RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 ATP10AO60312 1499 aa21.6■■□□□ 1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.6■■□□□ 1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.59■■□□□ 1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.59■■□□□ 1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SUCLG2-202ENST00000460567 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.57■■□□□ 1.04
SUCLG2-202ENST00000460567 LAMC1P11047 1609 aa21.57■■□□□ 1.04
SUCLG2-202ENST00000460567 ABCC1P33527 1531 aa21.57■■□□□ 1.04
SUCLG2-202ENST00000460567 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
SUCLG2-202ENST00000460567 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.56■■□□□ 1.04
SUCLG2-202ENST00000460567 FKBP8Q14318 412 aa21.55■■□□□ 1.04
SUCLG2-202ENST00000460567 POTEDQ86YR6 584 aa21.55■■□□□ 1.04
SUCLG2-202ENST00000460567 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SUCLG2-202ENST00000460567 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.53■■□□□ 1.04
SUCLG2-202ENST00000460567 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.53■■□□□ 1.04
SUCLG2-202ENST00000460567 MRS2Q9HD23 443 aa21.51■■□□□ 1.03
SUCLG2-202ENST00000460567 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.5■■□□□ 1.03
SUCLG2-202ENST00000460567 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.5■■□□□ 1.03
SUCLG2-202ENST00000460567 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SUCLG2-202ENST00000460567 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.5■■□□□ 1.03
SUCLG2-202ENST00000460567 STAC3Q96MF2 364 aa21.49■■□□□ 1.03
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SUCLG2-202ENST00000460567 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.48■■□□□ 1.03
SUCLG2-202ENST00000460567 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.48■■□□□ 1.03
SUCLG2-202ENST00000460567 MYT1Q01538 1121 aa21.47■■□□□ 1.03
SUCLG2-202ENST00000460567 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.45■■□□□ 1.03
SUCLG2-202ENST00000460567 PLA2R1Q13018 1463 aa21.44■■□□□ 1.02
SUCLG2-202ENST00000460567 E9PCH4 1651 aa21.42■■□□□ 1.02
SUCLG2-202ENST00000460567 RALBP1Q15311 655 aa21.41■■□□□ 1.02
SUCLG2-202ENST00000460567 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.41■■□□□ 1.02
SUCLG2-202ENST00000460567 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SUCLG2-202ENST00000460567 DEPDC5O75140 1603 aa21.4■■□□□ 1.02
SUCLG2-202ENST00000460567 A2MP01023 1474 aa21.4■■□□□ 1.02
SUCLG2-202ENST00000460567 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SUCLG2-202ENST00000460567 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.39■■□□□ 1.02
SUCLG2-202ENST00000460567 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.39■■□□□ 1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.39■■□□□ 1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.38■■□□□ 1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.37■■□□□ 1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.37■■□□□ 1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.36■■□□□ 1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 TRPM2O94759 1503 aa21.35■■□□□ 1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 KANK1Q14678 1352 aa21.34■■□□□ 1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 TET3O43151 1660 aa21.34■■□□□ 1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 CCDC184Q52MB2 194 aa21.34■■□□□ 1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.33■■□□□ 1.01
SUCLG2-202ENST00000460567 PTPRTO14522 1441 aa21.32■■□□□ 1
SUCLG2-202ENST00000460567 FANCAO15360 1455 aa21.32■■□□□ 1
SUCLG2-202ENST00000460567 ATP7AQ04656 1500 aa21.32■■□□□ 1
SUCLG2-202ENST00000460567 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SUCLG2-202ENST00000460567 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SUCLG2-202ENST00000460567 CEP152O94986 1710 aa21.31■■□□□ 1
SUCLG2-202ENST00000460567 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.3■■□□□ 1
SUCLG2-202ENST00000460567 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SUCLG2-202ENST00000460567 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.3■■□□□ 1
SUCLG2-202ENST00000460567 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.29■■□□□ 1
SUCLG2-202ENST00000460567 INSRP06213 1382 aa21.29■■□□□ 1
SUCLG2-202ENST00000460567 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.29■■□□□ 1
SUCLG2-202ENST00000460567 SLC24A1O60721 1099 aa21.28■■□□□ 1
SUCLG2-202ENST00000460567 BCANQ96GW7 911 aa21.28■■□□□ 1
SUCLG2-202ENST00000460567 TMC1Q8TDI8 760 aa21.27■■□□□ 1
SUCLG2-202ENST00000460567 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.27■■□□□ 1
SUCLG2-202ENST00000460567 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.26■□□□□ 0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 ADGRL1O94910 1474 aa21.25■□□□□ 0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 TMF1P82094 1093 aa21.25■□□□□ 0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 RGL3Q3MIN7 710 aa21.25■□□□□ 0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.25■□□□□ 0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.25■□□□□ 0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 MADDQ8WXG6 1647 aa21.24■□□□□ 0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.23■□□□□ 0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 CDCA8Q53HL2 280 aa21.23■□□□□ 0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 NLRP13Q86W25 1043 aa21.22■□□□□ 0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 ASXL2Q76L83 1435 aa21.22■□□□□ 0.99
SUCLG2-202ENST00000460567 IQGAP1P46940 1657 aa21.2■□□□□ 0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 AFAP1Q8N556 730 aa21.2■□□□□ 0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 NUDCQ9Y266 331 aa21.2■□□□□ 0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 TESK2Q96S53 571 aa21.19■□□□□ 0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.19■□□□□ 0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.19■□□□□ 0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.19■□□□□ 0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.18■□□□□ 0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 CLTCL1P53675 1640 aa21.17■□□□□ 0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 MYOM2P54296 1465 aa21.15■□□□□ 0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 PDE3BQ13370 1112 aa21.14■□□□□ 0.98
SUCLG2-202ENST00000460567 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.14■□□□□ 0.97
SUCLG2-202ENST00000460567 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.13■□□□□ 0.97
SUCLG2-202ENST00000460567 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.13■□□□□ 0.97
SUCLG2-202ENST00000460567 OSCARQ8IYS5 282 aa21.11■□□□□ 0.97
SUCLG2-202ENST00000460567 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.11■□□□□ 0.97
SUCLG2-202ENST00000460567 SYNMO15061 1565 aa21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms