RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.78■■■■□ 3.48
HOXB3-202ENST00000460160 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
HOXB3-202ENST00000460160 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
HOXB3-202ENST00000460160 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.75■■■■□ 3.47
HOXB3-202ENST00000460160 KIF15Q9NS87 1388 aa36.72■■■■□ 3.47
HOXB3-202ENST00000460160 STRCQ7RTU9 1775 aa36.72■■■■□ 3.47
HOXB3-202ENST00000460160 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.7■■■■□ 3.47
HOXB3-202ENST00000460160 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.7■■■■□ 3.46
HOXB3-202ENST00000460160 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.68■■■■□ 3.46
HOXB3-202ENST00000460160 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.66■■■■□ 3.46
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
HOXB3-202ENST00000460160 PZPP20742 1482 aa36.65■■■■□ 3.46
HOXB3-202ENST00000460160 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
HOXB3-202ENST00000460160 ERBINQ96RT1 1412 aa36.63■■■■□ 3.45
HOXB3-202ENST00000460160 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.63■■■■□ 3.45
HOXB3-202ENST00000460160 ABCC3O15438 1527 aa36.63■■■■□ 3.45
HOXB3-202ENST00000460160 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
HOXB3-202ENST00000460160 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.6■■■■□ 3.45
HOXB3-202ENST00000460160 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
HOXB3-202ENST00000460160 NCOA1Q15788 1441 aa36.58■■■■□ 3.45
HOXB3-202ENST00000460160 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.56■■■■□ 3.44
HOXB3-202ENST00000460160 ADGRL2O95490 1459 aa36.56■■■■□ 3.44
HOXB3-202ENST00000460160 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
HOXB3-202ENST00000460160 CEP152O94986 1710 aa36.56■■■■□ 3.44
HOXB3-202ENST00000460160 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
HOXB3-202ENST00000460160 TNRQ92752 1358 aa36.54■■■■□ 3.44
HOXB3-202ENST00000460160 DEPDC5O75140 1603 aa36.53■■■■□ 3.44
HOXB3-202ENST00000460160 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
HOXB3-202ENST00000460160 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.52■■■■□ 3.44
HOXB3-202ENST00000460160 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.5■■■■□ 3.43
HOXB3-202ENST00000460160 PTPRTO14522 1441 aa36.47■■■■□ 3.43
HOXB3-202ENST00000460160 PLA2R1Q13018 1463 aa36.45■■■■□ 3.42
HOXB3-202ENST00000460160 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
HOXB3-202ENST00000460160 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.43■■■■□ 3.42
HOXB3-202ENST00000460160 ERVK-7P63135 1459 aa36.4■■■■□ 3.42
HOXB3-202ENST00000460160 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.4■■■■□ 3.42
HOXB3-202ENST00000460160 NLRP1Q9C000 1473 aa36.4■■■■□ 3.42
HOXB3-202ENST00000460160 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.38■■■■□ 3.41
HOXB3-202ENST00000460160 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.38■■■■□ 3.41
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.36■■■■□ 3.41
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.36■■■■□ 3.41
HOXB3-202ENST00000460160 KANK1Q14678 1352 aa36.36■■■■□ 3.41
HOXB3-202ENST00000460160 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.35■■■■□ 3.414e-7■■■■■ 39.7
HOXB3-202ENST00000460160 PKD2Q13563 968 aa36.34■■■■□ 3.41
HOXB3-202ENST00000460160 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.33■■■■□ 3.41
HOXB3-202ENST00000460160 ROCK1Q13464 1354 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXB3-202ENST00000460160 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-202ENST00000460160 FBXO41Q8TF61 875 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-202ENST00000460160 CERKQ8TCT0 537 aa36.29■■■■□ 3.4
HOXB3-202ENST00000460160 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
HOXB3-202ENST00000460160 ITGAEP38570 1179 aa36.24■■■■□ 3.39
HOXB3-202ENST00000460160 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
HOXB3-202ENST00000460160 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
HOXB3-202ENST00000460160 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.22■■■■□ 3.39
HOXB3-202ENST00000460160 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.22■■■■□ 3.39
HOXB3-202ENST00000460160 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.2■■■■□ 3.39
HOXB3-202ENST00000460160 UNC13BO14795 1591 aa36.2■■■■□ 3.38
HOXB3-202ENST00000460160 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.19■■■■□ 3.38
HOXB3-202ENST00000460160 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.13■■■■□ 3.38
HOXB3-202ENST00000460160 TET3O43151 1660 aa36.13■■■■□ 3.37
HOXB3-202ENST00000460160 SYNMO15061 1565 aa36.11■■■■□ 3.37
HOXB3-202ENST00000460160 PIK3C2BO00750 1634 aa36.1■■■■□ 3.37
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
HOXB3-202ENST00000460160 NOS1P29475 1434 aa36.09■■■■□ 3.37
HOXB3-202ENST00000460160 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.08■■■■□ 3.37
HOXB3-202ENST00000460160 MED14O60244 1454 aa36.08■■■■□ 3.37
HOXB3-202ENST00000460160 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
HOXB3-202ENST00000460160 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.05■■■■□ 3.36
HOXB3-202ENST00000460160 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
HOXB3-202ENST00000460160 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
HOXB3-202ENST00000460160 IQGAP1P46940 1657 aa36.02■■■■□ 3.36
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.02■■■■□ 3.36
HOXB3-202ENST00000460160 SLIT1O75093 1534 aa36.01■■■■□ 3.36
HOXB3-202ENST00000460160 IDI1Q13907 227 aa36.01■■■■□ 3.36
HOXB3-202ENST00000460160 E9PCH4 1651 aa35.99■■■■□ 3.35
HOXB3-202ENST00000460160 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.98■■■■□ 3.35
HOXB3-202ENST00000460160 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
HOXB3-202ENST00000460160 NUP155O75694 1391 aa35.96■■■■□ 3.35
HOXB3-202ENST00000460160 LTKP29376 864 aa35.93■■■■□ 3.34
HOXB3-202ENST00000460160 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.93■■■■□ 3.34
HOXB3-202ENST00000460160 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.93■■■■□ 3.34
HOXB3-202ENST00000460160 NAIPQ13075 1403 aa35.93■■■■□ 3.34
HOXB3-202ENST00000460160 ADGRB3O60242 1522 aa35.93■■■■□ 3.34
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.93■■■■□ 3.34
HOXB3-202ENST00000460160 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXB3-202ENST00000460160 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.85■■■■□ 3.33
HOXB3-202ENST00000460160 EID1Q9Y6B2 187 aa35.85■■■■□ 3.33
HOXB3-202ENST00000460160 CPS1P31327 1500 aa35.85■■■■□ 3.33
HOXB3-202ENST00000460160 HFM1A2PYH4 1435 aa35.83■■■■□ 3.33
HOXB3-202ENST00000460160 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.8■■■■□ 3.32
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.8■■■■□ 3.32
HOXB3-202ENST00000460160 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.73■■■■□ 3.31
HOXB3-202ENST00000460160 ZFYVE9O95405 1425 aa35.72■■■■□ 3.31
HOXB3-202ENST00000460160 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.67■■■■□ 3.3
HOXB3-202ENST00000460160 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.67■■■■□ 3.3
HOXB3-202ENST00000460160 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.64■■■■□ 3.3
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM52Q96A61 297 aa35.62■■■■□ 3.29
HOXB3-202ENST00000460160 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.59■■■■□ 3.29
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