RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.86■■□□□ 1.89
SKIV2L-211ENST00000485349 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
SKIV2L-211ENST00000485349 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SKIV2L-211ENST00000485349 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SKIV2L-211ENST00000485349 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.84■■□□□ 1.89
SKIV2L-211ENST00000485349 PZPP20742 1482 aa26.84■■□□□ 1.89
SKIV2L-211ENST00000485349 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SKIV2L-211ENST00000485349 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.82■■□□□ 1.88
SKIV2L-211ENST00000485349 TSPY4P0CV99 314 aa26.81■■□□□ 1.88
SKIV2L-211ENST00000485349 TSPY10P0CW01 314 aa26.81■■□□□ 1.88
SKIV2L-211ENST00000485349 TNRQ92752 1358 aa26.8■■□□□ 1.88
SKIV2L-211ENST00000485349 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.8■■□□□ 1.88
SKIV2L-211ENST00000485349 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SKIV2L-211ENST00000485349 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SKIV2L-211ENST00000485349 PKD2Q13563 968 aa26.78■■□□□ 1.88
SKIV2L-211ENST00000485349 MIA2Q96PC5 1412 aa26.78■■□□□ 1.88
SKIV2L-211ENST00000485349 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SKIV2L-211ENST00000485349 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.77■■□□□ 1.88
SKIV2L-211ENST00000485349 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SKIV2L-211ENST00000485349 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.74■■□□□ 1.87
SKIV2L-211ENST00000485349 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.74■■□□□ 1.87
SKIV2L-211ENST00000485349 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.74■■□□□ 1.87
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCC3O15438 1527 aa26.74■■□□□ 1.87
SKIV2L-211ENST00000485349 CEP152O94986 1710 aa26.7■■□□□ 1.87
SKIV2L-211ENST00000485349 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.69■■□□□ 1.86
SKIV2L-211ENST00000485349 NLRP1Q9C000 1473 aa26.68■■□□□ 1.86
SKIV2L-211ENST00000485349 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.67■■□□□ 1.86
SKIV2L-211ENST00000485349 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.66■■□□□ 1.86
SKIV2L-211ENST00000485349 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.66■■□□□ 1.86
SKIV2L-211ENST00000485349 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.65■■□□□ 1.86
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCC5O15440 1437 aa26.63■■□□□ 1.85
SKIV2L-211ENST00000485349 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
SKIV2L-211ENST00000485349 ERVK-7P63135 1459 aa26.62■■□□□ 1.85
SKIV2L-211ENST00000485349 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SKIV2L-211ENST00000485349 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SKIV2L-211ENST00000485349 KIF15Q9NS87 1388 aa26.6■■□□□ 1.85
SKIV2L-211ENST00000485349 DEPDC5O75140 1603 aa26.6■■□□□ 1.85
SKIV2L-211ENST00000485349 APLP2Q06481 763 aa26.59■■□□□ 1.85
SKIV2L-211ENST00000485349 DAPK1P53355 1430 aa26.58■■□□□ 1.85
SKIV2L-211ENST00000485349 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.58■■□□□ 1.85
SKIV2L-211ENST00000485349 ERBINQ96RT1 1412 aa26.57■■□□□ 1.84
SKIV2L-211ENST00000485349 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SKIV2L-211ENST00000485349 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.55■■□□□ 1.84
SKIV2L-211ENST00000485349 IQGAP1P46940 1657 aa26.55■■□□□ 1.84
SKIV2L-211ENST00000485349 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.55■■□□□ 1.84
SKIV2L-211ENST00000485349 MED14O60244 1454 aa26.55■■□□□ 1.84
SKIV2L-211ENST00000485349 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.54■■□□□ 1.84
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.54■■□□□ 1.84
SKIV2L-211ENST00000485349 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.54■■□□□ 1.84
SKIV2L-211ENST00000485349 CPS1P31327 1500 aa26.54■■□□□ 1.84
SKIV2L-211ENST00000485349 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SKIV2L-211ENST00000485349 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.52■■□□□ 1.84
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.48■■□□□ 1.83
SKIV2L-211ENST00000485349 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.46■■□□□ 1.83
SKIV2L-211ENST00000485349 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.43■■□□□ 1.82
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.43■■□□□ 1.82
SKIV2L-211ENST00000485349 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.822e-8■■■■■ 27.8
SKIV2L-211ENST00000485349 PIK3C2BO00750 1634 aa26.42■■□□□ 1.82
SKIV2L-211ENST00000485349 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.4■■□□□ 1.82
SKIV2L-211ENST00000485349 ILDR2Q71H61 639 aa26.4■■□□□ 1.82
SKIV2L-211ENST00000485349 SLIT1O75093 1534 aa26.39■■□□□ 1.82
SKIV2L-211ENST00000485349 ADGRL2O95490 1459 aa26.39■■□□□ 1.82
SKIV2L-211ENST00000485349 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.39■■□□□ 1.82
SKIV2L-211ENST00000485349 SYNMO15061 1565 aa26.38■■□□□ 1.81
SKIV2L-211ENST00000485349 KANK1Q14678 1352 aa26.38■■□□□ 1.81
SKIV2L-211ENST00000485349 ALKQ9UM73 1620 aa26.37■■□□□ 1.81
SKIV2L-211ENST00000485349 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.35■■□□□ 1.81
SKIV2L-211ENST00000485349 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SKIV2L-211ENST00000485349 PIP4K2BP78356 416 aa26.34■■□□□ 1.81
SKIV2L-211ENST00000485349 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.33■■□□□ 1.81
SKIV2L-211ENST00000485349 TOM1O60784 492 aa26.32■■□□□ 1.8
SKIV2L-211ENST00000485349 LTKP29376 864 aa26.31■■□□□ 1.8
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
SKIV2L-211ENST00000485349 HSPA1LP34931 641 aa26.28■■□□□ 1.8
SKIV2L-211ENST00000485349 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.28■■□□□ 1.8
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.27■■□□□ 1.8
SKIV2L-211ENST00000485349 NOS1P29475 1434 aa26.26■■□□□ 1.79
SKIV2L-211ENST00000485349 ADGRB3O60242 1522 aa26.25■■□□□ 1.79
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.25■■□□□ 1.79
SKIV2L-211ENST00000485349 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SKIV2L-211ENST00000485349 IDI1Q13907 227 aa26.23■■□□□ 1.79
SKIV2L-211ENST00000485349 EID1Q9Y6B2 187 aa26.23■■□□□ 1.79
SKIV2L-211ENST00000485349 TET3O43151 1660 aa26.22■■□□□ 1.79
SKIV2L-211ENST00000485349 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SKIV2L-211ENST00000485349 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.22■■□□□ 1.79
SKIV2L-211ENST00000485349 UNC13BO14795 1591 aa26.2■■□□□ 1.79
SKIV2L-211ENST00000485349 SOCS7O14512 581 aa26.2■■□□□ 1.78
SKIV2L-211ENST00000485349 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.19■■□□□ 1.78
SKIV2L-211ENST00000485349 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
SKIV2L-211ENST00000485349 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.18■■□□□ 1.78
SKIV2L-211ENST00000485349 E9PCH4 1651 aa26.12■■□□□ 1.77
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.11■■□□□ 1.77
SKIV2L-211ENST00000485349 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.1■■□□□ 1.77
SKIV2L-211ENST00000485349 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.1■■□□□ 1.77
SKIV2L-211ENST00000485349 ROCK1Q13464 1354 aa26.09■■□□□ 1.77
SKIV2L-211ENST00000485349 NWD1Q149M9 1564 aa26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms