RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 CFAP74Q9C0B2 1584 aa7.24□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa7.23□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 C3P01024 1663 aa7.22□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 NCOA1Q15788 1441 aa7.22□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 PYGBP11216 843 aa7.22□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.22□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 POTEHQ6S545 545 aa7.22□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 FHOD3Q2V2M9 1422 aa7.21□□□□□ -1.25
ECHDC1-211ENST00000460558 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 MAGI2Q86UL8 1455 aa7.21□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa7.21□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 STK24Q9Y6E0 443 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 PIP4K2BP78356 416 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 GOLGA3Q08378 1498 aa7.18□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 TOM1O60784 492 aa7.18□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 HECW1Q76N89 1606 aa7.18□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 NBR1Q14596 966 aa7.17□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.16□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 C9orf84Q5VXU9 1444 aa7.16□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP10AO60312 1499 aa7.16□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP10BO94823 1461 aa7.16□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 CHADLQ6NUI6 762 aa7.15□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa7.15□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 ARID3CA6NKF2 412 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 CPS1P31327 1500 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 PTPRKQ15262 1439 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 PLA2R1Q13018 1463 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 MROH2AA6NES4 1674 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 MFRPQ9BY79 579 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ECHDC1-211ENST00000460558 NPATQ14207 1427 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 ALKQ9UM73 1620 aa7.09□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 REREQ9P2R6 1566 aa7.08□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 POTEAQ6S8J7 498 aa7.08□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.08□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 P3H3Q8IVL6 736 aa7.08□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 SCAPERQ9BY12 1400 aa7.08□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 CNTLNQ9NXG0 1405 aa7.08□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 AGLP35573 1532 aa7.07□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 PSEN1P49768 467 aa7.07□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.06□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa7.06□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 MYO5CQ9NQX4 1742 aa7.06□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.06□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 IFNL1Q8IU54 200 aa7.05□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa7.04□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 KDM5CP41229 1560 aa7.04□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 FBXO22Q8NEZ5 403 aa7.04□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 KIF12Q96FN5 646 aa7.04□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCA6Q8N139 1617 aa7.04□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 PLEKHD1A6NEE1 506 aa7.03□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.03□□□□□ -1.28
ECHDC1-211ENST00000460558 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.02□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 SYNMO15061 1565 aa7.02□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 NEURL4Q96JN8 1562 aa7.02□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 VWDEQ8N2E2 1590 aa7.01□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 SOX12O15370 315 aa7.01□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 MAP3K13O43283 966 aa7.01□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 CHRDL2Q6WN34 429 aa7.01□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.01□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 PLCH2O75038 1416 aa7.01□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 STRCP1A6NGW2 1772 aa7□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 SAMD9Q5K651 1589 aa6.99□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 ZMYM3Q14202 1370 aa6.99□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R37O75864 691 aa6.99□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.99□□□□□ -1.29
ECHDC1-211ENST00000460558 NLRP6P59044 892 aa6.98□□□□□ -1.29
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