RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDSP1-211ENST00000492545 DAPK1P53355 1430 aa36.67■■■■□ 3.46
CTDSP1-211ENST00000492545 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.66■■■■□ 3.46
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF15Q9NS87 1388 aa36.64■■■■□ 3.46
CTDSP1-211ENST00000492545 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
CTDSP1-211ENST00000492545 PZPP20742 1482 aa36.62■■■■□ 3.45
CTDSP1-211ENST00000492545 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.61■■■■□ 3.45
CTDSP1-211ENST00000492545 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
CTDSP1-211ENST00000492545 STRCQ7RTU9 1775 aa36.6■■■■□ 3.45
CTDSP1-211ENST00000492545 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPRTO14522 1441 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDSP1-211ENST00000492545 NCOA1Q15788 1441 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.57■■■■□ 3.45
CTDSP1-211ENST00000492545 FBXO41Q8TF61 875 aa36.57■■■■□ 3.44
CTDSP1-211ENST00000492545 ERBINQ96RT1 1412 aa36.57■■■■□ 3.44
CTDSP1-211ENST00000492545 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.57■■■■□ 3.44
CTDSP1-211ENST00000492545 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
CTDSP1-211ENST00000492545 TNRQ92752 1358 aa36.55■■■■□ 3.44
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
CTDSP1-211ENST00000492545 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.54■■■■□ 3.44
CTDSP1-211ENST00000492545 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
CTDSP1-211ENST00000492545 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.52■■■■□ 3.44
CTDSP1-211ENST00000492545 PKD2Q13563 968 aa36.51■■■■□ 3.44
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.43
CTDSP1-211ENST00000492545 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.5■■■■□ 3.43
CTDSP1-211ENST00000492545 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.5■■■■□ 3.43
CTDSP1-211ENST00000492545 PLA2R1Q13018 1463 aa36.5■■■■□ 3.43
CTDSP1-211ENST00000492545 ABCC3O15438 1527 aa36.49■■■■□ 3.43
CTDSP1-211ENST00000492545 CERKQ8TCT0 537 aa36.48■■■■□ 3.43
CTDSP1-211ENST00000492545 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
CTDSP1-211ENST00000492545 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.44■■■■□ 3.42
CTDSP1-211ENST00000492545 ADGRL2O95490 1459 aa36.43■■■■□ 3.42
CTDSP1-211ENST00000492545 NLRP1Q9C000 1473 aa36.43■■■■□ 3.42
CTDSP1-211ENST00000492545 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.41■■■■□ 3.42
CTDSP1-211ENST00000492545 KANK1Q14678 1352 aa36.4■■■■□ 3.42
CTDSP1-211ENST00000492545 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
CTDSP1-211ENST00000492545 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
CTDSP1-211ENST00000492545 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.36■■■■□ 3.41
CTDSP1-211ENST00000492545 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.36■■■■□ 3.41
CTDSP1-211ENST00000492545 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.33■■■■□ 3.41
CTDSP1-211ENST00000492545 ERVK-7P63135 1459 aa36.32■■■■□ 3.41
CTDSP1-211ENST00000492545 DEPDC5O75140 1603 aa36.31■■■■□ 3.4
CTDSP1-211ENST00000492545 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.3■■■■□ 3.42e-6■■■■■ 33
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.28■■■■□ 3.4
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.28■■■■□ 3.4
CTDSP1-211ENST00000492545 CEP152O94986 1710 aa36.26■■■■□ 3.4
CTDSP1-211ENST00000492545 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.26■■■■□ 3.39
CTDSP1-211ENST00000492545 ROCK1Q13464 1354 aa36.25■■■■□ 3.39
CTDSP1-211ENST00000492545 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
CTDSP1-211ENST00000492545 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.24■■■■□ 3.39
CTDSP1-211ENST00000492545 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.2■■■■□ 3.39
CTDSP1-211ENST00000492545 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.19■■■■□ 3.38
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
CTDSP1-211ENST00000492545 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.13■■■■□ 3.37
CTDSP1-211ENST00000492545 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
CTDSP1-211ENST00000492545 MED14O60244 1454 aa36.1■■■■□ 3.37
CTDSP1-211ENST00000492545 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
CTDSP1-211ENST00000492545 ITGAEP38570 1179 aa36.09■■■■□ 3.37
CTDSP1-211ENST00000492545 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.07■■■■□ 3.37
CTDSP1-211ENST00000492545 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.06■■■■□ 3.36
CTDSP1-211ENST00000492545 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
CTDSP1-211ENST00000492545 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
CTDSP1-211ENST00000492545 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.04■■■■□ 3.36
CTDSP1-211ENST00000492545 NOS1P29475 1434 aa36.03■■■■□ 3.36
CTDSP1-211ENST00000492545 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.03■■■■□ 3.36
CTDSP1-211ENST00000492545 IDI1Q13907 227 aa36.02■■■■□ 3.36
CTDSP1-211ENST00000492545 UBR1Q8IWV7 1749 aa36■■■■□ 3.35
CTDSP1-211ENST00000492545 EID1Q9Y6B2 187 aa35.99■■■■□ 3.35
CTDSP1-211ENST00000492545 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.98■■■■□ 3.35
CTDSP1-211ENST00000492545 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.97■■■■□ 3.35
CTDSP1-211ENST00000492545 SLIT1O75093 1534 aa35.97■■■■□ 3.35
CTDSP1-211ENST00000492545 UNC13BO14795 1591 aa35.97■■■■□ 3.35
CTDSP1-211ENST00000492545 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.93■■■■□ 3.34
CTDSP1-211ENST00000492545 TET3O43151 1660 aa35.93■■■■□ 3.34
CTDSP1-211ENST00000492545 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
CTDSP1-211ENST00000492545 LTKP29376 864 aa35.92■■■■□ 3.34
CTDSP1-211ENST00000492545 CPS1P31327 1500 aa35.92■■■■□ 3.34
CTDSP1-211ENST00000492545 PIK3C2BO00750 1634 aa35.91■■■■□ 3.34
CTDSP1-211ENST00000492545 NUP155O75694 1391 aa35.9■■■■□ 3.34
CTDSP1-211ENST00000492545 SYNMO15061 1565 aa35.9■■■■□ 3.34
CTDSP1-211ENST00000492545 IQGAP1P46940 1657 aa35.9■■■■□ 3.34
CTDSP1-211ENST00000492545 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.84■■■■□ 3.33
CTDSP1-211ENST00000492545 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.83■■■■□ 3.33
CTDSP1-211ENST00000492545 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.81■■■■□ 3.32
CTDSP1-211ENST00000492545 ADGRB3O60242 1522 aa35.8■■■■□ 3.32
CTDSP1-211ENST00000492545 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
CTDSP1-211ENST00000492545 NAIPQ13075 1403 aa35.75■■■■□ 3.31
CTDSP1-211ENST00000492545 E9PCH4 1651 aa35.72■■■■□ 3.31
CTDSP1-211ENST00000492545 TOM1O60784 492 aa35.72■■■■□ 3.31
CTDSP1-211ENST00000492545 HFM1A2PYH4 1435 aa35.68■■■■□ 3.3
CTDSP1-211ENST00000492545 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.66■■■■□ 3.3
CTDSP1-211ENST00000492545 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
CTDSP1-211ENST00000492545 ZFYVE9O95405 1425 aa35.64■■■■□ 3.3
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.64■■■■□ 3.3
CTDSP1-211ENST00000492545 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDSP1-211ENST00000492545 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
CTDSP1-211ENST00000492545 BCANQ96GW7 911 aa35.61■■■■□ 3.29
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