RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 KIF15Q9NS87 1388 aa18.13■□□□□ 0.49
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NISCH-212ENST00000488380 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-212ENST00000488380 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-212ENST00000488380 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-212ENST00000488380 CHD1O14646 1710 aa18.09■□□□□ 0.49
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NISCH-212ENST00000488380 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.99■□□□□ 0.47
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NISCH-212ENST00000488380 SKAP1Q86WV1 359 aa17.77■□□□□ 0.44
NISCH-212ENST00000488380 TESK2Q96S53 571 aa17.77■□□□□ 0.44
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NISCH-212ENST00000488380 RALBP1Q15311 655 aa17.74■□□□□ 0.43
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NISCH-212ENST00000488380 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
NISCH-212ENST00000488380 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
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NISCH-212ENST00000488380 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
NISCH-212ENST00000488380 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
NISCH-212ENST00000488380 PANK3Q9H999 370 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-212ENST00000488380 PLIN1O60240 522 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-212ENST00000488380 ATP10AO60312 1499 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-212ENST00000488380 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-212ENST00000488380 NLRP13Q86W25 1043 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-212ENST00000488380 LAMC1P11047 1609 aa17.66■□□□□ 0.42
NISCH-212ENST00000488380 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa17.66■□□□□ 0.42
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