RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466244.1

RAB17-209, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB17, Length 937 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17-209ENST00000466244 C3P01024 1663 aa23.14■■□□□ 1.29
RAB17-209ENST00000466244 DEPDC5O75140 1603 aa23.14■■□□□ 1.29
RAB17-209ENST00000466244 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.13■■□□□ 1.29
RAB17-209ENST00000466244 KIF3BO15066 747 aa23.13■■□□□ 1.29
RAB17-209ENST00000466244 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
RAB17-209ENST00000466244 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.11■■□□□ 1.29
RAB17-209ENST00000466244 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
RAB17-209ENST00000466244 GGT6Q6P531 493 aa23.1■■□□□ 1.29
RAB17-209ENST00000466244 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.09■■□□□ 1.29
RAB17-209ENST00000466244 ZMYM3Q14202 1370 aa23.09■■□□□ 1.29
RAB17-209ENST00000466244 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RAB17-209ENST00000466244 NPATQ14207 1427 aa23.08■■□□□ 1.29
RAB17-209ENST00000466244 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.07■■□□□ 1.28
RAB17-209ENST00000466244 ABCC3O15438 1527 aa23.07■■□□□ 1.28
RAB17-209ENST00000466244 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.06■■□□□ 1.28
RAB17-209ENST00000466244 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
RAB17-209ENST00000466244 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
RAB17-209ENST00000466244 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.05■■□□□ 1.28
RAB17-209ENST00000466244 PZPP20742 1482 aa23.03■■□□□ 1.28
RAB17-209ENST00000466244 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.03■■□□□ 1.28
RAB17-209ENST00000466244 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
RAB17-209ENST00000466244 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.02■■□□□ 1.28
RAB17-209ENST00000466244 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23■■□□□ 1.27
RAB17-209ENST00000466244 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB17-209ENST00000466244 UNC13BO14795 1591 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB17-209ENST00000466244 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB17-209ENST00000466244 CEP152O94986 1710 aa22.95■■□□□ 1.26
RAB17-209ENST00000466244 HFM1A2PYH4 1435 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB17-209ENST00000466244 NAIPQ13075 1403 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB17-209ENST00000466244 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.93■■□□□ 1.26
RAB17-209ENST00000466244 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.93■■□□□ 1.26
RAB17-209ENST00000466244 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.93■■□□□ 1.26
RAB17-209ENST00000466244 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
RAB17-209ENST00000466244 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.91■■□□□ 1.26
RAB17-209ENST00000466244 ITGAEP38570 1179 aa22.91■■□□□ 1.26
RAB17-209ENST00000466244 KANK1Q14678 1352 aa22.9■■□□□ 1.26
RAB17-209ENST00000466244 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.89■■□□□ 1.26
RAB17-209ENST00000466244 ERVK-7P63135 1459 aa22.88■■□□□ 1.25
RAB17-209ENST00000466244 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.87■■□□□ 1.25
RAB17-209ENST00000466244 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.87■■□□□ 1.25
RAB17-209ENST00000466244 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RAB17-209ENST00000466244 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RAB17-209ENST00000466244 TET3O43151 1660 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB17-209ENST00000466244 TNRQ92752 1358 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB17-209ENST00000466244 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RAB17-209ENST00000466244 NLRP1Q9C000 1473 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB17-209ENST00000466244 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB17-209ENST00000466244 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.241e-13■□□□□ 11.1
RAB17-209ENST00000466244 NOS1P29475 1434 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB17-209ENST00000466244 HSPA2P54652 639 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB17-209ENST00000466244 PLA2R1Q13018 1463 aa22.78■■□□□ 1.24
RAB17-209ENST00000466244 SYNMO15061 1565 aa22.76■■□□□ 1.23
RAB17-209ENST00000466244 STRCQ7RTU9 1775 aa22.76■■□□□ 1.23
RAB17-209ENST00000466244 NUP155O75694 1391 aa22.76■■□□□ 1.23
RAB17-209ENST00000466244 E9PCH4 1651 aa22.74■■□□□ 1.23
RAB17-209ENST00000466244 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
RAB17-209ENST00000466244 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.71■■□□□ 1.23
RAB17-209ENST00000466244 PIK3C2BO00750 1634 aa22.69■■□□□ 1.22
RAB17-209ENST00000466244 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.68■■□□□ 1.22
RAB17-209ENST00000466244 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RAB17-209ENST00000466244 PTPRTO14522 1441 aa22.66■■□□□ 1.22
RAB17-209ENST00000466244 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.66■■□□□ 1.22
RAB17-209ENST00000466244 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
RAB17-209ENST00000466244 SLIT1O75093 1534 aa22.64■■□□□ 1.21
RAB17-209ENST00000466244 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.64■■□□□ 1.21
RAB17-209ENST00000466244 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.64■■□□□ 1.21
RAB17-209ENST00000466244 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RAB17-209ENST00000466244 PKD2Q13563 968 aa22.62■■□□□ 1.21
RAB17-209ENST00000466244 IDI1Q13907 227 aa22.62■■□□□ 1.21
RAB17-209ENST00000466244 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.62■■□□□ 1.21
RAB17-209ENST00000466244 ADGRB3O60242 1522 aa22.61■■□□□ 1.21
RAB17-209ENST00000466244 MED14O60244 1454 aa22.6■■□□□ 1.21
RAB17-209ENST00000466244 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.6■■□□□ 1.21
RAB17-209ENST00000466244 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
RAB17-209ENST00000466244 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.6■■□□□ 1.21
RAB17-209ENST00000466244 HRCP23327 699 aa22.58■■□□□ 1.21
RAB17-209ENST00000466244 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.58■■□□□ 1.21
RAB17-209ENST00000466244 TRPM2O94759 1503 aa22.57■■□□□ 1.2
RAB17-209ENST00000466244 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.57■■□□□ 1.2
RAB17-209ENST00000466244 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.54■■□□□ 1.2
RAB17-209ENST00000466244 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.54■■□□□ 1.2
RAB17-209ENST00000466244 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.52■■□□□ 1.2
RAB17-209ENST00000466244 TRIM52Q96A61 297 aa22.52■■□□□ 1.2
RAB17-209ENST00000466244 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
RAB17-209ENST00000466244 ZFYVE9O95405 1425 aa22.51■■□□□ 1.19
RAB17-209ENST00000466244 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
RAB17-209ENST00000466244 CLTCL1P53675 1640 aa22.49■■□□□ 1.19
RAB17-209ENST00000466244 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.48■■□□□ 1.19
RAB17-209ENST00000466244 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
RAB17-209ENST00000466244 LTKP29376 864 aa22.47■■□□□ 1.19
RAB17-209ENST00000466244 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.47■■□□□ 1.19
RAB17-209ENST00000466244 IQGAP1P46940 1657 aa22.46■■□□□ 1.19
RAB17-209ENST00000466244 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.46■■□□□ 1.19
RAB17-209ENST00000466244 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
RAB17-209ENST00000466244 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.42■■□□□ 1.18
RAB17-209ENST00000466244 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.41■■□□□ 1.18
RAB17-209ENST00000466244 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.4■■□□□ 1.18
RAB17-209ENST00000466244 EID1Q9Y6B2 187 aa22.39■■□□□ 1.17
RAB17-209ENST00000466244 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.37■■□□□ 1.17
RAB17-209ENST00000466244 KIF1BO60333 1816 aa22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms