RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1-208ENST00000466278 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
MKL1-208ENST00000466278 ABCC5O15440 1437 aa35.49■■■■□ 3.27
MKL1-208ENST00000466278 STRCQ7RTU9 1775 aa35.48■■■■□ 3.27
MKL1-208ENST00000466278 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.48■■■■□ 3.27
MKL1-208ENST00000466278 DAPK1P53355 1430 aa35.46■■■■□ 3.27
MKL1-208ENST00000466278 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.46■■■■□ 3.27
MKL1-208ENST00000466278 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
MKL1-208ENST00000466278 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
MKL1-208ENST00000466278 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.42■■■■□ 3.26
MKL1-208ENST00000466278 PZPP20742 1482 aa35.41■■■■□ 3.26
MKL1-208ENST00000466278 KIF15Q9NS87 1388 aa35.4■■■■□ 3.26
MKL1-208ENST00000466278 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
MKL1-208ENST00000466278 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
MKL1-208ENST00000466278 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.38■■■■□ 3.25
MKL1-208ENST00000466278 NCOA1Q15788 1441 aa35.37■■■■□ 3.25
MKL1-208ENST00000466278 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.35■■■■□ 3.25
MKL1-208ENST00000466278 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.35■■■■□ 3.25
MKL1-208ENST00000466278 ERBINQ96RT1 1412 aa35.35■■■■□ 3.25
MKL1-208ENST00000466278 ABCC3O15438 1527 aa35.34■■■■□ 3.25
MKL1-208ENST00000466278 PTPRTO14522 1441 aa35.31■■■■□ 3.24
MKL1-208ENST00000466278 TNRQ92752 1358 aa35.3■■■■□ 3.24
MKL1-208ENST00000466278 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.3■■■■□ 3.24
MKL1-208ENST00000466278 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.29■■■■□ 3.24
MKL1-208ENST00000466278 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.29■■■■□ 3.24
MKL1-208ENST00000466278 PLA2R1Q13018 1463 aa35.28■■■■□ 3.24
MKL1-208ENST00000466278 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
MKL1-208ENST00000466278 CEP152O94986 1710 aa35.26■■■■□ 3.24
MKL1-208ENST00000466278 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
MKL1-208ENST00000466278 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
MKL1-208ENST00000466278 ADGRL2O95490 1459 aa35.23■■■■□ 3.23
MKL1-208ENST00000466278 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.23■■■■□ 3.23
MKL1-208ENST00000466278 DEPDC5O75140 1603 aa35.23■■■■□ 3.23
MKL1-208ENST00000466278 FBXO41Q8TF61 875 aa35.22■■■■□ 3.23
MKL1-208ENST00000466278 NLRP1Q9C000 1473 aa35.19■■■■□ 3.22
MKL1-208ENST00000466278 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.18■■■■□ 3.22
MKL1-208ENST00000466278 PKD2Q13563 968 aa35.15■■■■□ 3.22
MKL1-208ENST00000466278 ERVK-7P63135 1459 aa35.15■■■■□ 3.22
MKL1-208ENST00000466278 CERKQ8TCT0 537 aa35.14■■■■□ 3.22
MKL1-208ENST00000466278 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.12■■■■□ 3.21
MKL1-208ENST00000466278 KANK1Q14678 1352 aa35.12■■■■□ 3.21
MKL1-208ENST00000466278 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.1■■■■□ 3.21
MKL1-208ENST00000466278 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.08■■■■□ 3.21
MKL1-208ENST00000466278 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.08■■■■□ 3.216e-6■□□□□ 8.3
MKL1-208ENST00000466278 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
MKL1-208ENST00000466278 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
MKL1-208ENST00000466278 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.06■■■■□ 3.2
MKL1-208ENST00000466278 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.05■■■■□ 3.2
MKL1-208ENST00000466278 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.04■■■■□ 3.2
MKL1-208ENST00000466278 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
MKL1-208ENST00000466278 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.02■■■■□ 3.2
MKL1-208ENST00000466278 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
MKL1-208ENST00000466278 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35■■■■□ 3.19
MKL1-208ENST00000466278 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.98■■■■□ 3.19
MKL1-208ENST00000466278 ROCK1Q13464 1354 aa34.98■■■■□ 3.19
MKL1-208ENST00000466278 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.95■■■■□ 3.19
MKL1-208ENST00000466278 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.93■■■■□ 3.18
MKL1-208ENST00000466278 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.92■■■■□ 3.18
MKL1-208ENST00000466278 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.9■■■■□ 3.18
MKL1-208ENST00000466278 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
MKL1-208ENST00000466278 UNC13BO14795 1591 aa34.89■■■■□ 3.18
MKL1-208ENST00000466278 MED14O60244 1454 aa34.86■■■■□ 3.17
MKL1-208ENST00000466278 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
MKL1-208ENST00000466278 TET3O43151 1660 aa34.85■■■■□ 3.17
MKL1-208ENST00000466278 ITGAEP38570 1179 aa34.84■■■■□ 3.17
MKL1-208ENST00000466278 PIK3C2BO00750 1634 aa34.84■■■■□ 3.17
MKL1-208ENST00000466278 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
MKL1-208ENST00000466278 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
MKL1-208ENST00000466278 SYNMO15061 1565 aa34.82■■■■□ 3.16
MKL1-208ENST00000466278 IQGAP1P46940 1657 aa34.82■■■■□ 3.16
MKL1-208ENST00000466278 NOS1P29475 1434 aa34.81■■■■□ 3.16
MKL1-208ENST00000466278 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
MKL1-208ENST00000466278 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.8■■■■□ 3.16
MKL1-208ENST00000466278 SLIT1O75093 1534 aa34.79■■■■□ 3.16
MKL1-208ENST00000466278 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.78■■■■□ 3.16
MKL1-208ENST00000466278 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.15
MKL1-208ENST00000466278 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.75■■■■□ 3.15
MKL1-208ENST00000466278 CPS1P31327 1500 aa34.72■■■■□ 3.15
MKL1-208ENST00000466278 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.72■■■■□ 3.15
MKL1-208ENST00000466278 ADGRB3O60242 1522 aa34.71■■■■□ 3.15
MKL1-208ENST00000466278 IDI1Q13907 227 aa34.7■■■■□ 3.15
MKL1-208ENST00000466278 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.68■■■■□ 3.14
MKL1-208ENST00000466278 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.68■■■■□ 3.14
MKL1-208ENST00000466278 E9PCH4 1651 aa34.66■■■■□ 3.14
MKL1-208ENST00000466278 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.65■■■■□ 3.14
MKL1-208ENST00000466278 EID1Q9Y6B2 187 aa34.65■■■■□ 3.14
MKL1-208ENST00000466278 NUP155O75694 1391 aa34.64■■■■□ 3.14
MKL1-208ENST00000466278 LTKP29376 864 aa34.64■■■■□ 3.14
MKL1-208ENST00000466278 NAIPQ13075 1403 aa34.55■■■■□ 3.12
MKL1-208ENST00000466278 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.54■■■■□ 3.12
MKL1-208ENST00000466278 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.54■■■■□ 3.12
MKL1-208ENST00000466278 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.53■■■■□ 3.12
MKL1-208ENST00000466278 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.52■■■■□ 3.12
MKL1-208ENST00000466278 HFM1A2PYH4 1435 aa34.49■■■■□ 3.11
MKL1-208ENST00000466278 ZFYVE9O95405 1425 aa34.46■■■■□ 3.11
MKL1-208ENST00000466278 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.45■■■■□ 3.11
MKL1-208ENST00000466278 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.45■■■■□ 3.1
MKL1-208ENST00000466278 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.42■■■■□ 3.1
MKL1-208ENST00000466278 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
MKL1-208ENST00000466278 TOM1O60784 492 aa34.38■■■■□ 3.09
MKL1-208ENST00000466278 HDGFP51858 240 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
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