ 1.73
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
KCNQ1-205ENST00000496887 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
KCNQ1-205ENST00000496887 STRCQ7RTU9 1775 aa25.81■■□□□ 1.72
KCNQ1-205ENST00000496887 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
KCNQ1-205ENST00000496887 ROCK1Q13464 1354 aa25.79■■□□□ 1.72
KCNQ1-205ENST00000496887 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.79■■□□□ 1.72
KCNQ1-205ENST00000496887 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
KCNQ1-205ENST00000496887 TNRQ92752 1358 aa25.78■■□□□ 1.72
KCNQ1-205ENST00000496887 KANK1Q14678 1352 aa25.77■■□□□ 1.72
KCNQ1-205ENST00000496887 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.74■■□□□ 1.71
KCNQ1-205ENST00000496887 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.73■■□□□ 1.71
KCNQ1-205ENST00000496887 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.72■■□□□ 1.71
KCNQ1-205ENST00000496887 ERVK-7P63135 1459 aa25.71■■□□□ 1.71
KCNQ1-205ENST00000496887 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.7■■□□□ 1.7
KCNQ1-205ENST00000496887 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.7■■□□□ 1.7
KCNQ1-205ENST00000496887 NLRP1Q9C000 1473 aa25.67■■□□□ 1.7
KCNQ1-205ENST00000496887 UNC13BO14795 1591 aa25.67■■□□□ 1.7
KCNQ1-205ENST00000496887 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.66■■□□□ 1.7
KCNQ1-205ENST00000496887 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.63■■□□□ 1.69
KCNQ1-205ENST00000496887 PLA2R1Q13018 1463 aa25.63■■□□□ 1.69
KCNQ1-205ENST00000496887 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.63■■□□□ 1.69
KCNQ1-205ENST00000496887 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.61■■□□□ 1.69
KCNQ1-205ENST00000496887 PTPRTO14522 1441 aa25.61■■□□□ 1.69
KCNQ1-205ENST00000496887 TET3O43151 1660 aa25.6■■□□□ 1.69
KCNQ1-205ENST00000496887 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.58■■□□□ 1.69
KCNQ1-205ENST00000496887 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
KCNQ1-205ENST00000496887 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
KCNQ1-205ENST00000496887 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.57■■□□□ 1.68
KCNQ1-205ENST00000496887 PKD2Q13563 968 aa25.57■■□□□ 1.68
KCNQ1-205ENST00000496887 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.56■■□□□ 1.68
KCNQ1-205ENST00000496887 NAIPQ13075 1403 aa25.55■■□□□ 1.68
KCNQ1-205ENST00000496887 SYNMO15061 1565 aa25.54■■□□□ 1.68
KCNQ1-205ENST00000496887 NUP155O75694 1391 aa25.54■■□□□ 1.68
KCNQ1-205ENST00000496887 PIK3C2BO00750 1634 aa25.53■■□□□ 1.68
KCNQ1-205ENST00000496887 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
KCNQ1-205ENST00000496887 NOS1P29475 1434 aa25.52■■□□□ 1.68
KCNQ1-205ENST00000496887 E9PCH4 1651 aa25.52■■□□□ 1.68
KCNQ1-205ENST00000496887 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.49■■□□□ 1.67
KCNQ1-205ENST00000496887 HFM1A2PYH4 1435 aa25.49■■□□□ 1.67
KCNQ1-205ENST00000496887 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.48■■□□□ 1.67
KCNQ1-205ENST00000496887 IDI1Q13907 227 aa25.47■■□□□ 1.67
KCNQ1-205ENST00000496887 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
KCNQ1-205ENST00000496887 CERKQ8TCT0 537 aa25.43■■□□□ 1.66
KCNQ1-205ENST00000496887 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.43■■□□□ 1.66
KCNQ1-205ENST00000496887 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.42■■□□□ 1.66
KCNQ1-205ENST00000496887 SLIT1O75093 1534 aa25.41■■□□□ 1.66
KCNQ1-205ENST00000496887 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.41■■□□□ 1.66
KCNQ1-205ENST00000496887 MED14O60244 1454 aa25.4■■□□□ 1.66
KCNQ1-205ENST00000496887 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.4■■□□□ 1.66
KCNQ1-205ENST00000496887 ADGRB3O60242 1522 aa25.4■■□□□ 1.66
KCNQ1-205ENST00000496887 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
KCNQ1-205ENST00000496887 IQGAP1P46940 1657 aa25.39■■□□□ 1.65
KCNQ1-205ENST00000496887 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.38■■□□□ 1.65
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
KCNQ1-205ENST00000496887 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.36■■□□□ 1.65
KCNQ1-205ENST00000496887 LTKP29376 864 aa25.36■■□□□ 1.65
KCNQ1-205ENST00000496887 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.36■■□□□ 1.65
KCNQ1-205ENST00000496887 TRIM52Q96A61 297 aa25.36■■□□□ 1.65
KCNQ1-205ENST00000496887 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.35■■□□□ 1.65
KCNQ1-205ENST00000496887 FBXO41Q8TF61 875 aa25.34■■□□□ 1.65
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.34■■□□□ 1.65
KCNQ1-205ENST00000496887 EID1Q9Y6B2 187 aa25.33■■□□□ 1.65
KCNQ1-205ENST00000496887 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
KCNQ1-205ENST00000496887 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.24■■□□□ 1.63
KCNQ1-205ENST00000496887 ZFYVE9O95405 1425 aa25.23■■□□□ 1.63
KCNQ1-205ENST00000496887 CLTCL1P53675 1640 aa25.23■■□□□ 1.63
KCNQ1-205ENST00000496887 TRPM2O94759 1503 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNQ1-205ENST00000496887 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNQ1-205ENST00000496887 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNQ1-205ENST00000496887 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms